• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

群体遗传学中赖特-费希尔模型的数学结构介绍。

An introduction to the mathematical structure of the Wright-Fisher model of population genetics.

作者信息

Tran Tat Dat, Hofrichter Julian, Jost Jürgen

机构信息

Max Planck Institute for Mathematics in the Sciences, 04103 Leipzig, Germany.

出版信息

Theory Biosci. 2013 Jun;132(2):73-82. doi: 10.1007/s12064-012-0170-3. Epub 2012 Dec 14.

DOI:10.1007/s12064-012-0170-3
PMID:23239077
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4269093/
Abstract

In this paper, we develop the mathematical structure of the Wright-Fisher model for evolution of the relative frequencies of two alleles at a diploid locus under random genetic drift in a population of fixed size in its simplest form, that is, without mutation or selection. We establish a new concept of a global solution for the diffusion approximation (Fokker-Planck equation), prove its existence and uniqueness and then show how one can easily derive all the essential properties of this random genetic drift process from our solution. Thus, our solution turns out to be superior to the local solution constructed by Kimura.

摘要

在本文中,我们以最简单的形式(即无突变或选择),在固定大小种群的随机遗传漂变下,推导了二倍体基因座上两个等位基因相对频率演化的赖特 - 费希尔模型的数学结构。我们为扩散近似(福克 - 普朗克方程)建立了全局解的新概念,证明了其存在性和唯一性,然后展示了如何从我们的解中轻松推导出这个随机遗传漂变过程的所有基本性质。因此,我们的解比木村构建的局部解更优越。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b206/4269093/f03e853917a5/12064_2012_170_Fig6_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b206/4269093/7c01173ff632/12064_2012_170_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b206/4269093/c69bc47b9dd2/12064_2012_170_Fig2_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b206/4269093/b60914c63ab9/12064_2012_170_Fig3_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b206/4269093/b0c564314fbc/12064_2012_170_Fig4_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b206/4269093/0262c6e7cff2/12064_2012_170_Fig5_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b206/4269093/f03e853917a5/12064_2012_170_Fig6_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b206/4269093/7c01173ff632/12064_2012_170_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b206/4269093/c69bc47b9dd2/12064_2012_170_Fig2_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b206/4269093/b60914c63ab9/12064_2012_170_Fig3_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b206/4269093/b0c564314fbc/12064_2012_170_Fig4_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b206/4269093/0262c6e7cff2/12064_2012_170_Fig5_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b206/4269093/f03e853917a5/12064_2012_170_Fig6_HTML.jpg

相似文献

1
An introduction to the mathematical structure of the Wright-Fisher model of population genetics.群体遗传学中赖特-费希尔模型的数学结构介绍。
Theory Biosci. 2013 Jun;132(2):73-82. doi: 10.1007/s12064-012-0170-3. Epub 2012 Dec 14.
2
The free energy method and the Wright-Fisher model with 2 alleles.自由能方法与具有两个等位基因的赖特-费希尔模型。
Theory Biosci. 2015 Dec;134(3-4):83-92. doi: 10.1007/s12064-015-0218-2. Epub 2015 Nov 20.
3
Comparison and content of the Wright-Fisher model of random genetic drift, the diffusion approximation, and an intermediate model.随机遗传漂变的 Wright-Fisher 模型、扩散逼近和中间模型的比较和内容。
J Theor Biol. 2011 Jan 21;269(1):79-87. doi: 10.1016/j.jtbi.2010.10.014. Epub 2010 Oct 19.
4
Inference from the stationary distribution of allele frequencies in a family of Wright-Fisher models with two levels of genetic variability.从具有两级遗传变异性的赖特-费希尔模型家族中等位基因频率的平稳分布进行推断。
Theor Popul Biol. 2018 Jul;122:78-87. doi: 10.1016/j.tpb.2018.03.004. Epub 2018 Mar 21.
5
Wright-Fisher diffusion bridges.赖特-费希尔扩散桥
Theor Popul Biol. 2018 Jul;122:67-77. doi: 10.1016/j.tpb.2017.09.005. Epub 2017 Oct 6.
6
Fixation at a locus with multiple alleles: Structure and solution of the Wright Fisher model.多位点等位基因的固定:赖特-费舍尔模型的结构与求解
J Theor Biol. 2009 Mar 21;257(2):245-51. doi: 10.1016/j.jtbi.2008.11.025. Epub 2008 Dec 6.
7
A dual process for the coupled Wright-Fisher diffusion.耦合赖特-费希尔扩散的双重过程。
J Math Biol. 2021 Jan 22;82(1-2):6. doi: 10.1007/s00285-021-01555-9.
8
Exact simulation of conditioned Wright-Fisher models.条件Wright-Fisher模型的精确模拟。
J Theor Biol. 2014 Dec 21;363:419-26. doi: 10.1016/j.jtbi.2014.08.027. Epub 2014 Aug 28.
9
Information encoded in gene-frequency trajectories.基因频率轨迹中编码的信息。
Biosystems. 2023 Sep;231:104982. doi: 10.1016/j.biosystems.2023.104982. Epub 2023 Jul 23.
10
Complete numerical solution of the diffusion equation of random genetic drift.随机遗传漂变扩散方程的完全数值解。
Genetics. 2013 Aug;194(4):973-85. doi: 10.1534/genetics.113.152017. Epub 2013 Jun 7.

引用本文的文献

1
Microevolutionary change in wild stickleback: Using integrative time-series data to infer responses to selection.野生刺鱼的微进化变化:利用综合时间序列数据推断对选择的反应。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Sep 10;121(37):e2410324121. doi: 10.1073/pnas.2410324121. Epub 2024 Sep 4.
2
NIPT-PG: empowering non-invasive prenatal testing to learn from population genomics through an incremental pan-genomic approach.NIPT-PG:通过渐进式泛基因组方法,赋予无创产前检测从人群基因组学中学习的能力。
Brief Bioinform. 2024 May 23;25(4). doi: 10.1093/bib/bbae266.
3
Shibboleth: An agent-based model of signalling mimicry.

本文引用的文献

1
Evolution in Mendelian Populations.孟德尔群体中的进化。
Genetics. 1931 Mar;16(2):97-159. doi: 10.1093/genetics/16.2.97.
2
SOLUTION OF A PROCESS OF RANDOM GENETIC DRIFT WITH A CONTINUOUS MODEL.基于连续模型的随机遗传漂变过程的解决方案。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1955 Mar 15;41(3):144-50. doi: 10.1073/pnas.41.3.144.
3
The Differential Equation of the Distribution of Gene Frequencies.基因频率分布的微分方程。
希波克拉底誓言:一种基于代理的信号模仿模型。
PLoS One. 2023 Jul 31;18(7):e0289333. doi: 10.1371/journal.pone.0289333. eCollection 2023.
4
Machine learning optimization of candidate antibody yields highly diverse sub-nanomolar affinity antibody libraries.机器学习优化候选抗体产量,得到高度多样化的亚纳摩尔亲和力抗体文库。
Nat Commun. 2023 Jun 12;14(1):3454. doi: 10.1038/s41467-023-39022-2.
5
A stochastic differential game approach toward animal migration.一种用于动物迁徙的随机微分博弈方法。
Theory Biosci. 2019 Nov;138(2):277-303. doi: 10.1007/s12064-019-00292-4. Epub 2019 Apr 11.
6
Opinion formation on dynamic networks: identifying conditions for the emergence of partisan echo chambers.动态网络上的观点形成:确定党派回声室出现的条件。
R Soc Open Sci. 2018 Oct 24;5(10):181122. doi: 10.1098/rsos.181122. eCollection 2018 Oct.
7
An optimal stopping approach for onset of fish migration.鱼类洄游开始的一种最优停止方法。
Theory Biosci. 2018 Nov;137(2):99-116. doi: 10.1007/s12064-018-0263-8. Epub 2018 May 2.
8
Simulations indicate that scores of lionfish () colonized the Atlantic Ocean.模拟结果表明,大量狮子鱼()在大西洋定居。 (注:原文括号内内容缺失,翻译时保留原样)
PeerJ. 2017 Dec 19;5:e3996. doi: 10.7717/peerj.3996. eCollection 2017.
9
The free energy method and the Wright-Fisher model with 2 alleles.自由能方法与具有两个等位基因的赖特-费希尔模型。
Theory Biosci. 2015 Dec;134(3-4):83-92. doi: 10.1007/s12064-015-0218-2. Epub 2015 Nov 20.
10
Inferring population structure and relationship using minimal independent evolutionary markers in Y-chromosome: a hybrid approach of recursive feature selection for hierarchical clustering.利用Y染色体中最小数量的独立进化标记推断群体结构和关系:一种用于层次聚类的递归特征选择混合方法。
Nucleic Acids Res. 2014 Sep;42(15):e122. doi: 10.1093/nar/gku585. Epub 2014 Jul 16.
Proc Natl Acad Sci U S A. 1945 Dec;31(12):382-9. doi: 10.1073/pnas.31.12.382.