• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

使用二维条码的生物数据动态数据驱动框架。

A dynamic data-driven framework for biological data using 2D barcodes.

机构信息

Department of Systems and Computer Science, Howard University, Washington, DC 20059, USA.

出版信息

Comput Math Methods Med. 2012;2012:892098. doi: 10.1155/2012/892098. Epub 2012 Dec 9.

DOI:10.1155/2012/892098
PMID:23304237
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3523545/
Abstract

Biology data is increasing exponentially from biological laboratories. It is a complicated problem for further processing the data. Processing computational data and data from biological laboratories manually may lead to potential errors in further analysis. In this paper, we proposed an efficient data-driven framework to inspect laboratory equipment and reduce impending failures. Our method takes advantage of the 2D barcode technology which can be installed on the specimen as a trigger for the data-driven system. For this end, we proposed a series of algorithms to speed up the data processing. The results show that the proposed system increases the system's scalability and flexibility. Also, it demonstrates the ability of linking a physical object with digital information to reduce the manual work related to experimental specimen. The characteristics such as high capacity of storage and data management of the 2D barcode technology provide a solution to collect experimental laboratory data in a quick and accurate fashion.

摘要

生物实验室产生的数据呈指数级增长。这些数据的进一步处理是一个复杂的问题。手动处理计算数据和生物实验室数据可能会导致进一步分析中的潜在错误。在本文中,我们提出了一种高效的数据驱动框架来检查实验室设备并减少潜在故障。我们的方法利用了可以安装在标本上的二维条码技术,作为数据驱动系统的触发器。为此,我们提出了一系列算法来加速数据处理。结果表明,所提出的系统提高了系统的可扩展性和灵活性。此外,它还展示了将物理对象与数字信息联系起来的能力,从而减少了与实验标本相关的手动工作。二维条码技术的高存储容量和数据管理等特点为快速、准确地收集实验实验室数据提供了一种解决方案。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4c7e/3523545/e7287e2f7913/CMMM2012-892098.alg.002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4c7e/3523545/270d24e317db/CMMM2012-892098.001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4c7e/3523545/fd8afac90aa1/CMMM2012-892098.002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4c7e/3523545/a4d94a4bc65d/CMMM2012-892098.alg.001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4c7e/3523545/e7287e2f7913/CMMM2012-892098.alg.002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4c7e/3523545/270d24e317db/CMMM2012-892098.001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4c7e/3523545/fd8afac90aa1/CMMM2012-892098.002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4c7e/3523545/a4d94a4bc65d/CMMM2012-892098.alg.001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4c7e/3523545/e7287e2f7913/CMMM2012-892098.alg.002.jpg

相似文献

1
A dynamic data-driven framework for biological data using 2D barcodes.使用二维条码的生物数据动态数据驱动框架。
Comput Math Methods Med. 2012;2012:892098. doi: 10.1155/2012/892098. Epub 2012 Dec 9.
2
Automatic analysis of composite physical signals using non-negative factorization and information criterion.使用非负分解和信息准则对复合物理信号进行自动分析。
PLoS One. 2012;7(3):e32352. doi: 10.1371/journal.pone.0032352. Epub 2012 Mar 1.
3
A fast, angle-dependent, analytical model of CsI detector response for optimization of 3D x-ray breast imaging systems.一种用于优化 3D 乳腺 X 射线成像系统的 CsI 探测器响应的快速、角度相关的解析模型。
Med Phys. 2010 Jun;37(6):2593-605. doi: 10.1118/1.3397462.
4
A greedy algorithm for supervised discretization.一种用于监督离散化的贪心算法。
J Biomed Inform. 2004 Aug;37(4):285-92. doi: 10.1016/j.jbi.2004.07.006.
5
Group-representative functional network estimation from multi-subject fMRI data via MRF-based image segmentation.基于马尔可夫随机场图像分割的多体素 fMRI 数据的群组代表性功能网络估计。
Comput Methods Programs Biomed. 2019 Oct;179:104976. doi: 10.1016/j.cmpb.2019.07.004. Epub 2019 Jul 19.
6
Wavelets in bioinformatics and computational biology: state of art and perspectives.生物信息学与计算生物学中的小波:现状与展望
Bioinformatics. 2003 Jan;19(1):2-9. doi: 10.1093/bioinformatics/19.1.2.
7
An active particle-based tracking framework for 2D and 3D time-lapse microscopy images.一种用于二维和三维延时显微镜图像的基于活性粒子的跟踪框架。
Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2011;2011:6613-8. doi: 10.1109/IEMBS.2011.6091631.
8
A comparative approach for the investigation of biological information processing: an examination of the structure and function of computer hard drives and DNA.一种用于研究生物信息处理的比较方法:对计算机硬盘和DNA的结构与功能的考察。
Theor Biol Med Model. 2010 Jan 21;7:3. doi: 10.1186/1742-4682-7-3.
9
Iterative multimodel subimage binarization for handwritten character segmentation.用于手写字符分割的迭代多模型子图像二值化
IEEE Trans Image Process. 2004 Sep;13(9):1223-30. doi: 10.1109/tip.2004.833101.
10
Data mining in medical time series.医学时间序列中的数据挖掘
Biomed Tech (Berl). 2006 Dec;51(5-6):288-93. doi: 10.1515/BMT.2006.059.

本文引用的文献

1
Exploratory Dijkstra forest based automatic vessel segmentation: applications in video indirect ophthalmoscopy (VIO).基于探索性迪杰斯特拉森林的自动血管分割:在视频间接检眼镜检查(VIO)中的应用。
Biomed Opt Express. 2012 Feb 1;3(2):327-39. doi: 10.1364/BOE.3.000327. Epub 2012 Jan 18.
2
Data analysis and bioinformatics tools for tandem mass spectrometry in proteomics.蛋白质组学中串联质谱的数据分析与生物信息学工具
Physiol Genomics. 2008 Mar 14;33(1):18-25. doi: 10.1152/physiolgenomics.00298.2007. Epub 2008 Jan 22.
3
Accurate annotation of peptide modifications through unrestrictive database search.
通过无限制数据库搜索对肽修饰进行准确注释。
J Proteome Res. 2008 Jan;7(1):170-81. doi: 10.1021/pr070444v. Epub 2007 Nov 23.
4
Data growth and its impact on the SCOP database: new developments.数据增长及其对SCOP数据库的影响:新进展
Nucleic Acids Res. 2008 Jan;36(Database issue):D419-25. doi: 10.1093/nar/gkm993. Epub 2007 Nov 13.