• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

真核生物 GPN 环 GTP 酶的同源物使用类似于古菌 GPN 的二聚体组装。

Eukaryotic GPN-loop GTPases paralogs use a dimeric assembly reminiscent of archeal GPN.

机构信息

CEA, iBEB, Service de Biochimie et Toxicologie Nucléaire/LBSP, Bagnols-sur-Cèze, France.

出版信息

Cell Cycle. 2013 Feb 1;12(3):463-72. doi: 10.4161/cc.23367. Epub 2013 Jan 16.

DOI:10.4161/cc.23367
PMID:23324351
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3587447/
Abstract

GTPases are molecular switches that regulate a wide-range of cellular processes. The GPN-loop GTPase (GPN) is a sub-family of P-loop NTPase that evolved from a single gene copy in archaea to triplicate paralog genes in eukaryotes, each having a non-redundant essential function in cell. In Saccharomyces cerevisiae, yGPN1 and yGPN2 are involved in sister chromatid cohesion mechanism, whereas nothing is known regarding yGPN3 function. Previous high-throughput experiments suggested that GPN paralogs interaction may occur. In this work, GPN|GPN contact was analyzed in details using TAP-Tag approach, yeast two-hybrid assay, in silico energy computation and site-directed mutagenesis of a conserved Glu residue located at the center of the interaction interface. It is demonstrated that this residue is essential for cell viability. A chromatid cohesion assay revealed that, like yGPN1 and yGPN2, yGPN3 also plays a role in sister chromatid cohesion. These results suggest that all three GPN proteins act at the molecular level in sister chromatid cohesion mechanism as a GPN|GPN complex reminiscent of the homodimeric structure of PAB0955, an archaeal member of GPN-loop GTPase.

摘要

GTPases 是一类分子开关,调节着广泛的细胞过程。GPN 环 GTPase(GPN)是 P 环 NTPase 的一个亚家族,从古菌中的单个基因拷贝进化而来,在真核生物中则有三个重复的基因,每个基因都具有细胞中不可或缺的功能。在酿酒酵母中,yGPN1 和 yGPN2 参与姐妹染色单体的凝聚机制,而 yGPN3 的功能则未知。先前的高通量实验表明,GPN 基因家族成员之间可能存在相互作用。在这项工作中,我们使用 TAP-Tag 方法、酵母双杂交实验、计算机能量计算和位于相互作用界面中心的保守 Glu 残基的定点突变,详细分析了 GPN|GPN 接触。结果表明,该残基对细胞活力至关重要。染色单体凝聚实验表明,yGPN3 与 yGPN1 和 yGPN2 一样,在姐妹染色单体凝聚中也发挥作用。这些结果表明,所有三种 GPN 蛋白在姐妹染色单体凝聚机制中作为 GPN|GPN 复合物发挥作用,类似于 PAB0955 的同源二聚体结构,PAB0955 是 GPN 环 GTPase 的古菌成员。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6305/3587447/7edcded38f78/cc-12-463-g4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6305/3587447/02ff49f14ab3/cc-12-463-g1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6305/3587447/5503ec8bc925/cc-12-463-g2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6305/3587447/1319cf1d93cb/cc-12-463-g3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6305/3587447/7edcded38f78/cc-12-463-g4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6305/3587447/02ff49f14ab3/cc-12-463-g1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6305/3587447/5503ec8bc925/cc-12-463-g2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6305/3587447/1319cf1d93cb/cc-12-463-g3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6305/3587447/7edcded38f78/cc-12-463-g4.jpg

相似文献

1
Eukaryotic GPN-loop GTPases paralogs use a dimeric assembly reminiscent of archeal GPN.真核生物 GPN 环 GTP 酶的同源物使用类似于古菌 GPN 的二聚体组装。
Cell Cycle. 2013 Feb 1;12(3):463-72. doi: 10.4161/cc.23367. Epub 2013 Jan 16.
2
A role for GPN-loop GTPase yGPN1 in sister chromatid cohesion.GPN 环 GTP 酶 yGPN1 在姐妹染色单体黏合中的作用。
Cell Cycle. 2011 Jun 1;10(11):1828-37. doi: 10.4161/cc.10.11.15763.
3
Npa3 interacts with Gpn3 and assembly factor Rba50 for RNA polymerase II biogenesis.Npa3与Gpn3以及装配因子Rba50相互作用,参与RNA聚合酶II的生物合成。
FASEB J. 2020 Nov;34(11):15547-15558. doi: 10.1096/fj.202001523R. Epub 2020 Sep 28.
4
FRET-based analysis and molecular modeling of the human GPN-loop GTPases 1 and 3 heterodimer unveils a dominant-negative protein complex.基于荧光共振能量转移的人 GPN 环 GTP 酶 1 和 3 异源二聚体分析和分子建模揭示了一种显性负性蛋白复合物。
FEBS J. 2019 Dec;286(23):4797-4818. doi: 10.1111/febs.14996. Epub 2019 Jul 22.
5
Saccharomyces cerevisiae DNA polymerase epsilon and polymerase sigma interact physically and functionally, suggesting a role for polymerase epsilon in sister chromatid cohesion.酿酒酵母DNA聚合酶ε与聚合酶σ在物理和功能上相互作用,这表明聚合酶ε在姐妹染色单体黏附中发挥作用。
Mol Cell Biol. 2003 Apr;23(8):2733-48. doi: 10.1128/MCB.23.8.2733-2748.2003.
6
Structure of GPN-Loop GTPase Npa3 and Implications for RNA Polymerase II Assembly.GPN 环 GTP 酶 Npa3 的结构及其对 RNA 聚合酶 II 组装的影响。
Mol Cell Biol. 2015 Dec 28;36(5):820-31. doi: 10.1128/MCB.01009-15.
7
Synthetic negative genome screen of the GPN-loop GTPase NPA3 in Saccharomyces cerevisiae.酿酒酵母 GPN 环 GTP 酶 NPA3 的合成阴性基因组筛选。
Curr Genet. 2022 Aug;68(3-4):343-360. doi: 10.1007/s00294-022-01243-1. Epub 2022 Jun 4.
8
Biogenesis of RNA polymerases II and III requires the conserved GPN small GTPases in Saccharomyces cerevisiae.RNA 聚合酶 II 和 III 的生物发生需要酿酒酵母中保守的 GPN 小 GTPases。
Genetics. 2013 Mar;193(3):853-64. doi: 10.1534/genetics.112.148726. Epub 2012 Dec 24.
9
Hsp90 Is Essential for Chl1-Mediated Chromosome Segregation and Sister Chromatid Cohesion.Hsp90 对于 Chl1 介导的染色体分离和姐妹染色单体黏合是必需的。
mSphere. 2018 Jun 6;3(3). doi: 10.1128/mSphere.00225-18. Print 2018 Jun 27.
10
Translation initiation factor eIF1A rescues hygromycin B sensitivity caused by deleting the carboxy-terminal tail in the GPN-loop GTPase Npa3.翻译起始因子 eIF1A 挽救了删除 GPN 环 GTP 酶 Npa3 的羧基末端尾巴引起的 Hygromycin B 敏感性。
FEBS J. 2024 May;291(10):2191-2208. doi: 10.1111/febs.17106. Epub 2024 Mar 2.

引用本文的文献

1
Synthetic negative genome screen of the GPN-loop GTPase NPA3 in Saccharomyces cerevisiae.酿酒酵母 GPN 环 GTP 酶 NPA3 的合成阴性基因组筛选。
Curr Genet. 2022 Aug;68(3-4):343-360. doi: 10.1007/s00294-022-01243-1. Epub 2022 Jun 4.
2
A nuclear proteome localization screen reveals the exquisite specificity of Gpn2 in RNA polymerase biogenesis.核蛋白组定位筛选揭示了 Gpn2 在 RNA 聚合酶生物发生中的精细特异性。
Cell Cycle. 2021 Jul;20(14):1361-1373. doi: 10.1080/15384101.2021.1943879. Epub 2021 Jun 28.
3
Biogenesis of RNA Polymerases in Yeast.

本文引用的文献

1
All-atom empirical potential for molecular modeling and dynamics studies of proteins.蛋白质分子建模和动力学研究的全原子经验势。
J Phys Chem B. 1998 Apr 30;102(18):3586-616. doi: 10.1021/jp973084f.
2
Cohesin: a catenase with separate entry and exit gates?黏连蛋白:具有独立进入和退出通道的连接酶?
Nat Cell Biol. 2011 Oct 3;13(10):1170-7. doi: 10.1038/ncb2349.
3
GTP-dependent binding and nuclear transport of RNA polymerase II by Npa3 protein.Npa3 蛋白对 RNA 聚合酶 II 的 GTP 依赖性结合和核转运。
酵母中RNA聚合酶的生物合成
Front Mol Biosci. 2021 Apr 28;8:669300. doi: 10.3389/fmolb.2021.669300. eCollection 2021.
4
The Phosphatase PP2A Interacts With ArnA and ArnB to Regulate the Oligomeric State and the Stability of the ArnA/B Complex.磷酸酶PP2A与ArnA和ArnB相互作用,以调节ArnA/B复合物的寡聚状态和稳定性。
Front Microbiol. 2020 Aug 21;11:1849. doi: 10.3389/fmicb.2020.01849. eCollection 2020.
5
Gpn3 Is Essential for Cell Proliferation of Breast Cancer Cells Independent of Their Malignancy Degree.Gpn3 对乳腺癌细胞的增殖是必需的,而与它们的恶性程度无关。
Technol Cancer Res Treat. 2019 Jan 1;18:1533033819870823. doi: 10.1177/1533033819870823.
6
Gpn2 and Rba50 Directly Participate in the Assembly of the Rpb3 Subcomplex in the Biogenesis of RNA Polymerase II.Gpn2 和 Rba50 直接参与 RNA 聚合酶 II 生物发生中 Rpb3 亚基复合物的组装。
Mol Cell Biol. 2018 Jun 14;38(13). doi: 10.1128/MCB.00091-18. Print 2018 Jul 1.
7
Structure of GPN-Loop GTPase Npa3 and Implications for RNA Polymerase II Assembly.GPN 环 GTP 酶 Npa3 的结构及其对 RNA 聚合酶 II 组装的影响。
Mol Cell Biol. 2015 Dec 28;36(5):820-31. doi: 10.1128/MCB.01009-15.
8
A multi-host approach for the systematic analysis of virulence factors in Cryptococcus neoformans.一种用于系统性分析新型隐球菌毒力因子的多宿主方法。
J Infect Dis. 2015 Jan 15;211(2):298-305. doi: 10.1093/infdis/jiu441. Epub 2014 Aug 11.
9
The interactome of the atypical phosphatase Rtr1 in Saccharomyces cerevisiae.酿酒酵母中非典型磷酸酶Rtr1的相互作用组。
Mol Biosyst. 2014 Jul;10(7):1730-41. doi: 10.1039/c4mb00109e.
J Biol Chem. 2011 Oct 14;286(41):35553-35561. doi: 10.1074/jbc.M111.286161. Epub 2011 Aug 15.
4
Parcs/Gpn3 is required for the nuclear accumulation of RNA polymerase II.RNA聚合酶II的核内积累需要Parcs/Gpn3。
Biochim Biophys Acta. 2011 Oct;1813(10):1708-16. doi: 10.1016/j.bbamcr.2011.07.005. Epub 2011 Jul 18.
5
Human GTPases associate with RNA polymerase II to mediate its nuclear import.人类 GTPases 与 RNA 聚合酶 II 结合以介导其核输入。
Mol Cell Biol. 2011 Oct;31(19):3953-62. doi: 10.1128/MCB.05442-11. Epub 2011 Jul 18.
6
Functional mapping of factor VIII C2 domain.VIII 因子 C2 结构域的功能图谱。
Thromb Haemost. 2011 Jul;106(1):121-31. doi: 10.1160/TH10-09-0572. Epub 2011 May 26.
7
A role for GPN-loop GTPase yGPN1 in sister chromatid cohesion.GPN 环 GTP 酶 yGPN1 在姐妹染色单体黏合中的作用。
Cell Cycle. 2011 Jun 1;10(11):1828-37. doi: 10.4161/cc.10.11.15763.
8
Cohesin loading and sliding.黏连蛋白加载和滑动。
J Cell Sci. 2011 Mar 1;124(Pt 5):685-91. doi: 10.1242/jcs.073866.
9
Determination of the structure of the MinD-ATP complex reveals the orientation of MinD on the membrane and the relative location of the binding sites for MinE and MinC.确定 MinD-ATP 复合物的结构揭示了 MinD 在膜上的取向以及 MinE 和 MinC 结合位点的相对位置。
Mol Microbiol. 2011 Mar;79(6):1515-28. doi: 10.1111/j.1365-2958.2010.07536.x. Epub 2011 Jan 24.
10
Gene regulation: the cohesin ring connects developmental highways.基因调控:黏合蛋白环连接发育高速公路。
Curr Biol. 2010 Oct 26;20(20):R886-8. doi: 10.1016/j.cub.2010.09.036.