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pCGR2 的拷贝数取决于形成谷氨酸棒杆菌 ParC-ParB-DNA 分区复合物的 par 基因座。

pCGR2 copy number depends on the par locus that forms a ParC-ParB-DNA partition complex in Corynebacterium glutamicum.

机构信息

Research Institute of Innovative Technology for the Earth, Kizugawa, Kyoto, Japan.

出版信息

J Appl Microbiol. 2013 Aug;115(2):495-508. doi: 10.1111/jam.12257. Epub 2013 Jun 7.

DOI:10.1111/jam.12257
PMID:23683072
Abstract

AIMS

To characterize the par system of Corynebacterium glutamicum pCGR2 and to manipulate the par components to effectively manipulate plasmid copy number.

METHODS AND RESULTS

ParB binds sequence specifically to centromere-binding sites around the parAB operon and serves as an autorepressor. A small ORF (orf4, later named parC) downstream of parAB encodes a protein with 23.7% sequence identity with ParB. ParB is also implicated in the repression of parC transcription. Nonetheless, this ParC protein does not bind to centromere-binding sites and is not essential for plasmid stability. Introduction of a frameshift mutation within ParC implicated the protein in regulation of both parAB and parC. Electrophoretic Mobility Shift Assay confirmed a previously unreported ParC-ParB-parS partition complex. ParC also interacts directly with ParB without the mediation of the centromere sites. Deletion of the par components resulted in different plasmid copy numbers.

CONCLUSIONS

A previously unreported ParC-ParB-parS partition complex is formed in pCGR2, where interaction of ParC with ParB-parS may affect the level of repression by ParB. Modifying the par components and antisense RNA enables manipulation of plasmid copy number to varying degrees.

SIGNIFICANCE AND IMPACT OF STUDY

Genetically manipulating the par components, in combination with deactivation of antisense RNA, is a novel approach to artificially elevate plasmid copy number. This approach can be applied for development of new genetic engineering tools.

摘要

目的

研究谷氨酸棒杆菌 pCGR2 的 par 系统,并操纵 par 元件以有效操纵质粒拷贝数。

方法与结果

ParB 特异性结合 parAB 操纵子周围的着丝粒结合位点,作为自阻遏物。parAB 下游的一个小 ORF(orf4,后来命名为 parC)编码一种与 ParB 具有 23.7%序列同一性的蛋白质。ParB 还参与了 parC 转录的抑制。然而,这种 ParC 蛋白不与着丝粒结合位点结合,对质粒稳定性不是必需的。在 ParC 中引入移码突变表明该蛋白参与了 parAB 和 parC 的调节。电泳迁移率变动分析证实了以前未报道的 ParC-ParB-parS 分区复合物。ParC 还可以直接与 ParB 相互作用,而无需着丝粒位点的介导。par 元件的缺失导致质粒拷贝数不同。

结论

在 pCGR2 中形成了以前未报道的 ParC-ParB-parS 分区复合物,其中 ParC 与 ParB-parS 的相互作用可能影响 ParB 的抑制水平。修饰 par 元件和反义 RNA 可以在不同程度上操纵质粒拷贝数。

意义和影响的研究

遗传操纵 par 元件,结合反义 RNA 的失活,是人为提高质粒拷贝数的一种新方法。这种方法可用于开发新的遗传工程工具。

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