• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

Sac7d 通过逐步方式结合和弯曲 DNA。

DNA binding and bending by Sac7d is stepwise.

机构信息

Department of Chemistry, University of South Florida, 4202 E. Fowler Ave. CHE 205, Tampa, FL 33620, USA.

出版信息

Chembiochem. 2013 Aug 19;14(12):1434-7. doi: 10.1002/cbic.201300264. Epub 2013 Jul 12.

DOI:10.1002/cbic.201300264
PMID:23853062
Abstract

Which came first? Using thermodynamic cycles constructed from experimental measures of the binding free energy and free energy simulations, we have shown that binding of Sulfolobus acidocaldarius protein Sac7d to DNA occurs before DNA bending, thus indicating that a conformational selection mechanism is unlikely to be operative in Sac7d binding.

摘要

我们利用从结合自由能的实验测量和自由能模拟中构建的热力学循环表明,嗜热嗜酸古菌蛋白 Sac7d 与 DNA 的结合发生在 DNA 弯曲之前,因此表明构象选择机制不太可能在 Sac7d 结合中起作用。

相似文献

1
DNA binding and bending by Sac7d is stepwise.Sac7d 通过逐步方式结合和弯曲 DNA。
Chembiochem. 2013 Aug 19;14(12):1434-7. doi: 10.1002/cbic.201300264. Epub 2013 Jul 12.
2
Equilibrium DNA binding of Sac7d protein from the hyperthermophile Sulfolobus acidocaldarius: fluorescence and circular dichroism studies.嗜热嗜酸硫化叶菌Sac7d蛋白的平衡DNA结合:荧光和圆二色性研究
Biochemistry. 1996 Apr 2;35(13):4034-45. doi: 10.1021/bi952555q.
3
Thermodynamics of DNA binding and distortion by the hyperthermophile chromatin protein Sac7d.嗜热超嗜热菌染色质蛋白Sac7d与DNA结合及使其变形的热力学
J Mol Biol. 2004 Oct 15;343(2):339-60. doi: 10.1016/j.jmb.2004.08.042.
4
The hyperthermophile chromosomal protein Sac7d sharply kinks DNA.嗜热栖热菌染色体蛋白Sac7d会使DNA急剧扭结。
Nature. 1998 Mar 12;392(6672):202-5. doi: 10.1038/32455.
5
Effect of mutation of the Sac7d intercalating residues on the temperature dependence of DNA distortion and binding thermodynamics.Sac7d嵌入残基的突变对DNA扭曲的温度依赖性和结合热力学的影响。
Biochemistry. 2005 Mar 29;44(12):4794-804. doi: 10.1021/bi047382w.
6
Partial B-to-A DNA transition upon minor groove binding of protein Sac7d monitored by Raman spectroscopy.通过拉曼光谱监测蛋白质Sac7d小沟结合时的部分B型到A型DNA转变。
Biochemistry. 2004 Aug 3;43(30):9600-9. doi: 10.1021/bi049192r.
7
Molecular simulations on the thermal stabilization of DNA by hyperthermophilic chromatin protein Sac7d, and associated conformational transitions.热稳定蛋白 Sac7d 稳定 DNA 的分子模拟及其相关构象转变。
J Phys Chem B. 2010 Dec 16;114(49):16548-57. doi: 10.1021/jp101583d. Epub 2010 Nov 18.
8
Stability and flexibility in the structure of the hyperthermophile DNA-binding protein Sac7d.嗜热菌DNA结合蛋白Sac7d结构中的稳定性与灵活性
Biochemistry. 2005 Oct 18;44(41):13500-9. doi: 10.1021/bi051167d.
9
The solution structure of the Sac7d/DNA complex: a small-angle X-ray scattering study.Sac7d/DNA复合物的溶液结构:小角X射线散射研究
Biochemistry. 1999 Aug 10;38(32):10247-55. doi: 10.1021/bi990782c.
10
Crystal structures of the chromosomal proteins Sso7d/Sac7d bound to DNA containing T-G mismatched base-pairs.与含有T-G错配碱基对的DNA结合的染色体蛋白Sso7d/Sac7d的晶体结构。
J Mol Biol. 2000 Oct 27;303(3):395-403. doi: 10.1006/jmbi.2000.4112.

引用本文的文献

1
C-B-A Test of DNA Force Fields.DNA力场的C-B-A测试
ACS Omega. 2023 Mar 6;8(11):10253-10265. doi: 10.1021/acsomega.2c07781. eCollection 2023 Mar 21.
2
Evidence for a bind-then-bend mechanism for architectural DNA binding protein yNhp6A.有证据表明,构象DNA 结合蛋白 yNhp6A 采用结合-弯曲机制。
Nucleic Acids Res. 2019 Apr 8;47(6):2871-2883. doi: 10.1093/nar/gkz022.