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15N H/D-SOLEXSY experiment for accurate measurement of amide solvent exchange rates: application to denatured drkN SH3.15N H/D-SOLEXSY 实验用于准确测量酰胺溶剂交换速率:在变性 drkN SH3 中的应用。
J Biomol NMR. 2010 Mar;46(3):227-44. doi: 10.1007/s10858-010-9398-8. Epub 2010 Feb 27.

细胞提取物中环的酰胺质子交换。

Amide proton exchange of a dynamic loop in cell extracts.

机构信息

Department of Chemistry, University of North Carolina, Chapel Hill, North Carolina, 27599.

出版信息

Protein Sci. 2013 Oct;22(10):1313-9. doi: 10.1002/pro.2318. Epub 2013 Aug 20.

DOI:10.1002/pro.2318
PMID:23904228
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3795490/
Abstract

Intrinsic rates of exchange are essential parameters for obtaining protein stabilities from amide (1) H exchange data. To understand the influence of the intracellular environment on stability, one must know the effect of the cytoplasm on these rates. We probed exchange rates in buffer and in Escherichia coli lysates for the dynamic loop in the small globular protein chymotrypsin inhibitor 2 using a modified form of the nuclear magnetic resonance experiment, SOLEXSY. No significant changes were observed, even in 100 g dry weight L(-1) lysate. Our results suggest that intrinsic rates from studies conducted in buffers are applicable to studies conducted under cellular conditions.

摘要

固有交换率是从酰胺(1)H 交换数据中获得蛋白质稳定性的重要参数。为了了解细胞内环境对稳定性的影响,必须了解细胞质对这些速率的影响。我们使用改良的核磁共振实验 SOLEXSY,探测了在缓冲液中和大肠杆菌裂解物中小球状蛋白胰凝乳蛋白酶抑制剂 2 的动态环的交换速率。即使在 100 g 干重 L(-1)的裂解物中,也没有观察到明显的变化。我们的结果表明,在缓冲液中进行的研究中的固有速率可适用于细胞条件下进行的研究。