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Sup35pNM淀粉样核心的固态核磁共振序列归属

Solid-state NMR sequential assignments of the amyloid core of Sup35pNM.

作者信息

Luckgei Nina, Schütz Anne K, Habenstein Birgit, Bousset Luc, Sourigues Yannick, Melki Ronald, Meier Beat H, Böckmann Anja

机构信息

Institut de Biologie et Chimie des Protéines, UMR 5086 CNRS/Université de Lyon, 1, 7 passage du Vercors, 69367, Lyon, France.

出版信息

Biomol NMR Assign. 2014 Oct;8(2):365-70. doi: 10.1007/s12104-013-9518-y. Epub 2013 Aug 10.

DOI:10.1007/s12104-013-9518-y
PMID:23934139
Abstract

Sup35pNM represents the N-terminal and middle (M) domains of the yeast Saccharomyces cerevisiae prion Sup35p. This fragment is commonly used for structural and functional studies of Sup35p. We here present a solid-state NMR study of fibrils formed by this fragment and show that sequential assignments can be obtained for the rigid and well-ordered parts of the protein using 3D spectroscopy. We describe in detail the sequential assignment of the 22 residues yielding strong, narrow signals with chemical shifts that correspond mostly to β-sheet secondary-structured amino acids that form the fibril core.

摘要

Sup35pNM代表酿酒酵母朊病毒Sup35p的N端和中间(M)结构域。该片段常用于Sup35p的结构和功能研究。我们在此展示了对该片段形成的纤维进行的固态核磁共振研究,并表明使用三维光谱可以获得该蛋白质刚性且有序部分的序列归属。我们详细描述了22个残基的序列归属,这些残基产生强而窄的信号,其化学位移大多对应于形成纤维核心的β折叠二级结构氨基酸。

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