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产黑色素嗜极端微生物溶果胶嗜水气单胞菌亚种34melT的基因组序列

Genome Sequence of the Melanin-Producing Extremophile Aeromonas salmonicida subsp. pectinolytica Strain 34melT.

作者信息

Pavan M Elisa, Pavan Esteban E, López Nancy I, Levin Laura, Pettinari M Julia

机构信息

Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.

出版信息

Genome Announc. 2013 Sep 12;1(5):e00675-13. doi: 10.1128/genomeA.00675-13.

Abstract

The genome of Aeromonas salmonicida subsp. pectinolytica strain 34mel(T), isolated from a heavily polluted river, contains several genomic islands and putative virulence genes. The identification of genes involved in resistance to different kinds of stress sheds light on the mechanisms used by this strain to thrive in an extreme environment.

摘要

从一条严重污染的河流中分离出的嗜水气单胞菌果胶溶解亚种34mel(T)菌株的基因组包含几个基因组岛和假定的毒力基因。对参与抵抗不同类型应激的基因的鉴定,揭示了该菌株在极端环境中生存所使用的机制。

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本文引用的文献

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IslandViewer update: Improved genomic island discovery and visualization.IslandViewer 更新:改进了基因组岛的发现和可视化。
Nucleic Acids Res. 2013 Jul;41(Web Server issue):W129-32. doi: 10.1093/nar/gkt394. Epub 2013 May 15.

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