• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

检测植物中的组蛋白修饰。

Detecting histone modifications in plants.

作者信息

Song Jie, Rutjens Bas, Dean Caroline

机构信息

Cell & Developmental Biology, John Innes Centre, Imperial College London, London, SW7 2AZ, UK.

出版信息

Methods Mol Biol. 2014;1112:165-75. doi: 10.1007/978-1-62703-773-0_11.

DOI:10.1007/978-1-62703-773-0_11
PMID:24478014
Abstract

Histone modifications play an essential role in chromatin-associated processes including gene regulation and epigenetic inheritance. It is therefore very important to quantitatively analyze histone modifications at both the single gene and whole genome level. Here, we describe a robust chromatin immunoprecipitation (ChIP) method for Arabidopsis, which could be adapted for other plant species. This method is compatible with multiple downstream applications including qPCR, tilling arrays, and high-throughput sequencing.

摘要

组蛋白修饰在包括基因调控和表观遗传继承在内的与染色质相关的过程中起着至关重要的作用。因此,在单基因和全基因组水平上对组蛋白修饰进行定量分析非常重要。在这里,我们描述了一种适用于拟南芥的可靠的染色质免疫沉淀(ChIP)方法,该方法也可适用于其他植物物种。此方法与多种下游应用兼容,包括qPCR、耕作阵列和高通量测序。

相似文献

1
Detecting histone modifications in plants.检测植物中的组蛋白修饰。
Methods Mol Biol. 2014;1112:165-75. doi: 10.1007/978-1-62703-773-0_11.
2
Quantitatively profiling genome-wide patterns of histone modifications in Arabidopsis thaliana using ChIP-seq.利用染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)对拟南芥全基因组范围内的组蛋白修饰模式进行定量分析。
Methods Mol Biol. 2014;1112:177-93. doi: 10.1007/978-1-62703-773-0_12.
3
Chromatin immunoprecipitation protocol for histone modifications and protein-DNA binding analyses in Arabidopsis.拟南芥中用于组蛋白修饰和蛋白质-DNA结合分析的染色质免疫沉淀方案
Methods Mol Biol. 2010;631:209-20. doi: 10.1007/978-1-60761-646-7_15.
4
Chromatin Immunoprecipitation Protocol for Histone Modifications and Protein-DNA Binding Analyses in Arabidopsis.拟南芥中用于组蛋白修饰和蛋白质-DNA结合分析的染色质免疫沉淀方案
Methods Mol Biol. 2017;1456:1-13. doi: 10.1007/978-1-4899-7708-3_1.
5
An efficient chromatin immunoprecipitation (ChIP) protocol for studying histone modifications in Arabidopsis plants.一种用于研究拟南芥植株中组蛋白修饰的高效染色质免疫沉淀(ChIP)方案。
Nat Protoc. 2008;3(6):1018-25. doi: 10.1038/nprot.2008.66.
6
Sequential ChIP Protocol for Profiling Bivalent Epigenetic Modifications (ReChIP).用于分析二价表观遗传修饰的顺序染色质免疫沉淀实验方案(再免疫沉淀)
Methods Mol Biol. 2018;1675:83-97. doi: 10.1007/978-1-4939-7318-7_6.
7
A Rapid and Efficient ChIP Protocol to Profile Chromatin Binding Proteins and Epigenetic Modifications in Arabidopsis.一种用于分析拟南芥染色质结合蛋白和表观遗传修饰的快速高效染色质免疫沉淀(ChIP)方案。
Methods Mol Biol. 2018;1675:71-82. doi: 10.1007/978-1-4939-7318-7_5.
8
ChIP-seq analysis of histone modifications at the core of the Arabidopsis circadian clock.拟南芥生物钟核心区域组蛋白修饰的染色质免疫沉淀测序分析
Methods Mol Biol. 2014;1158:57-69. doi: 10.1007/978-1-4939-0700-7_4.
9
ChIP-Seq: A Powerful Tool for Studying Protein-DNA Interactions in Plants.ChIP-Seq:一种研究植物中蛋白质-DNA 相互作用的强大工具。
Curr Issues Mol Biol. 2018;27:171-180. doi: 10.21775/cimb.027.171. Epub 2017 Sep 8.
10
The Use of the Chromatin Immunoprecipitation Technique for In Vivo Identification of Plant Protein-DNA Interactions.利用染色质免疫沉淀技术在体内鉴定植物蛋白质-DNA相互作用
Methods Mol Biol. 2018;1794:323-334. doi: 10.1007/978-1-4939-7871-7_23.

引用本文的文献

1
H3K36 methylation stamps transcription resistive to preserve development in plants.H3K36甲基化标记转录抗性以维持植物发育。
Nat Plants. 2025 Apr;11(4):808-820. doi: 10.1038/s41477-025-01962-6. Epub 2025 Mar 31.
2
SISTER OF FCA physically associates with SKB1 to regulate flowering time in Arabidopsis thaliana.FCA 的姐妹蛋白 SKB1 与 SKB1 相互作用,共同调控拟南芥的开花时间。
BMC Plant Biol. 2024 Mar 15;24(1):188. doi: 10.1186/s12870-024-04887-y.
3
A VEL3 histone deacetylase complex establishes a maternal epigenetic state controlling progeny seed dormancy.
VEL3 组蛋白去乙酰化酶复合物建立了一种母系表观遗传状态,控制后代种子休眠。
Nat Commun. 2023 Apr 19;14(1):2220. doi: 10.1038/s41467-023-37805-1.
4
Tpc1 is an important Zn(II)2Cys6 transcriptional regulator required for polarized growth and virulence in the rice blast fungus.Tpc1是稻瘟病菌中极化生长和毒力所需的一种重要的Zn(II)2Cys6转录调节因子。
PLoS Pathog. 2017 Jul 24;13(7):e1006516. doi: 10.1371/journal.ppat.1006516. eCollection 2017 Jul.
5
The PLETHORA Gene Regulatory Network Guides Growth and Cell Differentiation in Arabidopsis Roots.多基因调控网络指导拟南芥根的生长和细胞分化。
Plant Cell. 2016 Dec;28(12):2937-2951. doi: 10.1105/tpc.16.00656. Epub 2016 Dec 5.
6
Delineation of metabolic gene clusters in plant genomes by chromatin signatures.通过染色质特征描绘植物基因组中的代谢基因簇。
Nucleic Acids Res. 2016 Mar 18;44(5):2255-65. doi: 10.1093/nar/gkw100. Epub 2016 Feb 18.
7
Regulation of metabolic gene clusters in Arabidopsis thaliana.拟南芥中代谢基因簇的调控
New Phytol. 2015 Jan;205(2):503-10. doi: 10.1111/nph.13189. Epub 2014 Nov 21.