• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

核磁共振技术在RNA-蛋白质复合物研究中的现状与未来:整合结构生物学视角

Present and future of NMR for RNA-protein complexes: a perspective of integrated structural biology.

作者信息

Carlomagno Teresa

机构信息

European Molecular Biology Laboratory, Structural and Computational Biology Unit, Meyerhofstrasse 1, D-69117 Heidelberg, Germany.

出版信息

J Magn Reson. 2014 Apr;241:126-36. doi: 10.1016/j.jmr.2013.10.007.

DOI:10.1016/j.jmr.2013.10.007
PMID:24656085
Abstract

Nucleic acids are gaining enormous importance as key molecules in almost all biological processes. Most nucleic acids do not act in isolation but are generally associated with proteins to form high-molecular-weight nucleoprotein complexes. In this perspective article I focus on the structural studies of supra-molecular ribonucleoprotein (RNP) assemblies in solution by a combination of state-of-the-art TROSY-based NMR experiments and other structural biology techniques. I discuss ways how to combine sparse NMR data with low-resolution structural information from small-angle scattering, fluorescence and electron paramagnetic resonance spectroscopy to obtain the structure of large RNP particles by an integrated structural biology approach. In the last section I give a perspective for the study of RNP complexes by solid-state NMR.

摘要

核酸作为几乎所有生物过程中的关键分子正变得极其重要。大多数核酸并非单独起作用,而是通常与蛋白质结合形成高分子量的核蛋白复合物。在这篇观点文章中,我重点介绍通过结合基于TROSY的先进核磁共振实验和其他结构生物学技术,对溶液中的超分子核糖核蛋白(RNP)组装体进行结构研究。我讨论了如何将稀疏的核磁共振数据与来自小角散射、荧光和电子顺磁共振光谱的低分辨率结构信息相结合,通过综合结构生物学方法获得大型RNP颗粒的结构。在最后一部分,我对通过固态核磁共振研究RNP复合物给出了展望。

相似文献

1
Present and future of NMR for RNA-protein complexes: a perspective of integrated structural biology.核磁共振技术在RNA-蛋白质复合物研究中的现状与未来:整合结构生物学视角
J Magn Reson. 2014 Apr;241:126-36. doi: 10.1016/j.jmr.2013.10.007.
2
Structural Analysis of Protein-RNA Complexes in Solution Using NMR Paramagnetic Relaxation Enhancements.利用核磁共振顺磁弛豫增强技术对溶液中蛋白质-RNA复合物进行结构分析
Methods Enzymol. 2015;558:333-362. doi: 10.1016/bs.mie.2015.02.006. Epub 2015 Mar 26.
3
Intermolecular protein-RNA interactions revealed by 2D 31P-15N magic angle spinning solid-state NMR spectroscopy.二维 31P-15N 魔角旋转固态 NMR 光谱揭示的分子间蛋白质-RNA 相互作用。
J Am Chem Soc. 2010 Mar 24;132(11):3842-6. doi: 10.1021/ja909723f.
4
NMR solution structure determination of large RNA-protein complexes.大型核糖核蛋白复合物的核磁共振溶液结构测定
Prog Nucl Magn Reson Spectrosc. 2016 Nov;97:57-81. doi: 10.1016/j.pnmrs.2016.10.001. Epub 2016 Oct 27.
5
Integrated structural biology to unravel molecular mechanisms of protein-RNA recognition.整合结构生物学以揭示蛋白质-RNA识别的分子机制。
Methods. 2017 Apr 15;118-119:119-136. doi: 10.1016/j.ymeth.2017.03.015. Epub 2017 Mar 16.
6
NMR approaches for structural analysis of multidomain proteins and complexes in solution.用于溶液中多结构域蛋白质和复合物结构分析的核磁共振方法。
Prog Nucl Magn Reson Spectrosc. 2014 Jul;80:26-63. doi: 10.1016/j.pnmrs.2014.05.003. Epub 2014 May 23.
7
Information-driven modeling of large macromolecular assemblies using NMR data.利用核磁共振数据对大型大分子组装体进行信息驱动建模。
J Magn Reson. 2014 Apr;241:103-14. doi: 10.1016/j.jmr.2013.10.021.
8
NMR and small-angle scattering-based structural analysis of protein complexes in solution.基于 NMR 和小角散射的溶液中蛋白质复合物结构分析。
J Struct Biol. 2011 Mar;173(3):472-82. doi: 10.1016/j.jsb.2010.11.004. Epub 2010 Nov 11.
9
NMR studies of protein-nucleic acid interactions.蛋白质-核酸相互作用的核磁共振研究。
Methods Mol Biol. 2004;278:289-312. doi: 10.1385/1-59259-809-9:289.
10
Cut and paste RNA for nuclear magnetic resonance, paramagnetic resonance enhancement, and electron paramagnetic resonance structural studies.用于核磁共振、顺磁共振增强和电子顺磁共振结构研究的切割粘贴RNA。
Methods Enzymol. 2015;565:537-62. doi: 10.1016/bs.mie.2015.05.029. Epub 2015 Jun 22.

引用本文的文献

1
Structural studies of protein-nucleic acid complexes: A brief overview of the selected techniques.蛋白质-核酸复合物的结构研究:所选技术的简要概述。
Comput Struct Biotechnol J. 2023 Apr 29;21:2858-2872. doi: 10.1016/j.csbj.2023.04.028. eCollection 2023.
2
Dynamics of base pairs with low stability in RNA by solid-state nuclear magnetic resonance exchange spectroscopy.通过固态核磁共振交换光谱法研究RNA中低稳定性碱基对的动力学
iScience. 2022 Oct 10;25(11):105322. doi: 10.1016/j.isci.2022.105322. eCollection 2022 Nov 18.
3
Nucleic acid-protein interfaces studied by MAS solid-state NMR spectroscopy.
通过魔角旋转固体核磁共振光谱研究的核酸-蛋白质界面
J Struct Biol X. 2022 Aug 18;6:100072. doi: 10.1016/j.yjsbx.2022.100072. eCollection 2022.
4
Identification of RNA Base Pairs and Complete Assignment of Nucleobase Resonances by Proton-Detected Solid-State NMR Spectroscopy at 100 kHz MAS.通过 100 kHz MAS 的质子检测固态 NMR 光谱学鉴定 RNA 碱基对并完全分配核碱基共振。
Angew Chem Int Ed Engl. 2021 Oct 25;60(44):23903-23910. doi: 10.1002/anie.202107263. Epub 2021 Sep 28.
5
Protein Side-Chain-DNA Contacts Probed by Fast Magic-Angle Spinning NMR.利用快速魔角旋转 NMR 探测蛋白质侧链与 DNA 的接触。
J Phys Chem B. 2020 Dec 10;124(49):11089-11097. doi: 10.1021/acs.jpcb.0c08150. Epub 2020 Nov 25.
6
Bioorthogonal chemistry-based RNA labeling technologies: evolution and current state.基于生物正交化学的 RNA 标记技术:发展与现状。
Chem Commun (Camb). 2020 Oct 21;56(82):12307-12318. doi: 10.1039/d0cc05228k. Epub 2020 Oct 7.
7
A methyl-TROSY approach for NMR studies of high-molecular-weight DNA with application to the nucleosome core particle.一种用于研究高分子量 DNA 的甲基-TROSY 方法及其在核小体核心颗粒中的应用。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Jun 9;117(23):12836-12846. doi: 10.1073/pnas.2004317117. Epub 2020 May 26.
8
The guide sRNA sequence determines the activity level of box C/D RNPs.向导小 RNA 序列决定框 C/D RNP 的活性水平。
Elife. 2020 Mar 23;9:e50027. doi: 10.7554/eLife.50027.
9
The role of small-angle scattering in structure-based screening applications.小角散射在基于结构的筛选应用中的作用。
Biophys Rev. 2018 Oct;10(5):1295-1310. doi: 10.1007/s12551-018-0464-x. Epub 2018 Oct 10.
10
Protein-nucleotide contacts in motor proteins detected by DNP-enhanced solid-state NMR.通过动态核极化增强固态核磁共振检测到的运动蛋白中的蛋白质-核苷酸相互作用。
J Biomol NMR. 2017 Nov;69(3):157-164. doi: 10.1007/s10858-017-0144-3. Epub 2017 Nov 8.