• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

富含卤素的片段文库作为化学探针,用于利用卤素键在基于片段的先导化合物发现中。

Halogen-enriched fragment libraries as chemical probes for harnessing halogen bonding in fragment-based lead discovery.

机构信息

Department of Pharmaceutical & Medicinal Chemistry, Institute of Pharmaceutical Sciences, Eberhard-Karls-University Tuebingen, Auf der Morgenstelle 8, 72076 Tuebingen, Germany.

出版信息

Future Med Chem. 2014 Apr;6(6):617-39. doi: 10.4155/fmc.14.20.

DOI:10.4155/fmc.14.20
PMID:24895892
Abstract

Halogen bonding has recently experienced a renaissance, gaining increased recognition as a useful molecular interaction in the life sciences. Halogen bonds are favorable, fairly directional interactions between an electropositive region on the halogen (the σ-hole) and a number of different nucleophilic interaction partners. Some aspects of halogen bonding are not yet understood well enough to take full advantage of its potential in drug discovery. We describe and present the concept of halogen-enriched fragment libraries. These libraries consist of unique chemical probes, facilitating the identification of favorable halogen bonds by sharing the advantages of classical fragment-based screening. Besides providing insights into the nature and applicability of halogen bonding, halogen-enriched fragment libraries provide smart starting points for hit-to-lead evolution.

摘要

卤键最近经历了一次复兴,在生命科学中作为一种有用的分子相互作用得到了越来越多的认可。卤键是卤原子(σ-hole)上的正电性区域与许多不同亲核相互作用伙伴之间有利的、相当定向的相互作用。卤键的某些方面还没有被充分理解,无法充分利用其在药物发现中的潜力。我们描述并提出了富含卤素的片段库的概念。这些库由独特的化学探针组成,通过共享经典片段筛选的优势,促进了有利卤键的识别。除了提供对卤键的性质和适用性的深入了解外,富含卤素的片段库还为命中先导的进化提供了明智的起点。

相似文献

1
Halogen-enriched fragment libraries as chemical probes for harnessing halogen bonding in fragment-based lead discovery.富含卤素的片段文库作为化学探针,用于利用卤素键在基于片段的先导化合物发现中。
Future Med Chem. 2014 Apr;6(6):617-39. doi: 10.4155/fmc.14.20.
2
Halogen bonding for rational drug design and new drug discovery.卤键在理性药物设计和新药发现中的应用。
Expert Opin Drug Discov. 2012 May;7(5):375-83. doi: 10.1517/17460441.2012.678829. Epub 2012 Mar 30.
3
Principles and applications of halogen bonding in medicinal chemistry and chemical biology.卤键在药物化学和化学生物学中的原理与应用。
J Med Chem. 2013 Feb 28;56(4):1363-88. doi: 10.1021/jm3012068. Epub 2013 Jan 3.
4
Nonbonding interactions of organic halogens in biological systems: implications for drug discovery and biomolecular design.生物体系中有机卤素的非键相互作用:对药物发现和生物分子设计的启示。
Phys Chem Chem Phys. 2010 May 14;12(18):4543-51. doi: 10.1039/b926326h. Epub 2010 Mar 25.
5
Halogens in Protein-Ligand Binding Mechanism: A Structural Perspective.卤族元素在蛋白-配体结合机制中的作用:结构视角
J Med Chem. 2019 Nov 14;62(21):9341-9356. doi: 10.1021/acs.jmedchem.8b01453. Epub 2019 May 28.
6
Halogen bonding in halocarbon-protein complexes and computational tools for rational drug design.卤键在卤代烃-蛋白质复合物中的作用及合理药物设计的计算工具。
Expert Opin Drug Discov. 2019 Aug;14(8):805-820. doi: 10.1080/17460441.2019.1619692. Epub 2019 May 27.
7
Evaluating the potential of halogen bonding in molecular design: automated scaffold decoration using the new scoring function XBScore.评估卤键在分子设计中的潜力:使用新的评分函数 XBScore 进行自动骨架修饰。
J Chem Inf Model. 2015 Mar 23;55(3):687-99. doi: 10.1021/ci5007118. Epub 2015 Feb 19.
8
Halogen bonding--a novel interaction for rational drug design?卤键——合理药物设计的一种新型相互作用?
J Med Chem. 2009 May 14;52(9):2854-62. doi: 10.1021/jm9000133.
9
Biomolecular halogen bonds.生物分子卤键
Top Curr Chem. 2015;358:241-76. doi: 10.1007/128_2014_551.
10
Halogen bond: its role beyond drug-target binding affinity for drug discovery and development.卤素键:在药物发现和开发中超越药物靶标结合亲和力的作用。
J Chem Inf Model. 2014 Jan 27;54(1):69-78. doi: 10.1021/ci400539q. Epub 2014 Jan 6.

引用本文的文献

1
Studying Noncovalent Interactions in Molecular Systems with Machine Learning.利用机器学习研究分子系统中的非共价相互作用。
Chem Rev. 2025 Jun 25;125(12):5776-5829. doi: 10.1021/acs.chemrev.4c00893. Epub 2025 Jun 9.
2
Unprecedented carbonic anhydrase inhibition mechanism: Targeting histidine 64 side chain through a halogen bond.前所未有的碳酸酐酶抑制机制:通过卤键靶向组氨酸64侧链。
Arch Pharm (Weinheim). 2025 Jan;358(1):e2400776. doi: 10.1002/ardp.202400776.
3
Modulation of Albumin Esterase Activity by Warfarin and Diazepam.华法林和地西泮对白蛋白酯酶活性的调节作用。
Int J Mol Sci. 2024 Oct 27;25(21):11543. doi: 10.3390/ijms252111543.
4
Evaluation of a Covalent Library of Diverse Warheads (CovLib) Binding to JNK3, USP7, or p53.评估多样化弹头共价文库(CovLib)与 JNK3、USP7 或 p53 的结合。
Drug Des Devel Ther. 2024 Jul 1;18:2653-2679. doi: 10.2147/DDDT.S466829. eCollection 2024.
5
High-confidence placement of low-occupancy fragments into electron density using the anomalous signal of sulfur and halogen atoms.利用硫和卤素原子的反常信号,将低占据片段高精度地放置到电子密度中。
Acta Crystallogr D Struct Biol. 2024 Jun 1;80(Pt 6):451-463. doi: 10.1107/S2059798324004480. Epub 2024 Jun 5.
6
Principles and Applications of CFX Moieties as Unconventional Halogen Bond Donors in Medicinal Chemistry, Chemical Biology, and Drug Discovery.CFX 部分作为药物化学、化学生物学和药物发现中非常规卤键供体的原理和应用。
J Med Chem. 2023 Aug 10;66(15):10202-10225. doi: 10.1021/acs.jmedchem.3c00634. Epub 2023 Jul 24.
7
New Hybrid Tetrahydropyrrolo[3,2,1-]quinolin-1-ylidene-2-thioxothiazolidin-4-ones as New Inhibitors of Factor Xa and Factor XIa: Design, Synthesis, and In Silico and Experimental Evaluation.新型杂环四氢吡咯并[3,2,1-]喹啉-1-亚基-2-硫代噻唑烷-4-酮类新型 Xa 因子和 XIa 因子抑制剂的设计、合成及计算机模拟和实验评估。
Molecules. 2023 May 1;28(9):3851. doi: 10.3390/molecules28093851.
8
Revisiting a challenging p53 binding site: a diversity-optimized HEFLib reveals diverse binding modes in T-p53C-Y220C.重新审视一个具有挑战性的p53结合位点:一个经过多样性优化的HEFLib揭示了T-p53C-Y220C中的多种结合模式。
RSC Med Chem. 2022 Oct 20;13(12):1575-1586. doi: 10.1039/d2md00246a. eCollection 2022 Dec 14.
9
Comprehensive analysis of commercial fragment libraries.商业片段库的综合分析
RSC Med Chem. 2021 Dec 24;13(3):300-310. doi: 10.1039/d1md00363a. eCollection 2022 Mar 23.
10
Embracing the Diversity of Halogen Bonding Motifs in Fragment-Based Drug Discovery-Construction of a Diversity-Optimized Halogen-Enriched Fragment Library.基于片段药物发现中卤键基序的多样性——构建一个经过多样性优化的富含卤素片段库
Front Chem. 2019 Feb 18;7:9. doi: 10.3389/fchem.2019.00009. eCollection 2019.