• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

感染希氏玫瑰杆菌DFL12的噬玫瑰杆菌vB_DshP-R1的全基因组序列。

Complete genome sequence of Roseophage vB_DshP-R1, which infects Dinoroseobacter shibae DFL12.

作者信息

Ji Jianda, Zhang Rui, Jiao Nianzhi

机构信息

State Key Laboratory of Marine Environmental Science, Institute of Marine Microbes and Ecospheres, Xiamen University, Xiamen, PR, China.

出版信息

Stand Genomic Sci. 2015 Jan 21;9:31. doi: 10.1186/1944-3277-9-31. eCollection 2014.

DOI:10.1186/1944-3277-9-31
PMID:25685262
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4322955/
Abstract

The Roseophages, a group of marine viruses that uniquely infect the Roseobacter clade of bacteria, play a significant role in marine ecosystems. Here we present a complete genomic sequence of an N4 phage 'vB_DshP-R1', which infects Dinoroseobacter shibae DFL12, together with its structural and genomic features. vB_DshP-R1 has an ~ 75 nm diameter icosahedral structure and a complete genome of 75,028 bp. This is the first genome sequence of a lytic phage of the genus Dinoroseobacter.

摘要

玫瑰噬菌体系一组独特感染玫瑰杆菌属细菌的海洋病毒,在海洋生态系统中发挥着重要作用。在此,我们展示了一种感染希氏玫瑰杆菌DFL12的N4噬菌体“vB_DshP-R1”的完整基因组序列,以及其结构和基因组特征。vB_DshP-R1具有直径约75纳米的二十面体结构,基因组全长75,028碱基对。这是玫瑰杆菌属裂解性噬菌体的首个基因组序列。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6f86/4322955/81fb4b78a016/1944-3277-9-31-3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6f86/4322955/75bac1f1f449/1944-3277-9-31-1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6f86/4322955/da0aa74937a2/1944-3277-9-31-2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6f86/4322955/81fb4b78a016/1944-3277-9-31-3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6f86/4322955/75bac1f1f449/1944-3277-9-31-1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6f86/4322955/da0aa74937a2/1944-3277-9-31-2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6f86/4322955/81fb4b78a016/1944-3277-9-31-3.jpg

相似文献

1
Complete genome sequence of Roseophage vB_DshP-R1, which infects Dinoroseobacter shibae DFL12.感染希氏玫瑰杆菌DFL12的噬玫瑰杆菌vB_DshP-R1的全基因组序列。
Stand Genomic Sci. 2015 Jan 21;9:31. doi: 10.1186/1944-3277-9-31. eCollection 2014.
2
Complete genome sequence of Roseophage vB_DshP-R1, which infects Dinoroseobacter shibae DFL12.感染希氏玫瑰杆菌DFL12的玫瑰噬菌体温B_DshP-R1的全基因组序列。
Stand Genomic Sci. 2015 Jan 21;10:6. doi: 10.1186/1944-3277-10-6. eCollection 2015.
3
Complete genome sequence of vB_DshP-R2C, a N4-like lytic roseophage.一种N4样裂解性玫瑰噬菌体vB_DshP-R2C的全基因组序列
Mar Genomics. 2015 Aug;22:15-7. doi: 10.1016/j.margen.2015.03.005. Epub 2015 Mar 18.
4
Erratum to: 'Complete genome sequence of Roseophage vB_DshP-R1, which infects Dinoroseobacter shibae DFL12'.《侵染希氏玫瑰杆菌DFL12的噬玫瑰杆菌vB_DshP-R1全基因组序列》勘误
Stand Genomic Sci. 2015 Sep 24;10:69. doi: 10.1186/s40793-015-0056-3. eCollection 2015.
5
A newly isolated roseophage represents a distinct member of Siphoviridae family.一株新分离的玫瑰噬菌体代表了长尾噬菌体科的一个独特成员。
Virol J. 2019 Nov 6;16(1):128. doi: 10.1186/s12985-019-1241-6.
6
A Novel Roseosiphophage Isolated from the Oligotrophic South China Sea.从贫营养的南海中分离到一种新型玫瑰噬菌体。
Viruses. 2017 May 15;9(5):109. doi: 10.3390/v9050109.
7
The complete genome sequence of the algal symbiont Dinoroseobacter shibae: a hitchhiker's guide to life in the sea.藻青菌共生体 Dinoroseobacter shibae 的全基因组序列:海洋生物的搭便车之旅。
ISME J. 2010 Jan;4(1):61-77. doi: 10.1038/ismej.2009.94. Epub 2009 Sep 10.
8
Genomic analysis of multiple Roseophage SIO1 strains.对多个 Roseophage SIO1 菌株的基因组分析。
Environ Microbiol. 2009 Nov;11(11):2863-73. doi: 10.1111/j.1462-2920.2009.02021.x. Epub 2009 Jul 31.
9
Characterization and Complete Genome Sequences of Three N4-Like Roseobacter Phages Isolated from the South China Sea.从中国南海分离的三种N4样玫瑰杆菌噬菌体的特性及全基因组序列
Curr Microbiol. 2016 Sep;73(3):409-418. doi: 10.1007/s00284-016-1071-3. Epub 2016 Jun 7.
10
Genomic, proteomic and bioinformatic analysis of two temperate phages in Roseobacter clade bacteria isolated from the deep-sea water.对从深海海水中分离出的玫瑰杆菌属细菌中的两种温和噬菌体进行基因组、蛋白质组和生物信息学分析。
BMC Genomics. 2017 Jun 27;18(1):485. doi: 10.1186/s12864-017-3886-0.

引用本文的文献

1
Characterization and Complete Genome Sequences of Three N4-Like Roseobacter Phages Isolated from the South China Sea.从中国南海分离的三种N4样玫瑰杆菌噬菌体的特性及全基因组序列
Curr Microbiol. 2016 Sep;73(3):409-418. doi: 10.1007/s00284-016-1071-3. Epub 2016 Jun 7.
2
Novel N4 Bacteriophages Prevail in the Cold Biosphere.新型N4噬菌体在寒冷生物圈中占主导地位。
Appl Environ Microbiol. 2015 Aug;81(15):5196-202. doi: 10.1128/AEM.00832-15. Epub 2015 May 29.

本文引用的文献

1
MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0.MEGA6:分子进化遗传学分析版本 6.0。
Mol Biol Evol. 2013 Dec;30(12):2725-9. doi: 10.1093/molbev/mst197. Epub 2013 Oct 16.
2
Bacteriophage genes that inactivate the CRISPR/Cas bacterial immune system.使 CRISPR/Cas 细菌免疫系统失活的噬菌体基因。
Nature. 2013 Jan 17;493(7432):429-32. doi: 10.1038/nature11723. Epub 2012 Dec 16.
3
Complete genome sequence of Celeribacter bacteriophage P12053L.Celeribacter 噬菌体 P12053L 的全基因组序列。
J Virol. 2012 Aug;86(15):8339-40. doi: 10.1128/JVI.01153-12.
4
Comparative genomics of methylated amine utilization by marine Roseobacter clade bacteria and development of functional gene markers (tmm, gmaS).海洋玫瑰杆菌菌群中甲基胺利用的比较基因组学及功能基因标记(tmm、gmaS)的开发
Environ Microbiol. 2012 Sep;14(9):2308-22. doi: 10.1111/j.1462-2920.2012.02765.x. Epub 2012 Apr 28.
5
Isolation and characterization of a novel indigenous intestinal N4-related coliphage vB_EcoP_G7C.一种新型本土肠道 N4 相关大肠埃希菌噬菌体 vB_EcoP_G7C 的分离与鉴定。
Virology. 2012 May 10;426(2):93-9. doi: 10.1016/j.virol.2012.01.027. Epub 2012 Feb 15.
6
Draft genome sequence of the coccolithovirus EhV-84.颗石藻病毒EhV - 84的基因组序列草图
Stand Genomic Sci. 2011 Oct 15;5(1):1-11. doi: 10.4056/sigs.1884581. Epub 2011 Sep 23.
7
Influence of light and anoxia on chemiosmotic energy conservation in Dinoroseobacter shibae.光照和缺氧对希氏玫瑰杆菌化学渗透能量守恒的影响。
Environ Microbiol Rep. 2011 Feb;3(1):136-141. doi: 10.1111/j.1758-2229.2010.00199.x.
8
Complete genome sequence of a marine roseophage provides evidence into the evolution of gene transfer agents in alphaproteobacteria.海洋玫瑰噬菌体全基因组序列为α变形菌中基因转移因子的进化提供了证据。
Virol J. 2011 Mar 17;8:124. doi: 10.1186/1743-422X-8-124.
9
Marine viruses and global climate change.海洋病毒与全球气候变化。
FEMS Microbiol Rev. 2011 Nov;35(6):993-1034. doi: 10.1111/j.1574-6976.2010.00258.x. Epub 2011 Jan 4.
10
The CRISPR/Cas bacterial immune system cleaves bacteriophage and plasmid DNA.CRISPR/Cas 细菌免疫系统可切割噬菌体和质粒 DNA。
Nature. 2010 Nov 4;468(7320):67-71. doi: 10.1038/nature09523.