• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

是时候建立一个基因组甲基化位点报告的标准化系统了。

Time for a standardized system of reporting sites of genomic methylation.

作者信息

Saffery Richard, Gordon Lavinia

机构信息

Cancer & Disease Epigenetics, Murdoch Childrens Research Institute, Royal Children's Hospital, Flemington Road, Parkville, Australia.

Department of Paediatrics, University of Melbourne, Parkville, VIC, 3010, Australia.

出版信息

Genome Biol. 2015 Apr 30;16(1):85. doi: 10.1186/s13059-015-0654-9.

DOI:10.1186/s13059-015-0654-9
PMID:25924664
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4415255/
Abstract

The authors argue that the lack of a widely used, systematic way to report sites of DNA methylation is a often a barrier to reproducibility and therefore holds back research.

摘要

作者们认为,缺乏一种广泛使用的、系统的报告DNA甲基化位点的方法常常是可重复性的障碍,因此阻碍了研究进展。

相似文献

1
Time for a standardized system of reporting sites of genomic methylation.是时候建立一个基因组甲基化位点报告的标准化系统了。
Genome Biol. 2015 Apr 30;16(1):85. doi: 10.1186/s13059-015-0654-9.
2
Validated primer set that prevents nuclear DNA sequences of mitochondrial origin co-amplification: a revision based on the New Human Genome Reference Sequence (GRCh37).经验证的引物集可防止线粒体来源的核 DNA 序列共扩增:基于新人类基因组参考序列 (GRCh37) 的修订版。
Electrophoresis. 2011 Mar;32(6-7):782-3. doi: 10.1002/elps.201000583. Epub 2011 Jan 11.
3
Global DNA methylation analysis using the Luminometric Methylation Assay.使用荧光定量甲基化检测法进行全基因组DNA甲基化分析。
Methods Mol Biol. 2011;791:135-44. doi: 10.1007/978-1-61779-316-5_11.
4
Profiling DNA methylation by bisulfite genomic sequencing: problems and solutions.通过亚硫酸氢盐基因组测序分析DNA甲基化:问题与解决方案
Methods Mol Biol. 2004;287:169-79. doi: 10.1385/1-59259-828-5:169.
5
Assemblies: the good, the bad, the ugly.组件:好的、坏的、丑陋的。
Nat Methods. 2011 Jan;8(1):59-60. doi: 10.1038/nmeth0111-59.
6
'Platinum' genome takes on disease.“白金”基因组对抗疾病。
Nature. 2014 Nov 20;515(7527):323. doi: 10.1038/515323a.
7
What is finished, and why does it matter.完成了什么,以及为何这很重要。
Genome Res. 2002 May;12(5):669-71. doi: 10.1101/gr.032102.
8
Methylation analysis by DNA immunoprecipitation.通过 DNA 免疫沉淀进行甲基化分析。
J Cell Physiol. 2010 Mar;222(3):522-31. doi: 10.1002/jcp.22009.
9
Investigation of genomic methylation status using methylation-specific and bisulfite sequencing polymerase chain reaction.使用甲基化特异性和亚硫酸氢盐测序聚合酶链反应研究基因组甲基化状态。
Methods Mol Biol. 2015;1288:193-212. doi: 10.1007/978-1-4939-2474-5_11.
10
Next-generation sequencing technologies for DNA methylation analyses in cancer genomics.下一代测序技术在癌症基因组学中的 DNA 甲基化分析。
Epigenomics. 2010 Apr;2(2):199-207. doi: 10.2217/epi.09.50.

引用本文的文献

1
Expanding the scope of methylation-sensitive restriction enzyme (MSRE) PCR for forensic identification of body fluids through the novel use of methylation-dependent restriction enzymes (MDRE) and the combination of autosomal and Y-chromosomal markers.通过新型甲基化依赖型限制性内切酶 (MDRE) 的应用以及常染色体和 Y 染色体标记物的联合,拓展甲基化敏感限制性内切酶 (MSRE) PCR 在法医体液鉴定中的应用范围。
Int J Legal Med. 2024 Mar;138(2):375-393. doi: 10.1007/s00414-023-03097-9. Epub 2023 Oct 24.
2
Male-specific age estimation based on Y-chromosomal DNA methylation.基于 Y 染色体 DNA 甲基化的男性特异性年龄估计。
Aging (Albany NY). 2021 Mar 11;13(5):6442-6458. doi: 10.18632/aging.202775.
3
DNA methylation analysis of candidate genes associated with dementia in peripheral blood.外周血中与痴呆相关的候选基因的 DNA 甲基化分析。
Epigenomics. 2020 Dec;12(23):2109-2123. doi: 10.2217/epi-2020-0236. Epub 2020 Dec 10.
4
Blood DNA methylation signatures to detect dementia prior to overt clinical symptoms.血液DNA甲基化特征用于在明显临床症状出现之前检测痴呆症。
Alzheimers Dement (Amst). 2020 Jul 9;12(1):e12056. doi: 10.1002/dad2.12056. eCollection 2020.
5
Novel DNA Methylation Sites Influence Expression in Relation to Smoking.新型 DNA 甲基化位点影响与吸烟相关的表达。
Biomolecules. 2018 Aug 20;8(3):74. doi: 10.3390/biom8030074.
6
Recommendations for a nomenclature system for reporting methylation aberrations in imprinted domains.建议使用一个命名系统来报告印迹域中甲基化异常。
Epigenetics. 2018;13(2):117-121. doi: 10.1080/15592294.2016.1264561. Epub 2018 Jan 25.
7
Transcription factor HIF1A: downstream targets, associated pathways, polymorphic hypoxia response element (HRE) sites, and initiative for standardization of reporting in scientific literature.转录因子HIF1A:下游靶点、相关通路、多态性缺氧反应元件(HRE)位点以及科学文献报告标准化倡议
Tumour Biol. 2016 Nov;37(11):14851-14861. doi: 10.1007/s13277-016-5331-4. Epub 2016 Sep 19.
8
Comparison of Methyl-capture Sequencing vs. Infinium 450K methylation array for methylome analysis in clinical samples.甲基捕获测序与Infinium 450K甲基化芯片在临床样本甲基化组分析中的比较
Epigenetics. 2016;11(1):36-48. doi: 10.1080/15592294.2015.1132136. Epub 2016 Jan 19.