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一种眼蝶(白纹黛眼蝶,鳞翅目:蛱蝶科)的完整线粒体基因组

Complete mitochondrial genome of a satyrid butterfly, Lethe albolineata (Lepidoptera: Nymphalidae).

作者信息

Li Jialian, Xu Chang, Lei Ying, Fan Cheng, Gao Yuan, Xu Chongren, Wang Rongjiang

机构信息

a College of Life Sciences, Peking University , Beijing , PR China.

出版信息

Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2016 Nov;27(6):4195-4196. doi: 10.3109/19401736.2015.1022736. Epub 2015 May 12.

Abstract

The complete mitochondrial genome of Lethe albolineata is a circular molecule of 15,248 bp in length, containing 13 protein-coding genes (PCGs), 22 transfer RNA genes (tRNAs), two ribosomal RNA genes (LrRNA and SrRNA), and a non-coding AT-rich region. All PCGs use the standard ATN start codon, except for COI, which begins with CGA. Eight PCGs employ complete stop codon (TAA), whereas the others use a single T or TA acting as an incomplete stop codon. The AT-rich region is 413 bp in length, which contains a conserved motif common to the other lepidopteran species. Two tRNA-like pseudo-genes are found in the mitochondrial genome of L. albolineata. The phylogenetic analysis shows that L. albolineata exhibits most close relationship with L. dura.

摘要

白线黛眼蝶的完整线粒体基因组是一个长度为15248 bp的环状分子,包含13个蛋白质编码基因(PCGs)、22个转运RNA基因(tRNAs)、两个核糖体RNA基因(LrRNA和SrRNA)以及一个富含AT的非编码区。除了以CGA起始的COI外,所有PCGs均使用标准的ATN起始密码子。8个PCGs使用完整的终止密码子(TAA),而其他的则使用单个T或TA作为不完整的终止密码子。富含AT的区域长度为413 bp,其中包含一个其他鳞翅目物种共有的保守基序。在白线黛眼蝶的线粒体基因组中发现了两个类似tRNA的假基因。系统发育分析表明,白线黛眼蝶与褐黛眼蝶的关系最为密切。

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