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新热带鸬鹚(巴西鸬鹚)的完整线粒体基因组

Complete mitochondrial genome of the Neotropic cormorant (Phalacrocorax brasilianus).

作者信息

Rodrigues Pedro, Álvarez Pedro, Verdugo Claudio

机构信息

a Instituto De Patología Animal, Facultad De Ciencias Veterinarias, Universidad Austral De Chile , Valdivia , Chile.

b Programa De Investigación Aplicada En Fauna Silvestre, Facultad De Ciencias Veterinarias, Universidad Austral De Chile , Valdivia , Chile.

出版信息

Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2017 May;28(3):401-402. doi: 10.3109/19401736.2015.1127364. Epub 2015 Dec 29.

Abstract

The complete sequence of the Neotropic cormorant (Phalacrocorax brasilianus) mitochondrial DNA was obtained by the shotgun sequencing approach. The mitogenome is 19 042 bp in length and includes 13 protein-coding genes, 2 ribosomal subunit genes, 22 transfer RNA genes, a control region and a duplicated region of 2418 bp. The base composition is 32.1% for C, 31.8% for A, 22.6% for T and 13.4% for G, with an overall GC content of 45.5%. This is the first mitogenome of the P. brasilianus described and will be a useful tool for further phylogenetic and population genetic studies.

摘要

通过鸟枪法测序方法获得了新热带鸬鹚(巴西鸬鹚,学名:Phalacrocorax brasilianus)线粒体DNA的完整序列。该线粒体基因组长度为19042 bp,包括13个蛋白质编码基因、2个核糖体亚基基因、22个转运RNA基因、一个控制区和一个2418 bp的重复区域。碱基组成为:C占32.1%,A占31.8%,T占22.6%,G占13.4%,总体GC含量为45.5%。这是首次描述的巴西鸬鹚线粒体基因组,将成为进一步进行系统发育和群体遗传学研究的有用工具。

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