• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

拟南芥中 Pol IV 依赖型转录本的特征和加工。

Characteristics and processing of Pol IV-dependent transcripts in Arabidopsis.

机构信息

Department of Molecular, Cell and Developmental Biology, University of California at Los Angeles, Los Angeles, CA 90095, USA.

Department of Biology, Southern University of Science and Technology, Shenzhen 518055, China.

出版信息

J Genet Genomics. 2017 Jan 20;44(1):3-6. doi: 10.1016/j.jgg.2016.10.009. Epub 2016 Dec 30.

DOI:10.1016/j.jgg.2016.10.009
PMID:28089091
Abstract

RNAi is a highly conserved machinery in eukaryotes for transcriptional or post-transcriptional silencing. In plants, RNA-directed DNA Methylation (RdDM) pathway deploys small interfering RNAs (siRNAs) to target DNA methylation. This process is initiated by the plant-specific RNA polymerase IV (Pol IV) to produce RNA precursors that are later processed into siRNAs. Until recently, characterization of Pol IV transcript had been difficult due to its presumed rapid turnover. This review summarizes five recent reports on Pol IV-dependent RNAs that explore the biogenesis and features of Pol IV transcripts, as well as alternative dicer-independent processing of Pol IV products.

摘要

RNAi 是真核生物中用于转录或转录后沉默的高度保守机制。在植物中,RNA 指导的 DNA 甲基化 (RdDM) 途径利用小干扰 RNA(siRNA) 靶向 DNA 甲基化。这一过程由植物特异性 RNA 聚合酶 IV (Pol IV) 启动,产生 RNA 前体,然后进一步加工成 siRNA。直到最近,由于假定的快速周转,Pol IV 转录本的特征描述一直很困难。这篇综述总结了最近关于 Pol IV 依赖性 RNA 的五个报告,探讨了 Pol IV 转录本的生物发生和特征,以及 Pol IV 产物的替代非依赖于 dicer 的加工。

相似文献

1
Characteristics and processing of Pol IV-dependent transcripts in Arabidopsis.拟南芥中 Pol IV 依赖型转录本的特征和加工。
J Genet Genomics. 2017 Jan 20;44(1):3-6. doi: 10.1016/j.jgg.2016.10.009. Epub 2016 Dec 30.
2
Dicer-independent RNA-directed DNA methylation in Arabidopsis.拟南芥中不依赖Dicer的RNA指导的DNA甲基化
Cell Res. 2016 Jan;26(1):66-82. doi: 10.1038/cr.2015.145. Epub 2015 Dec 8.
3
Distinct and concurrent pathways of Pol II- and Pol IV-dependent siRNA biogenesis at a repetitive trans-silencer locus in Arabidopsis thaliana.在拟南芥重复跨沉默子基因座上,Pol II 和 Pol IV 依赖的 siRNA 生物发生的独特且并发途径。
Plant J. 2014 Jul;79(1):127-38. doi: 10.1111/tpj.12545. Epub 2014 Jun 13.
4
Interplay among RNA polymerases II, IV and V in RNA-directed DNA methylation at a low copy transgene locus in Arabidopsis thaliana.RNA 聚合酶 II、IV 和 V 在拟南芥低拷贝转基因座的 RNA 指导的 DNA 甲基化中的相互作用。
Plant Mol Biol. 2013 May;82(1-2):85-96. doi: 10.1007/s11103-013-0041-4. Epub 2013 Mar 20.
5
Detection of Pol IV/RDR2-dependent transcripts at the genomic scale in Arabidopsis reveals features and regulation of siRNA biogenesis.在拟南芥基因组范围内检测Pol IV/RDR2依赖性转录本揭示了小干扰RNA生物合成的特征和调控。
Genome Res. 2015 Feb;25(2):235-45. doi: 10.1101/gr.182238.114. Epub 2014 Nov 20.
6
RNA Polymerase IV generates 21-22 nucleotide small RNAs that can participate in RNA-directed DNA methylation and may regulate genes.RNA 聚合酶 IV 生成 21-22 个核苷酸的小 RNA,可参与 RNA 指导的 DNA 甲基化,可能调节基因。
Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2020 Mar 30;375(1795):20190417. doi: 10.1098/rstb.2019.0417. Epub 2020 Feb 10.
7
NRPD4, a protein related to the RPB4 subunit of RNA polymerase II, is a component of RNA polymerases IV and V and is required for RNA-directed DNA methylation.NRPD4是一种与RNA聚合酶II的RPB4亚基相关的蛋白质,是RNA聚合酶IV和V的一个组成部分,是RNA指导的DNA甲基化所必需的。
Genes Dev. 2009 Feb 1;23(3):318-30. doi: 10.1101/gad.1765209.
8
RNA polymerases IV and V influence the 3' boundaries of Polymerase II transcription units in Arabidopsis.RNA 聚合酶 IV 和 V 影响拟南芥中聚合酶 II 转录单位的 3' 边界。
RNA Biol. 2018 Feb 1;15(2):269-279. doi: 10.1080/15476286.2017.1409930. Epub 2017 Dec 21.
9
Analysis of siRNA Precursors Generated by RNA Polymerase IV and RNA-Dependent RNA Polymerase 2 in Arabidopsis.拟南芥中由RNA聚合酶IV和RNA依赖性RNA聚合酶2产生的小干扰RNA前体的分析
Methods Mol Biol. 2019;1933:33-48. doi: 10.1007/978-1-4939-9045-0_2.
10
A One Precursor One siRNA Model for Pol IV-Dependent siRNA Biogenesis.一种用于依赖Pol IV的小干扰RNA生物合成的单前体单小干扰RNA模型。
Cell. 2015 Oct 8;163(2):445-55. doi: 10.1016/j.cell.2015.09.032.

引用本文的文献

1
REM transcription factors and GDE1 shape the DNA methylation landscape through the recruitment of RNA polymerase IV transcription complexes.REM转录因子和GDE1通过募集RNA聚合酶IV转录复合物塑造DNA甲基化图谱。
Nat Cell Biol. 2025 Jun 27. doi: 10.1038/s41556-025-01691-0.
2
DNA methylation dynamics during germline development.生殖系发育过程中的 DNA 甲基化动态。
J Integr Plant Biol. 2022 Dec;64(12):2240-2251. doi: 10.1111/jipb.13422.
3
You shall not pass! A Chromatin barrier story in plants.你不得通过!植物中的一个染色质屏障故事。
Front Plant Sci. 2022 Sep 20;13:888102. doi: 10.3389/fpls.2022.888102. eCollection 2022.
4
Regulation of DNA Methylation During Plant Endosperm Development.植物胚乳发育过程中DNA甲基化的调控
Front Genet. 2022 Feb 10;13:760690. doi: 10.3389/fgene.2022.760690. eCollection 2022.
5
Taking the Wheel - DNA Methylation as a Driving Force of Plant Embryonic Development.掌控全局——DNA甲基化作为植物胚胎发育的驱动力
Front Plant Sci. 2021 Oct 29;12:764999. doi: 10.3389/fpls.2021.764999. eCollection 2021.
6
Arabidopsis MORC proteins function in the efficient establishment of RNA directed DNA methylation.拟南芥 MORC 蛋白在 RNA 指导的 DNA 甲基化的有效建立中发挥作用。
Nat Commun. 2021 Jul 13;12(1):4292. doi: 10.1038/s41467-021-24553-3.
7
Soybean DICER-LIKE2 Regulates Seed Coat Color via Production of Primary 22-Nucleotide Small Interfering RNAs from Long Inverted Repeats.大豆 DICER-LIKE2 通过长反向重复产生初级 22 核苷酸小干扰 RNA 调控种皮颜色。
Plant Cell. 2020 Dec;32(12):3662-3673. doi: 10.1105/tpc.20.00562. Epub 2020 Oct 19.
8
Co-targeting RNA Polymerases IV and V Promotes Efficient De Novo DNA Methylation in Arabidopsis.靶向 RNA 聚合酶 IV 和 V 促进拟南芥中从头 DNA 甲基化的高效性。
Cell. 2019 Feb 21;176(5):1068-1082.e19. doi: 10.1016/j.cell.2019.01.029. Epub 2019 Feb 7.