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FRAGMAP——一个用于限制酶切位点图谱比较的程序。

FRAGMAP--a program for restriction site map comparison.

作者信息

Gershon P D, Knowles N J

机构信息

AFRC Institute for Animal Health, Woking, Surrey, UK.

出版信息

Nucleic Acids Res. 1988 Mar 11;16(5):1779-87. doi: 10.1093/nar/16.5.1779.

DOI:10.1093/nar/16.5.1779
PMID:2832828
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC338171/
Abstract

A program is described which aligns pairs of linear restriction site maps using an algorithm which maximizes the number of coincident sites through the addition of extra 'padding' fragments; and makes maps of the non-conserved sites between pairs and triplets of input maps. A range of display facilities, hardcopy functions and database management routines are also included. The program runs on a stand-alone microcomputer, and is stored along with a database of several hundred files on a single floppy disc.

摘要

本文描述了一个程序，该程序使用一种算法来比对线性限制酶切位点图谱对，该算法通过添加额外的“填充”片段来最大化重合位点的数量；并绘制输入图谱对和三联体之间非保守位点的图谱。还包括一系列显示工具、硬拷贝功能和数据库管理程序。该程序在独立的微型计算机上运行，并与数百个文件的数据库一起存储在一张软盘上。