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FANTOM5 数据集,一个支撑不同细胞类型的哺乳动物转录组图谱的数据集系列。

The FANTOM5 collection, a data series underpinning mammalian transcriptome atlases in diverse cell types.

机构信息

RIKEN Preventive Medicine and Diagnosis Innovation Program, Wako, Saitama 351-0198, Japan.

RIKEN Advanced Center for Computing and Communication, Preventive Medicine and Applied Genomics Unit, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan.

出版信息

Sci Data. 2017 Aug 29;4:170113. doi: 10.1038/sdata.2017.113.

Abstract

The latest project from the FANTOM consortium, an international collaborative effort initiated by RIKEN, generated atlases of transcriptomes, in particular promoters, transcribed enhancers, and long-noncoding RNAs, across a diverse set of mammalian cell types. Here, we introduce the FANTOM5 collection, bringing together data descriptors, articles and analyses of FANTOM5 data published across the Nature Research journals. Associated data are openly available for reuse by all.

摘要

FANTOM 联盟的最新项目是由日本理化学研究所发起的一项国际合作,生成了跨多种哺乳动物细胞类型的转录组图谱,特别是启动子、转录增强子和长非编码 RNA。在这里,我们介绍 FANTOM5 数据集,它汇集了发表在《自然》研究期刊上的 FANTOM5 数据的描述符、文章和分析。相关数据可公开获取,供所有人重复使用。

相似文献

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Paradigm shifts in genomics through the FANTOM projects.通过FANTOM项目实现的基因组学范式转变。
Mamm Genome. 2015 Oct;26(9-10):391-402. doi: 10.1007/s00335-015-9593-8. Epub 2015 Aug 8.

引用本文的文献

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本文引用的文献

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An atlas of human long non-coding RNAs with accurate 5' ends.具有精确5'端的人类长链非编码RNA图谱。
Nature. 2017 Mar 9;543(7644):199-204. doi: 10.1038/nature21374. Epub 2017 Mar 1.
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