• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

Quick tips for creating effective and impactful biological pathways using the Systems Biology Graphical Notation.

作者信息

Touré Vasundra, Le Novère Nicolas, Waltemath Dagmar, Wolkenhauer Olaf

机构信息

Department of Systems Biology and Bioinformatics, University of Rostock, Rostock, Germany.

Babraham Institute, Babraham Research Campus, Cambridge, United Kingdom.

出版信息

PLoS Comput Biol. 2018 Feb 15;14(2):e1005740. doi: 10.1371/journal.pcbi.1005740. eCollection 2018 Feb.

DOI:10.1371/journal.pcbi.1005740
PMID:29447151
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5813898/
Abstract
摘要
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d574/5813898/477f5f4485b1/pcbi.1005740.g003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d574/5813898/74e93218ea71/pcbi.1005740.g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d574/5813898/4d81e6b21296/pcbi.1005740.g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d574/5813898/477f5f4485b1/pcbi.1005740.g003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d574/5813898/74e93218ea71/pcbi.1005740.g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d574/5813898/4d81e6b21296/pcbi.1005740.g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d574/5813898/477f5f4485b1/pcbi.1005740.g003.jpg

相似文献

1
Quick tips for creating effective and impactful biological pathways using the Systems Biology Graphical Notation.使用系统生物学图形符号创建有效且有影响力的生物途径的快速提示。
PLoS Comput Biol. 2018 Feb 15;14(2):e1005740. doi: 10.1371/journal.pcbi.1005740. eCollection 2018 Feb.
2
Beacon Editor: Capturing Signal Transduction Pathways Using the Systems Biology Graphical Notation Activity Flow Language.信标编辑器：使用系统生物学图形符号活动流语言捕获信号转导途径。
J Comput Biol. 2017 Dec;24(12):1226-1229. doi: 10.1089/cmb.2017.0095. Epub 2017 Aug 28.
3
Stochastic simulation GUI for biochemical networks.用于生化网络的随机模拟图形用户界面。
Bioinformatics. 2007 Jul 15;23(14):1859-61. doi: 10.1093/bioinformatics/btm231. Epub 2007 Jun 22.
4
Resources, standards and tools for systems biology.系统生物学的资源、标准和工具。
Brief Funct Genomic Proteomic. 2007 Sep;6(3):240-51. doi: 10.1093/bfgp/elm027. Epub 2007 Oct 17.
5
Biochemical modeling with Systems Biology Graphical Notation.系统生物学图形符号的生化建模。
Drug Discov Today. 2010 May;15(9-10):365-70. doi: 10.1016/j.drudis.2010.02.012. Epub 2010 Mar 6.
6
Creating interactive, web-based and data-enriched maps with the Systems Biology Graphical Notation.使用系统生物学图形符号创建交互式、基于网络和数据丰富的地图。
Nat Protoc. 2012 Mar 1;7(3):579-93. doi: 10.1038/nprot.2012.002.
7
A graphical and computational modeling platform for biological pathways.用于生物途径的图形和计算建模平台。
Nat Protoc. 2018 Apr;13(4):705-722. doi: 10.1038/nprot.2017.144. Epub 2018 Mar 15.
8
Efficiently Encoding Complex Biochemical Models with the Multistate Model Builder (MSMB).使用多状态模型构建器（MSMB）对复杂生化模型进行高效编码。
Methods Mol Biol. 2019;1945:119-139. doi: 10.1007/978-1-4939-9102-0_5.
9
The mEPN scheme: an intuitive and flexible graphical system for rendering biological pathways.mEPN方案：一种用于呈现生物途径的直观且灵活的图形系统。
BMC Syst Biol. 2010 May 17;4:65. doi: 10.1186/1752-0509-4-65.
10
Visual setup of logical models of signaling and regulatory networks with ProMoT.使用ProMoT对信号和调控网络的逻辑模型进行可视化设置。
BMC Bioinformatics. 2006 Nov 17;7:506. doi: 10.1186/1471-2105-7-506.

引用本文的文献

1
FAIRification of computational models in biology.生物学计算模型的公平化处理
bioRxiv. 2025 Mar 24:2025.03.21.644517. doi: 10.1101/2025.03.21.644517.
2
Graph databases in systems biology: a systematic review.系统生物学中的图数据库：系统评价。
Brief Bioinform. 2024 Sep 23;25(6). doi: 10.1093/bib/bbae561.
3
Ten simple rules for creating reusable pathway models for computational analysis and visualization.用于计算分析和可视化的可复用通路模型创建的十条简单规则。

本文引用的文献

1
A fully featured COMBINE archive of a simulation study on syncytial mitotic cycles in embryos.一个关于胚胎中合胞体有丝分裂周期的模拟研究的功能齐全的COMBINE存档。
F1000Res. 2016 Sep 29;5:2421. doi: 10.12688/f1000research.9379.1. eCollection 2016.
2
Systems Biology Graphical Notation: Activity Flow language Level 1 Version 1.2.系统生物学图形表示法：活动流语言第1级版本1.2
J Integr Bioinform. 2015 Sep 4;12(2):265. doi: 10.2390/biecoll-jib-2015-265.
3
Systems Biology Graphical Notation: Entity Relationship language Level 1 Version 2.
PLoS Comput Biol. 2021 Aug 19;17(8):e1009226. doi: 10.1371/journal.pcbi.1009226. eCollection 2021 Aug.
系统生物学图形表示法：实体关系语言 第1级 第2版
J Integr Bioinform. 2015 Sep 4;12(2):264. doi: 10.2390/biecoll-jib-2015-264.
4
Systems Biology Graphical Notation: Process Description language Level 1 Version 1.3.系统生物学图形表示法：过程描述语言第1级版本1.3
J Integr Bioinform. 2015 Sep 4;12(2):263. doi: 10.2390/biecoll-jib-2015-263.
5
SBGNViz: A Tool for Visualization and Complexity Management of SBGN Process Description Maps.SBGNViz：一种用于SBGN过程描述图可视化与复杂性管理的工具。
PLoS One. 2015 Jun 1;10(6):e0128985. doi: 10.1371/journal.pone.0128985. eCollection 2015.
6
PathVisio 3: an extendable pathway analysis toolbox.PathVisio 3：一个可扩展的通路分析工具箱。
PLoS Comput Biol. 2015 Feb 23;11(2):e1004085. doi: 10.1371/journal.pcbi.1004085. eCollection 2015 Feb.
7
COMBINE archive and OMEX format: one file to share all information to reproduce a modeling project.结合存档和OMEX格式：一个文件即可共享所有信息以重现建模项目。
BMC Bioinformatics. 2014 Dec 14;15(1):369. doi: 10.1186/s12859-014-0369-z.
8
Modeling and simulation using CellDesigner.使用CellDesigner进行建模与仿真。
Methods Mol Biol. 2014;1164:121-45. doi: 10.1007/978-1-4939-0805-9_11.
9
Software support for SBGN maps: SBGN-ML and LibSBGN.软件支持 SBGN 图：SBGN-ML 和 LibSBGN。
Bioinformatics. 2012 Aug 1;28(15):2016-21. doi: 10.1093/bioinformatics/bts270. Epub 2012 May 10.
10
Reactome: a database of reactions, pathways and biological processes.Reactome：一个关于反应、通路和生物过程的数据库。
Nucleic Acids Res. 2011 Jan;39(Database issue):D691-7. doi: 10.1093/nar/gkq1018. Epub 2010 Nov 9.