• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

[研究顺式调控元件的高通量方法]

[High-throughput approaches to study cis-regulating elements].

作者信息

España Alexandre P, Santiago-Algarra David, Pradel Lydie, Spicuglia Salvatore

机构信息

Aix-Marseille Université, INSERM, TAGC, UMR 1090, 13288 Marseille, France - Équipe Labellisée Ligue Contre le Cancer, Laboratoire TAGC, INSERM U1090, Aix-Marseille Université, Parc Scientifique de Luminy, 163 avenue de Luminy, 13288 Marseille Cedex 09, France.

出版信息

Biol Aujourdhui. 2017;211(4):271-280. doi: 10.1051/jbio/2018015. Epub 2018 Jun 29.

DOI:10.1051/jbio/2018015
PMID:29956654
Abstract

Gene expression in higher eukaryotes is regulated through the involvement of transcription start site (TSS)-proximal (promoters) and -distal (enhancers) regulatory elements. Enhancer elements play an essential role during development and cell differentiation, while genetic alterations in these elements are a major cause of human disease. Here, we discuss recent advances in high-throughput approaches to identify and characterize enhancer elements, from the well-established massively parallel reporter assays to the recent clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/Cas9-based technologies. We discuss how these approaches contribute toward a better understanding of enhancer function in normal and pathological conditions.

摘要

高等真核生物中的基因表达是通过转录起始位点(TSS)近端(启动子)和远端(增强子)调控元件的参与来调节的。增强子元件在发育和细胞分化过程中起着至关重要的作用,而这些元件的基因改变是人类疾病的主要原因。在这里,我们讨论了高通量方法在识别和表征增强子元件方面的最新进展,从成熟的大规模平行报告基因检测到最近基于成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)/Cas9的技术。我们讨论了这些方法如何有助于更好地理解正常和病理条件下增强子的功能。

相似文献

1
[High-throughput approaches to study cis-regulating elements].[研究顺式调控元件的高通量方法]
Biol Aujourdhui. 2017;211(4):271-280. doi: 10.1051/jbio/2018015. Epub 2018 Jun 29.
2
Recent advances in high-throughput approaches to dissect enhancer function.剖析增强子功能的高通量方法的最新进展。
F1000Res. 2017 Jun 19;6:939. doi: 10.12688/f1000research.11581.1. eCollection 2017.
3
CRISPR-Cas9 epigenome editing enables high-throughput screening for functional regulatory elements in the human genome.CRISPR-Cas9表观基因组编辑可实现对人类基因组中功能调控元件的高通量筛选。
Nat Biotechnol. 2017 Jun;35(6):561-568. doi: 10.1038/nbt.3853. Epub 2017 Apr 3.
4
Widespread Enhancer Activity from Core Promoters.广泛的核心启动子增强子活性。
Trends Biochem Sci. 2018 Jun;43(6):452-468. doi: 10.1016/j.tibs.2018.03.004. Epub 2018 Apr 16.
5
Systematic mapping of functional enhancer-promoter connections with CRISPR interference.利用CRISPR干扰对功能性增强子-启动子连接进行系统图谱绘制。
Science. 2016 Nov 11;354(6313):769-773. doi: 10.1126/science.aag2445. Epub 2016 Sep 29.
6
Generating CRISPR/Cas9 Mediated Monoallelic Deletions to Study Enhancer Function in Mouse Embryonic Stem Cells.利用CRISPR/Cas9介导的单等位基因缺失研究小鼠胚胎干细胞中的增强子功能
J Vis Exp. 2016 Apr 2(110):e53552. doi: 10.3791/53552.
7
CRISPR Double Cutting through the Labyrinthine Architecture of 3D Genomes.CRISPR 双切割三维基因组的错综复杂结构。
J Genet Genomics. 2016 May 20;43(5):273-88. doi: 10.1016/j.jgg.2016.03.006. Epub 2016 Mar 29.
8
Analyzing CRISPR genome-editing experiments with CRISPResso.使用CRISPResso分析CRISPR基因编辑实验。
Nat Biotechnol. 2016 Jul 12;34(7):695-7. doi: 10.1038/nbt.3583.
9
CrispRVariants charts the mutation spectrum of genome engineering experiments.CrispRVariants描绘了基因组工程实验的突变谱。
Nat Biotechnol. 2016 Jul 12;34(7):701-2. doi: 10.1038/nbt.3628.
10
Gene Regulatory Elements, Major Drivers of Human Disease.基因调控元件,人类疾病的主要驱动因素。
Annu Rev Genomics Hum Genet. 2017 Aug 31;18:45-63. doi: 10.1146/annurev-genom-091416-035537. Epub 2017 Apr 7.

引用本文的文献

1
Targeting -Regulatory Elements for Rice Grain Quality Improvement.靶向调控元件以改善水稻籽粒品质
Front Plant Sci. 2021 Aug 11;12:705834. doi: 10.3389/fpls.2021.705834. eCollection 2021.