• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

如何评估蛋白质稳定性:枯草芽孢杆菌中一种调控蛋白的半衰期测定

How to Assess Protein Stability: Half-Life Determination of a Regulatory Protein in Bacillus subtilis.

作者信息

Reder Alexander, Michalik Stephan, Gerth Ulf

机构信息

Interfaculty Institute for Genetics and Functional Genomics, Greifswald University, Greifswald, Germany.

Department of Microbial Physiology and Molecular Biology, Institute for Microbiology, University Greifwald, Greifswald, Germany.

出版信息

Methods Mol Biol. 2018;1841:131-140. doi: 10.1007/978-1-4939-8695-8_10.

DOI:10.1007/978-1-4939-8695-8_10
PMID:30259484
Abstract

The half-life of a particular protein is highly variable, reaching from minutes to hours, over days and weeks to years or even a whole life time of an organism (e.g., α-crystalline of the mammalian eye). Thus, controlling protein activity by proteolysis is the most dramatic and unambiguous decision by any organism, because reconstitution of the destroyed protein activity requires an "expensive" new synthesis. To distinguish degradation from protein synthesis and accumulation only one method comes into consideration-pulse-chase labeling. In our hands, the most accurate method to track the fate of a single protein is radioactive pulse-chase labeling combined with immunoprecipitation. Besides a detailed description of the standard protocol, the general applicability as well as certain improvements of the method will be discussed here.

摘要

特定蛋白质的半衰期变化很大,从几分钟到几小时,再到数天、数周、数年,甚至是生物体的整个生命周期(例如哺乳动物眼睛中的α-晶状体蛋白)。因此,通过蛋白水解来控制蛋白质活性是任何生物体最显著且明确的决定,因为恢复被破坏的蛋白质活性需要进行“昂贵的”重新合成。为了区分蛋白质降解与合成及积累,唯一可考虑的方法是脉冲追踪标记。在我们看来,追踪单个蛋白质命运的最准确方法是放射性脉冲追踪标记结合免疫沉淀法。除了详细描述标准方案外,本文还将讨论该方法的普遍适用性以及某些改进之处。

相似文献

1
How to Assess Protein Stability: Half-Life Determination of a Regulatory Protein in Bacillus subtilis.如何评估蛋白质稳定性:枯草芽孢杆菌中一种调控蛋白的半衰期测定
Methods Mol Biol. 2018;1841:131-140. doi: 10.1007/978-1-4939-8695-8_10.
2
Stability of Proteins Out of Service: the GapB Case of Bacillus subtilis.失活蛋白质的稳定性:枯草芽孢杆菌的GapB实例
J Bacteriol. 2017 Sep 19;199(20). doi: 10.1128/JB.00148-17. Print 2017 Oct 15.
3
The ClpP peptidase is the major determinant of bulk protein turnover in Bacillus subtilis.ClpP肽酶是枯草芽孢杆菌中大量蛋白质周转的主要决定因素。
J Bacteriol. 2004 Sep;186(17):5856-64. doi: 10.1128/JB.186.17.5856-5864.2004.
4
General and regulatory proteolysis in Bacillus subtilis.枯草芽孢杆菌中的一般蛋白水解作用和调控性蛋白水解作用。
Subcell Biochem. 2013;66:73-103. doi: 10.1007/978-94-007-5940-4_4.
5
The C-Terminal Region of Bacillus subtilis SwrA Is Required for Activity and Adaptor-Dependent LonA Proteolysis.枯草芽孢杆菌 SwrA 的 C 端区域对于活性和衔接蛋白依赖性 LonA 蛋白水解是必需的。
J Bacteriol. 2018 Feb 23;200(6). doi: 10.1128/JB.00659-17. Print 2018 Mar 15.
6
Characterization of YvcC (BmrA), a multidrug ABC transporter constitutively expressed in Bacillus subtilis.YvcC(BmrA)的特性研究,YvcC是一种在枯草芽孢杆菌中组成型表达的多药ABC转运蛋白。
Biochemistry. 2004 Jun 15;43(23):7491-502. doi: 10.1021/bi0362018.
7
Adaptor-mediated Lon proteolysis restricts Bacillus subtilis hyperflagellation.衔接蛋白介导的Lon蛋白酶解作用限制枯草芽孢杆菌的过度鞭毛形成。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Jan 6;112(1):250-5. doi: 10.1073/pnas.1417419112. Epub 2014 Dec 23.
8
Oxidization without substrate unfolding triggers proteolysis of the peroxide-sensor, PerR.无底物解折叠的氧化作用会引发过氧化物传感器PerR的蛋白水解。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Jan 5;113(1):E23-31. doi: 10.1073/pnas.1522687112. Epub 2015 Dec 17.
9
Stable isotope labeling by amino acids applied to bacterial cell culture.应用于细菌细胞培养的氨基酸稳定同位素标记
Methods Mol Biol. 2014;1188:9-22. doi: 10.1007/978-1-4939-1142-4_2.
10
Pulse-chase analysis to measure protein degradation.用于测量蛋白质降解的脉冲追踪分析。
Methods Enzymol. 2014;536:65-75. doi: 10.1016/B978-0-12-420070-8.00006-4.

引用本文的文献

1
Characterization of the structural determinants of the ubiquitin-dependent proteasomal degradation of human hepatic tryptophan 2,3-dioxygenase.鉴定人类肝色氨酸 2,3-双加氧酶泛素依赖性蛋白酶体降解的结构决定因素。
Biochem J. 2021 May 28;478(10):1999-2017. doi: 10.1042/BCJ20210213.
2
In silico structural homology modeling and characterization of multiple N-terminal domains of selected bacterial Tcps.所选细菌Tcp多个N端结构域的计算机模拟结构同源性建模与表征
PeerJ. 2020 Nov 3;8:e10143. doi: 10.7717/peerj.10143. eCollection 2020.
3
The Involvement of the McsB Arginine Kinase in Clp-Dependent Degradation of the MgsR Regulator in .
McsB精氨酸激酶参与Clp依赖性降解MgsR调节因子于…… (原句结尾不完整,翻译可能不太准确,需结合完整原文进一步完善)
Front Microbiol. 2020 May 12;11:900. doi: 10.3389/fmicb.2020.00900. eCollection 2020.