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建立一种快速可靠的单管多重实时 PCR 方法用于基因分型。

Development of a rapid and reliable single-tube multiplex real-time PCR method for genotyping.

机构信息

School of Life Sciences, Northwest University, Xi'an, Shaanxi, 710069, PR China.

National Engineering Research Center for Miniaturized Detection Systems, Xi'an 710069, PR China.

出版信息

Pharmacogenomics. 2019 Jul;20(11):803-812. doi: 10.2217/pgs-2019-0052. Epub 2019 Aug 1.

DOI:10.2217/pgs-2019-0052
PMID:31368852
Abstract

is significantly associated with cutaneous adverse drug reactions caused by aromatic antiepileptic drugs. Here, we aimed to establish a fast and reliable detection method for genotyping. A single-tube multiplex quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) assay for genotyping was established by combining allele-specific primers with TaqMan probes. A 100% concordance was observed between qPCR and SBT result in 106 Han subjects. The detection limit of the new method was 0.05 ng DNA. The positive rate of in Tibetans (55.6%, n = 81) was significantly higher than those in Han (34%, n = 106), Uighur (27.5%, n = 102), Bouyei (25.9%, n = 116) and Miao populations (26.5%, n = 113). The newly established qPCR assay was reliable for screening in clinical applications.

摘要

与芳香族抗癫痫药物引起的皮肤不良反应显著相关。在此,我们旨在建立一种快速可靠的基因分型检测方法。通过将等位基因特异性引物与 TaqMan 探针相结合,建立了一种用于基因分型的单管多重实时定量聚合酶链反应(qPCR)检测方法。在 106 例汉族受试者中,qPCR 与 SBT 结果的一致性为 100%。该方法的检测限为 0.05ng DNA。新方法在藏族人群中的阳性率(55.6%,n=81)明显高于汉族人群(34%,n=106)、维吾尔族人群(27.5%,n=102)、布依族人群(25.9%,n=116)和苗族人群(26.5%,n=113)。新建立的 qPCR 检测方法在临床应用中用于筛查是可靠的。

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