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FERM 介导的 Pyk2 酪氨酸激酶自身抑制的构象动态。

Conformational Dynamics of FERM-Mediated Autoinhibition in Pyk2 Tyrosine Kinase.

机构信息

Roy J. Carver Department of Biochemistry, Biophysics, and Molecular Biology , Iowa State University , Ames , Iowa 50011 , United States.

出版信息

Biochemistry. 2019 Sep 10;58(36):3767-3776. doi: 10.1021/acs.biochem.9b00541. Epub 2019 Aug 22.

Abstract

Pyk2 is a non-receptor tyrosine kinase that evolved from gene duplication of focal adhesion kinase (FAK) and subsequent functional specialization in the brain and hemopoietic cells. Pyk2 shares a domain organization with FAK, with an N-terminal regulatory FERM domain adjoining the kinase domain. FAK regulation involves integrin-mediated membrane clustering to relieve autoinhibitory interactions between FERM and kinase domains. Pyk2 regulation remains cryptic, involving Ca influx and protein scaffolding. While the mechanism of the FAK FERM domain in autoinhibition is well-established, the regulatory role of the Pyk2 FERM is ambiguous. We probed the mechanisms of FERM-mediated autoinhibition of Pyk2 using hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry and kinase activity profiling. The results reveal FERM-kinase interfaces that are responsible for autoinhibition. Pyk2 autoinhibition impacts the activation loop conformation. In addition, the autoinhibitory FERM-kinase interface exhibits allosteric linkage with the FERM basic patch conserved in both FAK and Pyk2.

摘要

Pyk2 是一种非受体酪氨酸激酶,它由粘着斑激酶(FAK)的基因复制进化而来,并在大脑和造血细胞中具有特定的功能。Pyk2 的结构域组织与 FAK 相似,其 N 端调节 FERM 结构域与激酶结构域相邻。FAK 的调节涉及整合素介导的膜聚集,以减轻 FERM 和激酶结构域之间的自动抑制相互作用。Pyk2 的调节仍然是隐蔽的,涉及钙流入和蛋白质支架。虽然 FAK FERM 结构域在自动抑制中的作用机制已经很清楚,但 Pyk2 FERM 的调节作用尚不清楚。我们使用氢/氘交换质谱和激酶活性分析来研究 FERM 介导的 Pyk2 自动抑制的机制。结果揭示了负责自动抑制的 FERM-激酶界面。Pyk2 的自动抑制会影响激活环构象。此外,自动抑制的 FERM-激酶界面与 FAK 和 Pyk2 中都保守的 FERM 碱性斑表现出变构连接。

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