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分析壳寡糖氧化酶的结构和底物范围揭示了其对 C2 修饰的葡萄糖胺的高亲和力。

Analysis of the structure and substrate scope of chitooligosaccharide oxidase reveals high affinity for C2-modified glucosamines.

机构信息

Molecular Enzymology Group, University of Groningen, The Netherlands.

出版信息

FEBS Lett. 2020 Sep;594(17):2819-2828. doi: 10.1002/1873-3468.13854. Epub 2020 Jun 18.

DOI:10.1002/1873-3468.13854
PMID:32491191
Abstract

Chitooligosaccharide oxidase (ChitO) is a fungal carbohydrate oxidase containing a bicovalently bound FAD cofactor. The enzyme is known to catalyse the oxidation of chitooligosaccharides, oligomers of N-acetylated glucosamines derived from chitin degradation. In this study, the unique substrate acceptance was explored by testing a range of N-acetyl-d-glucosamine derivatives, revealing that ChitO preferentially accepts carbohydrates with a hydrophobic group attached to C2. The enzyme also accepts streptozotocin, a natural product used to treat tumours. Elucidation of the crystal structure provides an explanation for the high affinity towards C2-decorated glucosamines: the active site has a secondary binding pocket that accommodates groups attached at C2. Docking simulations are fully in line with the observed substrate preference. This work expands the knowledge on this versatile enzyme.

摘要

壳寡糖氧化酶(ChitO)是一种真菌糖氧还蛋白,含有双共价结合的黄素腺嘌呤二核苷酸辅因子。该酶已知能催化壳寡糖的氧化,壳寡糖是壳聚糖降解产生的 N-乙酰氨基葡萄糖的低聚物。在这项研究中,通过测试一系列 N-乙酰-d-葡萄糖胺衍生物,探索了其独特的底物接受能力,结果表明 ChitO 优先接受在 C2 上连接有疏水性基团的碳水化合物。该酶还能接受链脲佐菌素,这是一种用于治疗肿瘤的天然产物。晶体结构的阐明为其对 C2 修饰的葡萄糖胺的高亲和力提供了一个解释:活性位点有一个容纳 C2 上连接基团的二级结合口袋。对接模拟完全符合观察到的底物偏好。这项工作扩展了对这种多功能酶的认识。

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