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通过 CRISPR/Cas9n 介导的同源定向修复设计和衍生多报告基因多能干细胞系。

Design and Derivation of Multi-Reporter Pluripotent Stem Cell Lines via CRISPR/Cas9n-Mediated Homology-Directed Repair.

机构信息

Institute of Clinical Biochemistry, Hannover Medical School, Hannover, Germany.

出版信息

Curr Protoc Stem Cell Biol. 2020 Sep;54(1):e116. doi: 10.1002/cpsc.116.

DOI:10.1002/cpsc.116
PMID:32628328
Abstract

During the past decade, RNA-guided Cas9 nuclease from microbial clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR/Cas9) has become a powerful tool for gene editing of human pluripotent stem cells (PSCs). Using paired CRISPR/Cas9 nickases (CRISPR/Cas9n) it is furthermore possible to reduce off-target effects that may typically occur with traditional CRISPR/Cas9 systems while maintaining high on-target efficiencies. With this technology and a well-designed homology-directed repair vector (HDR), we are now able to integrate transgenes into specific gene loci of PSCs in an allele conserving way. In this protocol we describe CRISPR/Cas9n design and homology directed repair vector design, transfection of human pluripotent stem cells and selection and expansion of generated cell clones. © 2020 The Authors. Basic Protocol 1: Repair template design and CRISPR/Cas9n construction Basic Protocol 2: Transfection of human pluripotent stem cells by electroporation Basic Protocol 3: Genotyping of generated cell clones.

摘要

在过去的十年中,来自微生物成簇规律间隔短回文重复(CRISPR/Cas9)的 RNA 指导 Cas9 核酸酶已成为编辑人类多能干细胞(PSCs)基因的有力工具。使用成对的 CRISPR/Cas9 切口酶(CRISPR/Cas9n),还可以降低传统 CRISPR/Cas9 系统中通常会出现的脱靶效应,同时保持高靶效率。有了这项技术和精心设计的同源定向修复载体(HDR),我们现在能够以保持等位基因的方式将转基因整合到 PSCs 的特定基因座中。在本方案中,我们描述了 CRISPR/Cas9n 的设计和同源定向修复载体的设计、人多能干细胞的转染以及生成细胞克隆的选择和扩增。© 2020 作者。基本方案 1:修复模板设计和 CRISPR/Cas9n 构建 基本方案 2:电穿孔转染人多能干细胞 基本方案 3:生成细胞克隆的基因分型。

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