• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

普通松田鼠(田鼠亚科,啮齿目)的完整线粒体基因组。

The complete mitochondrial genome of the common pine vole (Arvicolinae, Rodentia).

作者信息

Bondareva Olga V, Abramson Natalia I

机构信息

Zoological Institute Russian Academy of Sciences, Saint-Petersburg, Russia.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Nov 12;4(2):3925-3926. doi: 10.1080/23802359.2019.1687026.

DOI:10.1080/23802359.2019.1687026
PMID:33366254
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7707552/
Abstract

In this paper, we report the complete mitochondrial genome of the common pine vole , which was sequenced for the first time using Illumina next-generation sequencing (NGS) technology. The total length of the mitogenome was 16,398 bp and contained 12S, 16S rRNAs, 22 tRNAs, 13 protein-coding genes, and a 883 bp D-loop in the characteristic arrangement of subfamily Arvicolinae, Rodentia. Overall base composition of the complete mitochondrial DNA is A (33.0%), C (26.5%), G (13.4%), and T (27.0%), respectively. Phylogenetic analysis of mitochondrial genomes showed a classic taxon pattern, identified using individual phylogenetic markers.

摘要

在本文中,我们报告了普通松田鼠的完整线粒体基因组,该基因组首次使用Illumina下一代测序(NGS)技术进行测序。线粒体基因组的总长度为16,398 bp,包含12S、16S rRNA、22个tRNA、13个蛋白质编码基因,以及在啮齿目田鼠亚科特征性排列中的一个883 bp的D环。完整线粒体DNA的总体碱基组成为A(33.0%)、C(26.5%)、G(13.4%)和T(27.0%)。线粒体基因组的系统发育分析显示了一种经典的分类模式,该模式是使用个体系统发育标记鉴定出来的。

相似文献

1
The complete mitochondrial genome of the common pine vole (Arvicolinae, Rodentia).普通松田鼠(田鼠亚科,啮齿目)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Nov 12;4(2):3925-3926. doi: 10.1080/23802359.2019.1687026.
2
The complete mitochondrial genomes of three mole vole species (Rodentia: Arvicolinae).三种麝鼠(啮齿目:田鼠亚科)的完整线粒体基因组
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jun 17;5(3):2485-2487. doi: 10.1080/23802359.2020.1778567.
3
Complete mitochondrial genome of the Japanese field vole (Milne-Edwards, 1872) (Rodentia: Arvicolinae).日本田鼠(Milne - Edwards,1872年)(啮齿目:田鼠亚科)的完整线粒体基因组
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Aug 25;6(9):2717-2718. doi: 10.1080/23802359.2021.1917315. eCollection 2021.
4
The complete mitochondrial genome of the common vole, (Rodentia: Arvicolinae).普通田鼠(啮齿目:田鼠亚科)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2018 Apr 4;3(1):446-447. doi: 10.1080/23802359.2018.1457994.
5
Phylogenetic relationships and taxonomic position of genus (Rodentia: Arvicolinae) from Kashmir based on evidences from analysis of mitochondrial genome and study of skull morphology.基于线粒体基因组分析和头骨形态学研究证据的克什米尔地区(啮齿目:田鼠亚科)属的系统发育关系和分类地位
PeerJ. 2020 Nov 18;8:e10364. doi: 10.7717/peerj.10364. eCollection 2020.
6
Taxonomic Interpretation of Allopatric Mammalian Forms on the Example of Two Karyoforms of Microtus (Terricola) subterraneus (Rodentia, Arvicolinae) from Eastern Europe.以东欧普通田鼠(Terricola)地下田鼠(啮齿目,田鼠亚科)的两种核型为例对异域哺乳动物形态的分类学解释
Dokl Biol Sci. 2018 May;480(1):119-123. doi: 10.1134/S0012496618030134. Epub 2018 Jul 16.
7
The Complete Mitochondrial Genome of (Tupaiidae) and Phylogeny of Scandentia.(松鼠科)的完整线粒体基因组和攀行动物的系统发育。
Genes (Basel). 2023 Mar 1;14(3):624. doi: 10.3390/genes14030624.
8
The first complete mitochondrial genome of the Microtus ochrogaster.棕色田鼠的首个完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2016 Sep;27(5):3682-3. doi: 10.3109/19401736.2015.1079854. Epub 2015 Aug 24.
9
Complete mitochondrial genome of the Père David's Vole, Eothenomys melanogaster (Rodentia: Arvicolinae).黑腹绒鼠(啮齿目:田鼠亚科)的线粒体全基因组
Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2016 Jul;27(4):2496-7. doi: 10.3109/19401736.2015.1036246. Epub 2015 May 29.
10
Characterization of the complete mitochondrial genome and phylogenetic relationship of (Rodentia: Arvicolinae).(啮齿目:田鼠亚科)线粒体全基因组特征及系统发育关系
Mitochondrial DNA B Resour. 2016 Jul 8;1(1):445-446. doi: 10.1080/23802359.2016.1180561.

引用本文的文献

1
A mitochondrial genome phylogeny of voles and lemmings (Rodentia: Arvicolinae): Evolutionary and taxonomic implications.田鼠和旅鼠的线粒体基因组系统发育(啮齿目:仓鼠科):进化和分类学意义。
PLoS One. 2021 Nov 19;16(11):e0248198. doi: 10.1371/journal.pone.0248198. eCollection 2021.
2
Mitochondrial Genome Evolution, Genetic Diversity, and Population Structure in British Water Voles ().英国水鼠的线粒体基因组进化、遗传多样性和种群结构()。
Genes (Basel). 2021 Jan 21;12(2):138. doi: 10.3390/genes12020138.
3
Phylogenetic relationships and taxonomic position of genus (Rodentia: Arvicolinae) from Kashmir based on evidences from analysis of mitochondrial genome and study of skull morphology.

本文引用的文献

1
Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data.Trimmomatic:一款适用于 Illumina 测序数据的灵活修剪工具。
Bioinformatics. 2014 Aug 1;30(15):2114-20. doi: 10.1093/bioinformatics/btu170. Epub 2014 Apr 1.
2
MITOS: improved de novo metazoan mitochondrial genome annotation.MITOS:改进的从头后生动物线粒体基因组注释。
Mol Phylogenet Evol. 2013 Nov;69(2):313-9. doi: 10.1016/j.ympev.2012.08.023. Epub 2012 Sep 7.
3
SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing.SPAdes:一种新的基因组组装算法及其在单细胞测序中的应用
基于线粒体基因组分析和头骨形态学研究证据的克什米尔地区(啮齿目:田鼠亚科)属的系统发育关系和分类地位
PeerJ. 2020 Nov 18;8:e10364. doi: 10.7717/peerj.10364. eCollection 2020.
4
Complete Mitochondrial Genome of Three Species of the Genus (Arvicolinae, Rodentia).三种田鼠属(啮齿目,田鼠亚科)物种的完整线粒体基因组
Animals (Basel). 2020 Nov 16;10(11):2130. doi: 10.3390/ani10112130.
J Comput Biol. 2012 May;19(5):455-77. doi: 10.1089/cmb.2012.0021. Epub 2012 Apr 16.