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[某兰科植物]的完整叶绿体基因组:基因组结构与进化

The complete chloroplast genome of (Orchidaceae): genome structure and evolution.

作者信息

Xie Tai-Xiang, Yu Xia, Zheng Qing-Dong, Ma Shan-Hu, Liu Zhong-Jian, Ai Ye

机构信息

Key Laboratory of National Forestry and Grassland Administration for Orchid Conservation and Utilization at College of Landscape Architecture, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Dec 10;5(1):3-4. doi: 10.1080/23802359.2019.1693935.

Abstract

is a terrestrial orchid with high ornamental value. Herein, we assembled the complete chloroplast genome of by next-generation sequencing technologies. The complete chloroplast genome sequence of is 158,305 base pairs (bp) in length, including a pair of inverted repeat regions (IRs, 25,244 bp), one large single-copy region (LSC, 86,819 bp), one small single-copy region (SSC, 20,998 bp). Besides, the complete chloroplast genome contains 136 genes in total, including 88 protein-coding genes, 38 tRNA genes, and 8 rRNA genes. Phylogenetic analysis showed that has the closest relationship with and . Our study lay a foundation for further research of .

摘要

是一种具有高观赏价值的地生兰花。在此,我们通过下一代测序技术组装了[物种名称]的完整叶绿体基因组。[物种名称]的完整叶绿体基因组序列长度为158,305碱基对(bp),包括一对反向重复区域(IRs,25,244 bp)、一个大单拷贝区域(LSC,86,819 bp)、一个小单拷贝区域(SSC,20,998 bp)。此外,完整的叶绿体基因组总共包含136个基因,包括88个蛋白质编码基因、38个tRNA基因和8个rRNA基因。系统发育分析表明,[物种名称]与[物种名称1]和[物种名称2]关系最为密切。我们的研究为[物种名称]的进一步研究奠定了基础。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/03dd/7720984/6d25345427b2/TMDN_A_1693935_F0001_B.jpg

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