• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

从中国西南部云南省一个盐矿分离出的YFCC 8621的完整线粒体基因组。

Complete mitochondrial genome of YFCC 8621 isolated from a salt mine in Yunnan, southwestern China.

作者信息

Liu Yanfang, Zhang Guodong, Wang Yao, Zhu Kongfu, Yang Wusong, Wang Yuanbing, Yu Hong

机构信息

Yunnan Herbal Laboratory, School of Life Sciences, Yunnan University, Kunming, Yunnan, China.

The International Joint Research Center for Sustainable Utilization of Cordyceps Bioresources in China and Southeast Asia, Yunnan University, Kunming, Yunnan, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jan 14;5(1):558-559. doi: 10.1080/23802359.2019.1710287.

DOI:10.1080/23802359.2019.1710287
PMID:33366645
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7748871/
Abstract

is one of the most isolated species in the genus and has a wide medical and industrial usage. Here, we first report the complete mitogenome of based on the Illumina sequencing data. The circular mitogenome is 36,768 bp in length, containing 14 protein-coding genes (PCGs), 2 ribosomal RNA (rns and rnl) genes, 2 ORFs (ORF214 and ORF240), and a set of 28 transfer RNA (tRNA) genes. The overall base composition is 35.7% A, 34.0% T(U), 15.3% C, 15.0% G, with a GC content of 30.3%. Phylogenetic analysis shows that is clustered in the order Capnodiales and is closely related to the congeneric species of Cladosporiaceae.

摘要

是该属中最孤立的物种之一,具有广泛的医学和工业用途。在此,我们首次基于Illumina测序数据报道了的完整线粒体基因组。环状线粒体基因组长度为36,768 bp,包含14个蛋白质编码基因(PCGs)、2个核糖体RNA(rns和rnl)基因、2个开放阅读框(ORF214和ORF240)以及一组28个转运RNA(tRNA)基因。总体碱基组成为35.7%的A、34.0%的T(U)、15.3%的C、15.0%的G,GC含量为30.3%。系统发育分析表明,聚类在煤炱目,与枝孢科的同属物种密切相关。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fdc6/7748871/dbafbc43af8e/TMDN_A_1710287_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fdc6/7748871/dbafbc43af8e/TMDN_A_1710287_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fdc6/7748871/dbafbc43af8e/TMDN_A_1710287_F0001_C.jpg

相似文献

1
Complete mitochondrial genome of YFCC 8621 isolated from a salt mine in Yunnan, southwestern China.从中国西南部云南省一个盐矿分离出的YFCC 8621的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jan 14;5(1):558-559. doi: 10.1080/23802359.2019.1710287.
2
Complete mitochondrial genome of zixishanense sp. nov. YFCC 8620 isolated from the spider in Yunnan, southwestern China.采自中国西南部云南省蜘蛛的新物种——紫溪山(蛛)的线粒体全基因组,YFCC 8620。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Dec 13;5(1):210-211. doi: 10.1080/23802359.2019.1699462.
3
Complete mitochondrial genome of sp. YFCC 1805002 isolated from in Baima Snow Mountain, Southwestern China.从中国西南部白马雪山的[某种生物]中分离出的YFCC 1805002的完整线粒体基因组。 (注:原文中“sp.”和“in”后面的内容缺失,翻译只能根据现有内容尽量准确表述)
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Dec 13;5(1):171-173. doi: 10.1080/23802359.2019.1698338.
4
The complete mitochondrial genome of (cladosporiaceae, dothideomycetes).(枝孢科,座囊菌纲)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2023 Jan 25;8(1):164-166. doi: 10.1080/23802359.2023.2167474. eCollection 2023.
5
The complete mitochondrial genome of (Dermateaceae: Helotiales) causing target spot.引起靶斑病的(皮盘菌科:柔膜菌目)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2023 Oct 30;8(11):1161-1164. doi: 10.1080/23802359.2023.2275831. eCollection 2023.
6
The complete mitochondrial genome of a cave-dwelling loach (Teleostei: Nemacheilidae).一种洞穴泥鳅(硬骨鱼纲:条鳅科)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Mar 26;6(3):1209-1211. doi: 10.1080/23802359.2021.1899861.
7
Complete mitochondrial genome of the important bio-control fungus (Ophiocordycipitaceae, Hypocreales) and its phylogenetic analysis.重要生防真菌(麦角菌科,肉座菌目)的线粒体全基因组及其系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Dec 13;5(1):240-242. doi: 10.1080/23802359.2019.1699466.
8
Species and ecological diversity within the Cladosporium cladosporioides complex (Davidiellaceae, Capnodiales).戴氏霉属(棒盘孢科,盘菌目)复合体中的物种和生态多样性。
Stud Mycol. 2010;67:1-94. doi: 10.3114/sim.2010.67.01.
9
Characterization of the complete mitochondrial genome of ..的完整线粒体基因组特征分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jul 29;5(3):3048-3049. doi: 10.1080/23802359.2020.1797559.
10
The complete mitochondrial genome of and implication of phylogenetic status.[物种名称]的完整线粒体基因组及其系统发育地位的意义。 (你提供的原文中“of”后面缺少具体物种信息,我根据格式推测补充了[物种名称],你可根据实际情况修改)
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jul 19;6(8):2389-2390. doi: 10.1080/23802359.2021.1950062. eCollection 2021.

引用本文的文献

1
The complete mitochondrial genome of (cladosporiaceae, dothideomycetes).(枝孢科,座囊菌纲)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2023 Jan 25;8(1):164-166. doi: 10.1080/23802359.2023.2167474. eCollection 2023.

本文引用的文献

1
Cladosporium cladosporioides from the perspectives of medical and biotechnological approaches.从医学和生物技术方法的角度看枝孢霉。
3 Biotech. 2016 Jun;6(1):4. doi: 10.1007/s13205-015-0323-4. Epub 2015 Dec 31.
2
SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing.SPAdes:一种新的基因组组装算法及其在单细胞测序中的应用
J Comput Biol. 2012 May;19(5):455-77. doi: 10.1089/cmb.2012.0021. Epub 2012 Apr 16.
3
Species and ecological diversity within the Cladosporium cladosporioides complex (Davidiellaceae, Capnodiales).
戴氏霉属(棒盘孢科,盘菌目)复合体中的物种和生态多样性。
Stud Mycol. 2010;67:1-94. doi: 10.3114/sim.2010.67.01.
4
OrganellarGenomeDRAW (OGDRAW): a tool for the easy generation of high-quality custom graphical maps of plastid and mitochondrial genomes.细胞器基因组绘图工具(OGDRAW):一种用于轻松生成高质量质体和线粒体基因组自定义图形图谱的工具。
Curr Genet. 2007 Nov;52(5-6):267-74. doi: 10.1007/s00294-007-0161-y. Epub 2007 Oct 24.
5
MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput.MUSCLE:具有高精度和高吞吐量的多序列比对。
Nucleic Acids Res. 2004 Mar 19;32(5):1792-7. doi: 10.1093/nar/gkh340. Print 2004.
6
MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models.MrBayes 3:混合模型下的贝叶斯系统发育推断。
Bioinformatics. 2003 Aug 12;19(12):1572-4. doi: 10.1093/bioinformatics/btg180.
7
Black fungi: clinical and pathogenic approaches.黑色真菌:临床与致病学研究方法
Med Mycol. 2000;38 Suppl 1:243-50.
8
The medically important dematiaceous fungi and their identification.具有医学重要性的暗色丝孢菌及其鉴定
Mycoses. 1991 Jan-Feb;34(1-2):1-18. doi: 10.1111/j.1439-0507.1991.tb00613.x.