• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

唇形科刺蕊草族单型属植物Rchb. 的完整质体基因组特征

Characterization of the complete plastid genome of Rchb., a monotypic genus of Pogostemoneae, Lamiaceae.

作者信息

Wu Yongbin, Yao Gang

机构信息

College of Forestry and Landscape Architecture, South China Agricultural University, Guangzhou, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jul 23;5(3):2974-2975. doi: 10.1080/23802359.2020.1793700.

DOI:10.1080/23802359.2020.1793700
PMID:33458021
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7782610/
Abstract

Rchb. is a monotypic genus of Lamiaceae. In this study, the complete plastid genome of the species (Link) Kuntze was sequenced and assembled. The plastid genome obtained is 152,521 bp in length, including a pair of inverted repeat (IRa and IRb) regions of 25,596 bp, a large single-copy (LSC) region of 83,690 bp, and a small single-copy (SSC) region of 17,639 bp. The genome encoded 113 unique genes, including 79 protein-coding genes, 4 ribosomal RNA genes, and 30 transfer RNA genes. The overall GC content of the genome obtained is 38.29%. The phylogenetic analysis based on 37 plastid genome of Lamiaceae revealed that the genus was sister to the - clade with strong support.

摘要

Rchb. 是唇形科的一个单型属。在本研究中,对该物种(Link)Kuntze 的完整质体基因组进行了测序和组装。获得的质体基因组长度为 152,521 bp,包括一对长度为 25,596 bp 的反向重复(IRa 和 IRb)区域、一个长度为 83,690 bp 的大单拷贝(LSC)区域和一个长度为 17,639 bp 的小单拷贝(SSC)区域。该基因组编码 113 个独特基因,包括 79 个蛋白质编码基因、4 个核糖体 RNA 基因和 30 个转运 RNA 基因。获得的基因组的总体 GC 含量为 38.29%。基于唇形科 37 个质体基因组的系统发育分析表明,该属与 - 分支是姐妹关系,支持度很高。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5bb7/7782610/4fc0309d14ad/TMDN_A_1793700_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5bb7/7782610/4fc0309d14ad/TMDN_A_1793700_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5bb7/7782610/4fc0309d14ad/TMDN_A_1793700_F0001_B.jpg

相似文献

1
Characterization of the complete plastid genome of Rchb., a monotypic genus of Pogostemoneae, Lamiaceae.唇形科刺蕊草族单型属植物Rchb. 的完整质体基因组特征
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jul 23;5(3):2974-2975. doi: 10.1080/23802359.2020.1793700.
2
Complete plastid genome sequence of a medical herb, (L.) Kuntze (Lamiaceae).一种药用草本植物紫苏(唇形科)的完整质体基因组序列。 (此处括号内原文未完整给出信息,推测是紫苏的完整学名,括号里应该是紫苏学名里除了“(L.) Kuntze”之外的其他部分,例如紫苏的属名等,因原文缺失暂无法补充完整准确学名)
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Aug 27;4(2):2782-2783. doi: 10.1080/23802359.2019.1659112.
3
Complete plastid genome sequences of Nakai (Oleaceae), a Korea endemic genus.韩国特有属梣叶槭属(木犀科)的完整质体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2016 Aug 31;1(1):596-598. doi: 10.1080/23802359.2016.1202741.
4
Characterization of the complete plastid genome of (Caryophyllaceae), an endangered medical herb endemic to south-western China.中国西南部特有的濒危药用草本植物银柴胡(石竹科)完整质体基因组的特征分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Sep 2;4(2):2798-2799. doi: 10.1080/23802359.2019.1659120.
5
Systematic Placement of the Enigmatic Southeast Asian Genus and an Updated Phylogeny of Tribe Pogostemoneae (Lamiaceae Subfamily Lamioideae).神秘东南亚属的系统定位及刺蕊草族(唇形科筋骨草亚科)的更新系统发育
Front Plant Sci. 2021 Apr 16;12:646133. doi: 10.3389/fpls.2021.646133. eCollection 2021.
6
Characterization of the complete plastid genome of (Apocynaceae), with its phylogenetic analysis.夹竹桃科(Apocynaceae)植物完整质体基因组的特征及其系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Nov 21;4(2):4190-4191. doi: 10.1080/23802359.2019.1693287.
7
Complete plastid genome sequence of (Schltr.) Szlach. (Orchidaceae), an endemic herb in China.中国特有草本植物火烧兰(Schltr.)Szlach.(兰科)的完整质体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Mar 1;6(2):703-704. doi: 10.1080/23802359.2020.1851150.
8
Characterization of the complete plastid genome of (Lamiaceae), a species endemic to Yunnan Province of China.唇形科(中国云南省特有物种)完整质体基因组的特征分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 May 6;7(5):758-760. doi: 10.1080/23802359.2022.2069521. eCollection 2022.
9
The complete chloroplast genome and phylogenetic analysis of Briq. 1896 (Nepetoideae, Lamiaceae).布里奇1896年(唇形科荆芥亚科)的完整叶绿体基因组及系统发育分析。
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Jul 22;7(7):1342-1344. doi: 10.1080/23802359.2022.2098860. eCollection 2022.
10
The complete plastid genome of Chun (Leguminosae).春(豆科)的完整质体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Sep 5;4(2):2926-2927. doi: 10.1080/23802359.2019.1660266.

本文引用的文献

1
PGA: a software package for rapid, accurate, and flexible batch annotation of plastomes.PGA:一个用于叶绿体基因组快速、准确且灵活批量注释的软件包。
Plant Methods. 2019 May 21;15:50. doi: 10.1186/s13007-019-0435-7. eCollection 2019.
2
A large-scale chloroplast phylogeny of the Lamiaceae sheds new light on its subfamilial classification.大规模唇形科叶绿体系统发育研究对其亚科分类提出了新的见解。
Sci Rep. 2016 Oct 17;6:34343. doi: 10.1038/srep34343.
3
Phylogenetic relationships, character evolution and biogeographic diversification of Pogostemon s.l. (Lamiaceae).
广义刺蕊草属(唇形科)的系统发育关系、性状演化及生物地理分化
Mol Phylogenet Evol. 2016 May;98:184-200. doi: 10.1016/j.ympev.2016.01.020. Epub 2016 Feb 23.