• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

淡水虾（甲壳纲：长臂虾科）的完整线粒体基因组

Complete mitochondrial genome of the freshwater prawn (Crustacea: Palaemonidae).

作者信息

Wood Louisa E, De Grave Sammy, van Heerden Carel J, Daniels Savel R

机构信息

Department of Botany and Zoology, University of Stellenbosch, Stellenbosch, South Africa.

Oxford University Museum of Natural History, Oxford, UK.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2017 Oct 17;2(2):742-743. doi: 10.1080/23802359.2017.1390400.

DOI:10.1080/23802359.2017.1390400
PMID:33473966
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7800094/
Abstract

The complete mitogenome of is presented here. The mitogenome is 15,925 bp in length and comprises 13 protein coding genes, 2 ribosomal subunit genes, 22 transfer RNAs, and a non-coding AT-rich region. The PCGs were used to perform a phylogenetic analysis together with other Caridea representatives with mitogenome data from GenBank, placing sister to a clade comprising , , and in the family Palaemonidae.

摘要

这里展示了[物种名称]的完整线粒体基因组。该线粒体基因组长度为15,925 bp，包含13个蛋白质编码基因、2个核糖体亚基基因、22个转运RNA以及一个富含AT的非编码区域。利用这些蛋白质编码基因与来自GenBank的其他具有线粒体基因组数据的十足目虾类代表物种一起进行系统发育分析，结果显示[物种名称]与长臂虾科中包含[其他物种名称1]、[其他物种名称2]和[其他物种名称3]的一个进化枝亲缘关系最近。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d817/7800094/6169a46e8bdd/TMDN_A_1390400_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d817/7800094/6169a46e8bdd/TMDN_A_1390400_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d817/7800094/6169a46e8bdd/TMDN_A_1390400_F0001_B.jpg

相似文献

1
Complete mitochondrial genome of the freshwater prawn (Crustacea: Palaemonidae).淡水虾（甲壳纲：长臂虾科）的完整线粒体基因组
Mitochondrial DNA B Resour. 2017 Oct 17;2(2):742-743. doi: 10.1080/23802359.2017.1390400.
2
The complete mitogenome of the rock pool prawn Palaemon serenus (Heller, 1862) (Crustacea: Decapoda: Palaemonidae).岩池对虾（Palaemon serenus，赫勒，1862年）（甲壳纲：十足目：长臂虾科）的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2016 Sep;27(5):3155-6. doi: 10.3109/19401736.2015.1007311. Epub 2015 Feb 19.
3
Complete mitochondrial genome of Palaemon gravieri (Yu, 1930) (Crustacea: Decapoda: Palaemonidae).葛氏长臂虾（于，1930年）（甲壳纲：十足目：长臂虾科）的完整线粒体基因组
Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2017 Mar;28(2):277-278. doi: 10.3109/19401736.2015.1118078. Epub 2015 Dec 29.
4
Comparison of Mitochondrial Genome Sequences between Two Species of the Family Palaemonidae (Decapoda: Caridea): Gene Rearrangement and Phylogenetic Implications.两种对虾科（十足目：对虾科）线粒体基因组序列的比较：基因重排与系统发育意义。
Genes (Basel). 2023 Jul 22;14(7):1499. doi: 10.3390/genes14071499.
5
Complete mitochondrial genome of and its phylogenetic consideration.[物种名称]的完整线粒体基因组及其系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Nov 22;4(2):4223-4224. doi: 10.1080/23802359.2019.1693934.
6
The complete mitochondrial genome of the ridgetail white prawn Exopalaemon carinicauda Holthuis, 1950 (Crustacean: Decapoda: Palaemonidae) revealed a novel rearrangement of tRNA genes.中华尾对虾（Exopalaemon carinicauda Holthuis，1950）（甲壳纲：十足目：长臂虾科）的完整线粒体基因组揭示了tRNA基因的一种新重排。
Gene. 2009 May 15;437(1-2):1-8. doi: 10.1016/j.gene.2009.02.014. Epub 2009 Mar 5.
7
Mitogenome phylogenetics in the genus Palaemon (Crustacea: Decapoda) sheds light on species crypticism in the rockpool shrimp P. elegans.线粒体基因组系统发育在 Palaemon 属（甲壳纲：十足目）中揭示了岩石池虾 Palaemon elegans 中的物种隐密性。
PLoS One. 2020 Aug 18;15(8):e0237037. doi: 10.1371/journal.pone.0237037. eCollection 2020.
8
The complete mitochondrial genome of the South American freshwater crayfish, (Crustacea, Decapoda, Parastacidae).南美淡水小龙虾（甲壳纲，十足目，拟螯虾科）的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Dec 12;5(1):208-209. doi: 10.1080/23802359.2019.1699457.
9
Complete mitochondrial genome of the Japanese snapping shrimp Alpheus japonicus (Crustacea: Decapoda: Caridea): gene rearrangement and phylogeny within Caridea.日本鼓虾线粒体基因组全序列（十足目：虾蛄目：虾蛄科）：虾蛄目内的基因重排和系统发育。
Sci China Life Sci. 2012 Jul;55(7):591-8. doi: 10.1007/s11427-012-4348-1. Epub 2012 Aug 4.
10
The complete mitochondrial genome of the mysid shrimp, Neomysis japonica (Crustacea, Malacostraca, Mysida).日本新糠虾（甲壳纲，软甲亚纲，糠虾目）的线粒体全基因组
Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2016 Jul;27(4):2781-2. doi: 10.3109/19401736.2015.1053064. Epub 2015 Jun 26.

引用本文的文献

1
Complete mitochondrial genome of and its phylogenetic consideration.[物种名称]的完整线粒体基因组及其系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Nov 22;4(2):4223-4224. doi: 10.1080/23802359.2019.1693934.
2
Mitogenome phylogenetics in the genus Palaemon (Crustacea: Decapoda) sheds light on species crypticism in the rockpool shrimp P. elegans.线粒体基因组系统发育在 Palaemon 属（甲壳纲：十足目）中揭示了岩石池虾 Palaemon elegans 中的物种隐密性。
PLoS One. 2020 Aug 18;15(8):e0237037. doi: 10.1371/journal.pone.0237037. eCollection 2020.
3
Mitochondrial genome of Chinese grass shrimp, Palaemonetes sinensis and comparison with other Palaemoninae species.

本文引用的文献

1
Phylogeographic patterning among two codistributed shrimp species (Crustacea: Decapoda: Palaemonidae) reveals high levels of connectivity across biogeographic regions along the South African coast.两种同域分布的虾类物种（甲壳纲：十足目：长臂虾科）之间的系统发育地理学模式揭示了南非沿海生物地理区域间的高连通性。
PLoS One. 2017 Mar 10;12(3):e0173356. doi: 10.1371/journal.pone.0173356. eCollection 2017.
2
Complete mitochondrial genome of Palaemon gravieri (Yu, 1930) (Crustacea: Decapoda: Palaemonidae).葛氏长臂虾（于，1930年）（甲壳纲：十足目：长臂虾科）的完整线粒体基因组
Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2017 Mar;28(2):277-278. doi: 10.3109/19401736.2015.1118078. Epub 2015 Dec 29.
3
中国草虾（Palaemonetes sinensis）的线粒体基因组与其他对虾科物种的比较。
Sci Rep. 2019 Nov 21;9(1):17301. doi: 10.1038/s41598-019-53539-x.
The complete mitogenome of the rock pool prawn Palaemon serenus (Heller, 1862) (Crustacea: Decapoda: Palaemonidae).
岩池对虾（Palaemon serenus，赫勒，1862年）（甲壳纲：十足目：长臂虾科）的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2016 Sep;27(5):3155-6. doi: 10.3109/19401736.2015.1007311. Epub 2015 Feb 19.
4
MITOS: improved de novo metazoan mitochondrial genome annotation.MITOS：改进的从头后生动物线粒体基因组注释。
Mol Phylogenet Evol. 2013 Nov;69(2):313-9. doi: 10.1016/j.ympev.2012.08.023. Epub 2012 Sep 7.
5
Partitionfinder: combined selection of partitioning schemes and substitution models for phylogenetic analyses.Partitionfinder：用于系统发育分析的分区方案和替代模型的联合选择。
Mol Biol Evol. 2012 Jun;29(6):1695-701. doi: 10.1093/molbev/mss020. Epub 2012 Jan 20.
6
The complete mitochondrial genome of the ridgetail white prawn Exopalaemon carinicauda Holthuis, 1950 (Crustacean: Decapoda: Palaemonidae) revealed a novel rearrangement of tRNA genes.中华尾对虾（Exopalaemon carinicauda Holthuis，1950）（甲壳纲：十足目：长臂虾科）的完整线粒体基因组揭示了tRNA基因的一种新重排。
Gene. 2009 May 15;437(1-2):1-8. doi: 10.1016/j.gene.2009.02.014. Epub 2009 Mar 5.
7
Improvement of phylogenies after removing divergent and ambiguously aligned blocks from protein sequence alignments.从蛋白质序列比对中去除分歧和比对不明确的区域后系统发育树的改进。
Syst Biol. 2007 Aug;56(4):564-77. doi: 10.1080/10635150701472164.
8
Complete mitochondrial DNA sequences of the decapod crustaceans Pseudocarcinus gigas (Menippidae) and Macrobrachium rosenbergii (Palaemonidae).十足目甲壳动物巨大拟滨蟹（绵蟹科）和罗氏沼虾（对虾科）的完整线粒体DNA序列。
Mar Biotechnol (NY). 2005 Jul-Aug;7(4):339-49. doi: 10.1007/s10126-004-4077-8.
9
MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput.MUSCLE：具有高精度和高吞吐量的多序列比对。
Nucleic Acids Res. 2004 Mar 19;32(5):1792-7. doi: 10.1093/nar/gkh340. Print 2004.
10
Selection of conserved blocks from multiple alignments for their use in phylogenetic analysis.从多序列比对中选择保守区域用于系统发育分析。
Mol Biol Evol. 2000 Apr;17(4):540-52. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a026334.