• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

(德哈恩,1835年)(十足目,弓蟹科)的完整线粒体基因组。

The complete mitochondrial genome of (De Haan, 1835) (Decapoda, Varunidae).

作者信息

Karagozlu Mustafa Zafer, Kim Jung-Il, Choi Tae-June, Dinh Thinh Do, Kim Chang-Bae

机构信息

Department of Biotechnology, Sangmyung University, Seoul, Korea.

Institute of Marine Environment and Resources, Vietnam Academy of Science and Technology, Haiphong, Vietnam.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2018 Feb 23;3(1):261-262. doi: 10.1080/23802359.2018.1443037.

DOI:10.1080/23802359.2018.1443037
PMID:33474135
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7800518/
Abstract

is a small grapsoid crab which is found in Japan, Taiwan, Korea, and China coasts. In this study a complete mitogenome of Korean was analyzed and phylogenetic relationships in the family Varunidae were investigated. The mitogenome size is 16,486 bp with 34.1% A, 18.1% C, 11.4% G, and 36.4% T nucleotide distributions. Genome structure and gene orientations are identical with previous records from the family and mitochondrial protein-coding gene based phylogenetic tree suggested that the closest species to is . This is the second complete mitogenome record from the genus and the first record for the species.

摘要

是一种小型的方蟹科螃蟹,分布于日本、台湾、韩国和中国沿海。在本研究中,分析了韩国[该物种名称未给出]的完整线粒体基因组,并研究了梭子蟹科的系统发育关系。线粒体基因组大小为16486 bp,核苷酸分布为A占34.1%、C占18.1%、G占11.4%、T占36.4%。基因组结构和基因方向与该科先前记录一致,基于线粒体蛋白质编码基因的系统发育树表明,与[该物种名称未给出]最接近的物种是[该物种名称未给出]。这是该属的第二个完整线粒体基因组记录,也是该物种的第一个记录。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9902/7800518/aaa0e8097c4f/TMDN_A_1443037_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9902/7800518/aaa0e8097c4f/TMDN_A_1443037_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9902/7800518/aaa0e8097c4f/TMDN_A_1443037_F0001_B.jpg

相似文献

1
The complete mitochondrial genome of (De Haan, 1835) (Decapoda, Varunidae).(德哈恩,1835年)(十足目,弓蟹科)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2018 Feb 23;3(1):261-262. doi: 10.1080/23802359.2018.1443037.
2
The complete mitochondrial genome of Hemigrapsus sinensis (Brachyura, Grapsoidea, Varunidae) and its phylogenetic position within Grapsoidea.中华绒螯蟹(短尾派,方蟹总科,弓蟹科)的线粒体全基因组及其在方蟹总科中的系统发育位置。
Genes Genomics. 2023 Mar;45(3):377-391. doi: 10.1007/s13258-022-01319-9. Epub 2022 Nov 8.
3
The complete mitogenome of purple mottled shore crab Cyclograpsus granulosus H. Milne-Edwards, 1853 (Crustacea: Decapoda: Grapsoidea).紫斑岸蟹(Cyclograpsus granulosus H. Milne-Edwards,1853)(甲壳纲:十足目:方蟹总科)的完整线粒体基因组
Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2016 Nov;27(6):3981-3982. doi: 10.3109/19401736.2014.989514. Epub 2014 Dec 26.
4
Phylogeographic studies on two shore crab species from East Asia: similar but different stories.东亚两种滨蟹的系统地理学研究:似曾相识,却又不尽相同。
Genes Genomics. 2019 Oct;41(10):1127-1134. doi: 10.1007/s13258-019-00831-9. Epub 2019 Jun 17.
5
Complete mitochondrial genome of Ortmann, 1894 (Crustacea: Decapoda: Grapsoidea) specimen collected in South Korea.1894年奥尔特曼(甲壳纲:十足目:方蟹总科)线粒体全基因组,该样本采集于韩国。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jan 5;6(1):1-2. doi: 10.1080/23802359.2020.1842265.
6
The complete mitochondrial genome of pronghorn spiny lobster (Olivier, 1791).叉角刺龙虾(奥利维尔,1791年)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jan 17;6(1):148-150. doi: 10.1080/23802359.2020.1852899.
7
Phylogenetic relationships of Grapsoidea and insights into the higher phylogeny of Brachyuran.长足目动物的系统发育关系及对短尾下目高级系统发育的认识。
Genomics. 2021 Jan;113(1 Pt 2):429-439. doi: 10.1016/j.ygeno.2020.08.033. Epub 2020 Sep 2.
8
Analysis of complete mitochondrial genome of fiddler crab (De Haan, 1835) (Arthropoda, Malacostraca, Decapoda).招潮蟹(德哈恩,1835年)(节肢动物门,软甲纲,十足目)线粒体全基因组分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2016 Nov 11;1(1):835-836. doi: 10.1080/23802359.2016.1247673.
9
The complete mitochondrial genome of (Herbst, 1783) (Decapoda, Grapsidae).(赫布斯特,1783年)(十足目,方蟹科)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2016 Jul 8;1(1):441-442. doi: 10.1080/23802359.2016.1180559.
10
, A New Species of Varunid Mud Crab (Brachyura, Decapoda, Grapsoidea) from the Ryukyus, Japan.来自日本琉球的一种新的黄道蟹科泥蟹(短尾派,十足目,方蟹总科)
Zool Stud. 2018 Apr 10;57:e15. doi: 10.6620/ZS.2018.57-15. eCollection 2018.

引用本文的文献

1
The First Complete Mitochondrial Genome of (Decapoda: Brachyura: Goneplacidae) and Phylogenetic Relationships within Infraorder Brachyura.十足目(甲壳纲:短尾亚目:真短尾派)异尾下目蟹的首个完整线粒体基因组和短尾亚目内的系统发育关系。
Genes (Basel). 2022 Jun 23;13(7):1127. doi: 10.3390/genes13071127.

本文引用的文献

1
MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets.MEGA7:适用于更大数据集的分子进化遗传学分析版本7.0
Mol Biol Evol. 2016 Jul;33(7):1870-4. doi: 10.1093/molbev/msw054. Epub 2016 Mar 22.
2
Reconstructing mitochondrial genomes directly from genomic next-generation sequencing reads--a baiting and iterative mapping approach.直接从基因组下一代测序读段重建线粒体基因组——一种诱饵和迭代映射方法。
Nucleic Acids Res. 2013 Jul;41(13):e129. doi: 10.1093/nar/gkt371. Epub 2013 May 9.
3
MITOS: improved de novo metazoan mitochondrial genome annotation.
MITOS:改进的从头后生动物线粒体基因组注释。
Mol Phylogenet Evol. 2013 Nov;69(2):313-9. doi: 10.1016/j.ympev.2012.08.023. Epub 2012 Sep 7.