• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
DeepGOPlus: improved protein function prediction from sequence.DeepGOPlus：基于序列改进蛋白质功能预测
Bioinformatics. 2021 May 23;37(8):1187. doi: 10.1093/bioinformatics/btaa763.
2
DeepGOPlus: improved protein function prediction from sequence.DeepGOPlus：从序列中改进蛋白质功能预测。
Bioinformatics. 2020 Jan 15;36(2):422-429. doi: 10.1093/bioinformatics/btz595.
3
PANDA2: protein function prediction using graph neural networks.PANDA2：使用图神经网络进行蛋白质功能预测
NAR Genom Bioinform. 2022 Feb 2;4(1):lqac004. doi: 10.1093/nargab/lqac004. eCollection 2022 Mar.
4
Align-gram: Rethinking the Skip-gram Model for Protein Sequence Analysis.Align-gram：重新思考用于蛋白质序列分析的Skip-gram模型
Protein J. 2023 Apr;42(2):135-146. doi: 10.1007/s10930-023-10096-7. Epub 2023 Mar 28.
5
Three-level prediction of protein function by combining profile-sequence search, profile-profile search, and domain co-occurrence networks.通过组合序列轮廓搜索、轮廓轮廓搜索和域共同出现网络，实现蛋白质功能的三级预测。
BMC Bioinformatics. 2013;14 Suppl 3(Suppl 3):S3. doi: 10.1186/1471-2105-14-S3-S3. Epub 2013 Feb 28.
6
Improved Prediction of Protein-Protein Interaction Mapping on by Using Amino Acid Sequence Features in a Supervised Learning Framework.利用监督学习框架中的氨基酸序列特征改进蛋白质相互作用预测映射。
Protein Pept Lett. 2021;28(1):74-83. doi: 10.2174/0929866527666200610141258.
7
An Improved Protein Structural Classes Prediction Method by Incorporating Both Sequence and Structure Information.一种通过整合序列和结构信息改进的蛋白质结构类别预测方法。
IEEE Trans Nanobioscience. 2015 Jun;14(4):339-349. doi: 10.1109/TNB.2014.2352454. Epub 2014 Sep 15.
8
The Recipe for Protein Sequence-Based Function Prediction and Its Implementation in the ANNOTATOR Software Environment.基于蛋白质序列的功能预测方法及其在注释器软件环境中的实现
Methods Mol Biol. 2016;1415:477-506. doi: 10.1007/978-1-4939-3572-7_25.
9
Method for prediction of protein function from sequence using the sequence-to-structure-to-function paradigm with application to glutaredoxins/thioredoxins and T1 ribonucleases.使用序列-结构-功能范式从序列预测蛋白质功能的方法及其在谷氧还蛋白/硫氧还蛋白和T1核糖核酸酶中的应用。
J Mol Biol. 1998 Sep 4;281(5):949-68. doi: 10.1006/jmbi.1998.1993.
10
Single-sequence-based prediction of protein secondary structures and solvent accessibility by deep whole-sequence learning.基于单序列的深度学习全序列预测蛋白质二级结构和溶剂可及性。
J Comput Chem. 2018 Oct 5;39(26):2210-2216. doi: 10.1002/jcc.25534. Epub 2018 Oct 14.

引用本文的文献

1
VO: The Vaccine Ontology.VO：疫苗本体论。
bioRxiv. 2025 Aug 15:2025.08.12.669998. doi: 10.1101/2025.08.12.669998.
2
EZpred: improving deep learning-based enzyme function prediction using unlabeled sequence homologs.EZpred：利用未标记的序列同源物改进基于深度学习的酶功能预测
bioRxiv. 2025 Jul 14:2025.07.09.663945. doi: 10.1101/2025.07.09.663945.
3
GOBeacon: An ensemble model for protein function prediction enhanced by contrastive learning.GOBeacon：一种通过对比学习增强的蛋白质功能预测集成模型。
Protein Sci. 2025 Jul;34(7):e70182. doi: 10.1002/pro.70182.
4
BERT-DomainAFP: Antifreeze protein recognition and classification model based on BERT and structural domain annotation.BERT-DomainAFP：基于BERT和结构域注释的抗冻蛋白识别与分类模型
iScience. 2025 Mar 6;28(4):112077. doi: 10.1016/j.isci.2025.112077. eCollection 2025 Apr 18.
5
ProtNote: a multimodal method for protein-function annotation.ProtNote：一种用于蛋白质功能注释的多模态方法。
Bioinformatics. 2025 May 6;41(5). doi: 10.1093/bioinformatics/btaf170.
6
Systematic representation and optimization enable the inverse design of cross-species regulatory sequences in bacteria.系统的表征和优化能够实现细菌中跨物种调控序列的逆向设计。
Nat Commun. 2025 Feb 19;16(1):1763. doi: 10.1038/s41467-025-57031-1.
7
Learning a generalized graph transformer for protein function prediction in dissimilar sequences.学习用于预测不同序列中蛋白质功能的广义图变换器。
Gigascience. 2024 Jan 2;13. doi: 10.1093/gigascience/giae093.
8
Progress and Prospects for a Nucleic Acid Screening Test Set.核酸筛查检测套装的进展与前景
Appl Biosaf. 2024 Sep 18;29(3):133-141. doi: 10.1089/apb.2023.0033. eCollection 2024 Sep.
9
A large-scale assessment of sequence database search tools for homology-based protein function prediction.基于序列数据库搜索工具的大规模评估用于同源蛋白功能预测。
Brief Bioinform. 2024 May 23;25(4). doi: 10.1093/bib/bbae349.
10
DualNetGO: a dual network model for protein function prediction via effective feature selection.DualNetGO：一种通过有效特征选择进行蛋白质功能预测的双网络模型。
Bioinformatics. 2024 Jul 1;40(7). doi: 10.1093/bioinformatics/btae437.

DeepGOPlus: improved protein function prediction from sequence.

作者信息

Kulmanov Maxat, Hoehndorf Robert

出版信息

Bioinformatics. 2021 May 23;37(8):1187. doi: 10.1093/bioinformatics/btaa763.

DOI:10.1093/bioinformatics/btaa763
PMID:34009304
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8150137/
Abstract
摘要