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基于快速MAS下氢检测碳双量子谱的固态核磁共振蛋白质共振归属

Protein resonance assignment by solid-state NMR based on H-detected C double-quantum spectroscopy at fast MAS.

作者信息

Lends Alons, Berbon Mélanie, Habenstein Birgit, Nishiyama Yusuke, Loquet Antoine

机构信息

CNRS, Chemistry and Biology of Membranes and Nanoobjects (CBMN), UMR 5348, Institut Europeen de Chimie et Biologie (IECB), University of Bordeaux, 33600, Pessac, France.

RIKEN-JEOL Collaboration Center, RIKEN, Yokohama, Kanagawa, 230-0045, Japan.

出版信息

J Biomol NMR. 2021 Dec;75(10-12):417-427. doi: 10.1007/s10858-021-00386-6. Epub 2021 Nov 23.

DOI:10.1007/s10858-021-00386-6
PMID:34813018
Abstract

Solid-state NMR spectroscopy is a powerful technique to study insoluble and non-crystalline proteins and protein complexes at atomic resolution. The development of proton (H) detection at fast magic-angle spinning (MAS) has considerably increased the analytical capabilities of the technique, enabling the acquisition of H-detected fingerprint experiments in few hours. Here an approach based on double-quantum (DQ) C spectroscopy, detected on H, is proposed for fast MAS regime (> 60 kHz) to perform the sequential assignment of insoluble proteins of small size, without any specific deuteration requirement. By combining two three-dimensional H detected experiments correlating a C DQ dimension respectively to its intra-residue and sequential  N-H pairs, a sequential walk through DQ (Ca + CO) resonance is obtained. The approach takes advantage of fast MAS to achieve an efficient sensitivity and the addition of a DQ dimension provides spectral features useful for the resonance assignment process.

摘要

固态核磁共振光谱是一种在原子分辨率下研究不溶性和非晶态蛋白质及蛋白质复合物的强大技术。快速魔角旋转(MAS)下质子(H)检测技术的发展极大地提高了该技术的分析能力,能够在数小时内完成H检测指纹实验。本文提出了一种基于在H上检测的双量子(DQ)C光谱的方法,用于快速MAS模式(>60 kHz),以对小尺寸不溶性蛋白质进行序列归属,且无需任何特定的氘代要求。通过结合两个三维H检测实验,分别将一个C DQ维度与其残基内和序列上的N-H对相关联,从而实现通过DQ(Ca + CO)共振的序列步移。该方法利用快速MAS实现了高效的灵敏度,并且增加一个DQ维度提供了对共振归属过程有用的光谱特征。

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