• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

硬球的高效事件驱动模拟。

Efficient event-driven simulations of hard spheres.

机构信息

Laboratoire de Physique des Solides, CNRS, Université Paris-Saclay, 91405, Orsay, France.

出版信息

Eur Phys J E Soft Matter. 2022 Mar 10;45(3):22. doi: 10.1140/epje/s10189-022-00180-8.

DOI:10.1140/epje/s10189-022-00180-8
PMID:35274181
Abstract

Hard spheres are arguably one of the most fundamental model systems in soft matter physics, and hence a common topic of simulation studies. Event-driven simulation methods provide an efficient method for studying the phase behavior and dynamics of hard spheres under a wide range of different conditions. Here, we examine the impact of several optimization strategies for speeding up event-driven molecular dynamics of hard spheres and present a light-weight simulation code that outperforms existing simulation codes over a large range of system sizes and packing fractions. The presented differences in simulation speed, typically a factor of five to ten, save significantly on both CPU time and energy consumption and may be a crucial factor for studying slow processes such as crystal nucleation and glassy dynamics.

摘要

硬球可以说是软物质物理中最基础的模型体系之一,因此也是模拟研究的常见主题。事件驱动模拟方法为研究在广泛不同条件下硬球的相行为和动力学提供了一种有效的方法。在这里,我们研究了几种优化策略对加速硬球事件驱动分子动力学的影响,并提出了一个轻量级的模拟代码,在很大的系统尺寸和堆积分数范围内优于现有的模拟代码。模拟速度的差异通常在五到十倍之间,这在 CPU 时间和能量消耗方面都有显著的节省,对于研究晶体成核和玻璃动力学等缓慢过程可能是一个关键因素。

相似文献

1
Efficient event-driven simulations of hard spheres.硬球的高效事件驱动模拟。
Eur Phys J E Soft Matter. 2022 Mar 10;45(3):22. doi: 10.1140/epje/s10189-022-00180-8.
2
Macromolecular crowding: chemistry and physics meet biology (Ascona, Switzerland, 10-14 June 2012).大分子拥挤现象:化学与物理邂逅生物学(瑞士阿斯科纳,2012年6月10日至14日)
Phys Biol. 2013 Aug;10(4):040301. doi: 10.1088/1478-3975/10/4/040301. Epub 2013 Aug 2.
3
Efficient equilibration of hard spheres with Newtonian event chains.硬球与牛顿事件链的高效平衡。
J Chem Phys. 2019 May 7;150(17):174108. doi: 10.1063/1.5090882.
4
Crystallization in suspensions of hard spheres: a Monte Carlo and molecular dynamics simulation study.硬球悬浮液中的结晶:蒙特卡罗和分子动力学模拟研究。
J Phys Condens Matter. 2011 May 18;23(19):194120. doi: 10.1088/0953-8984/23/19/194120. Epub 2011 Apr 27.
5
Crystal nucleation of colloidal hard dumbbells.胶体硬哑铃的成核结晶。
J Chem Phys. 2011 Jan 21;134(3):034501. doi: 10.1063/1.3528222.
6
Proceedings of the Second Workshop on Theory meets Industry (Erwin-Schrödinger-Institute (ESI), Vienna, Austria, 12-14 June 2007).第二届理论与产业研讨会会议录(2007年6月12日至14日,奥地利维也纳埃尔温·薛定谔研究所)
J Phys Condens Matter. 2008 Feb 13;20(6):060301. doi: 10.1088/0953-8984/20/06/060301. Epub 2008 Jan 24.
7
On fluid-solid direct coexistence simulations: the pseudo-hard sphere model.关于流固直接共存模拟:拟硬球模型。
J Chem Phys. 2013 Oct 14;139(14):144502. doi: 10.1063/1.4823499.
8
Heterogeneous versus homogeneous crystal nucleation of hard spheres.硬球异质与均相成核。
Soft Matter. 2019 Dec 4;15(47):9625-9631. doi: 10.1039/c9sm01142k.
9
Test of mean-field equations for two types of hard-sphere systems by a Brownian-dynamics simulation and a molecular-dynamics simulation.通过布朗动力学模拟和分子动力学模拟对两种硬球系统的平均场方程进行测试。
Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys. 2003 Jun;67(6 Pt 1):062403. doi: 10.1103/PhysRevE.67.062403. Epub 2003 Jun 25.
10
Event-driven Langevin simulations of hard spheres.
Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys. 2012 Aug;86(2 Pt 2):026709. doi: 10.1103/PhysRevE.86.026709. Epub 2012 Aug 20.