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莎草科植物Villars(1779年)叶绿体全基因组的特征分析

Characterization of the complete chloroplast genome of Villars, 1779 (Cyperaceae).

作者信息

Chen Hong-Yan, Xia Xiao-Fei, Pan Zhe, Ning Yu

机构信息

Beijing Botanical Garden, Beijing, China.

Department of Specimens, Beijing Museum of Nature History, Beijing, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Mar 25;7(3):531-532. doi: 10.1080/23802359.2022.2053368. eCollection 2022.

DOI:10.1080/23802359.2022.2053368
PMID:35356791
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8959502/
Abstract

Villars, 1779 is a typical alpine sedge with both ecological and agricultural value. The work reported here is the first complete chloroplast genome of this species. The chloroplast genome, with a total size of 185,609 bp, consists of two inverted repeats (IRs, 38,374 bp) separated by a large single-copy (LSC, 99,911 bp) region, and a small single-copy (SSC, 8950 bp) region. The overall genome GC content is 34.12%. The genome contains 125 genes, consisting of 82 protein-coding genes, 35 tRNA genes, and eight rRNA genes. Phylogenetic analysis supports the taxonomic treatment of incorporating genus to a broader circumscription of . Our work could be helpful to future research on Cyperaceae.

摘要

1779年的维拉斯草是一种典型的高山莎草,具有生态和农业价值。本文报道的工作是该物种的首个完整叶绿体基因组。叶绿体基因组全长185,609 bp,由两个反向重复序列(IRs,38,374 bp)组成,中间被一个大单拷贝(LSC,99,911 bp)区域和一个小单拷贝(SSC,8950 bp)区域隔开。基因组的总体GC含量为34.12%。该基因组包含125个基因,包括82个蛋白质编码基因、35个tRNA基因和8个rRNA基因。系统发育分析支持将该属纳入更广泛的分类范围的分类处理。我们的工作可能有助于未来对莎草科的研究。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a372/8959502/61ef96674d11/TMDN_A_2053368_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a372/8959502/61ef96674d11/TMDN_A_2053368_F0001_C.jpg
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