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瓦尔迪的基因组特征，一种在北卡罗来纳州西部的红染戈登氏菌上分离出的簇状DJ肌动杆菌噬菌体。

Genome Characteristics of Vardy, a Cluster DJ Actinobacteriophage Isolated on Gordonia rubripertincta in Western North Carolina.

作者信息

Henson Montana, Fratarcangeli Matteo, Park Serim, Minot Ashley, Gainey Maria D

机构信息

Department of Biology, Western Carolina University, Cullowhee, North Carolina, USA.

Department of Chemistry and Physics, Western Carolina University, Cullowhee, North Carolina, USA.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2022 Nov 17;11(11):e0070422. doi: 10.1128/mra.00704-22. Epub 2022 Oct 18.

DOI:10.1128/mra.00704-22
PMID:36255294
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9671010/
Abstract

Phage Vardy is a lytic siphovirus isolated from creek soil in Cullowhee, NC, using Gordonia rubripertincta NRRL B-16540. Vardy's 60,144-bp genome contains 90 predicted genes and five copies of a 50-bp motif that may regulate gene expression. Based on gene content similarity, Vardy is assigned to cluster DJ.

摘要

噬菌体瓦尔迪是一种裂解性长尾病毒，它是从北卡罗来纳州卡洛维的小溪土壤中分离出来的，分离时使用的宿主菌是红橙戈登氏菌NRRL B - 16540。瓦尔迪的60144碱基对基因组包含90个预测基因以及5个可能调控基因表达的50碱基基序拷贝。基于基因内容相似性，瓦尔迪被归类到DJ簇。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a343/9671010/dcacdd5e6488/mra.00704-22-f001.jpg
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