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igv.js:一个可嵌入的 JavaScript 实现的综合基因组浏览器(IGV)。

igv.js: an embeddable JavaScript implementation of the Integrative Genomics Viewer (IGV).

机构信息

Department of Medicine, University of California San Diego, La Jolla, CA 92093, USA.

Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA 02142, USA.

出版信息

Bioinformatics. 2023 Jan 1;39(1). doi: 10.1093/bioinformatics/btac830.

Abstract

SUMMARY

igv.js is an embeddable JavaScript implementation of the Integrative Genomics Viewer (IGV). It can be easily dropped into any web page with a single line of code and has no external dependencies. The viewer runs completely in the web browser, with no backend server and no data pre-processing required.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

The igv.js JavaScript component can be installed from NPM at https://www.npmjs.com/package/igv. The source code is available at https://github.com/igvteam/igv.js under the MIT open-source license. IGV-Web, the end-user application built around igv.js, is available at https://igv.org/app. The source code is available at https://github.com/igvteam/igv-webapp under the MIT open-source license.

SUPPLEMENTARY INFORMATION

Supplementary information is available at Bioinformatics online.

摘要

摘要

igv.js 是 Integrative Genomics Viewer(IGV)的嵌入式 JavaScript 实现。只需一行代码即可轻松嵌入到任何网页中,并且没有外部依赖项。该查看器完全在 Web 浏览器中运行,不需要后端服务器,也不需要进行数据预处理。

可用性和实现

可以在 https://www.npmjs.com/package/igv 从 NPM 安装 igv.js JavaScript 组件。源代码可在 MIT 开源许可证下的 https://github.com/igvteam/igv.js 获得。基于 igv.js 构建的最终用户应用程序 IGV-Web 可在 https://igv.org/app 获得。源代码可在 MIT 开源许可证下的 https://github.com/igvteam/igv-webapp 获得。

补充信息

补充信息可在 Bioinformatics 在线获得。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/69d9/9825295/ecd8fdfb36e0/btac830f1.jpg

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