• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

EXD2 核酸酶通过降解活性 mRNA 引发基因毒性应激后的转录恢复。

Active mRNA degradation by EXD2 nuclease elicits recovery of transcription after genotoxic stress.

机构信息

Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire Illkirch Cedex, C.U. Equipe Labellisée Ligue contre le Cancer, 2022, Strasbourg, France.

Centre National de la Recherche Scientifique, UMR7104, Illkirch, France.

出版信息

Nat Commun. 2023 Jan 20;14(1):341. doi: 10.1038/s41467-023-35922-5.

DOI:10.1038/s41467-023-35922-5
PMID:36670096
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9859823/
Abstract

The transcriptional response to genotoxic stress involves gene expression arrest, followed by recovery of mRNA synthesis (RRS) after DNA repair. We find that the lack of the EXD2 nuclease impairs RRS and decreases cell survival after UV irradiation, without affecting DNA repair. Overexpression of wild-type, but not nuclease-dead EXD2, restores RRS and cell survival. We observe that UV irradiation triggers the relocation of EXD2 from mitochondria to the nucleus. There, EXD2 is recruited to chromatin where it transiently interacts with RNA Polymerase II (RNAPII) to promote the degradation of nascent mRNAs synthesized at the time of genotoxic attack. Reconstitution of the EXD2-RNAPII partnership on a transcribed DNA template in vitro shows that EXD2 primarily interacts with an elongation-blocked RNAPII and efficiently digests mRNA. Overall, our data highlight a crucial step in the transcriptional response to genotoxic attack in which EXD2 interacts with elongation-stalled RNAPII on chromatin to potentially degrade the associated nascent mRNA, allowing transcription restart after DNA repair.

摘要

基因毒性应激的转录反应包括基因表达停滞,随后在 DNA 修复后恢复 mRNA 合成(RRS)。我们发现,缺乏 EXD2 核酸酶会损害 RRS,并降低紫外线照射后的细胞存活率,而不影响 DNA 修复。野生型 EXD2 的过表达,但不是核酸酶失活的 EXD2,可恢复 RRS 和细胞存活。我们观察到紫外线照射会触发 EXD2 从线粒体转移到细胞核。在那里,EXD2 被招募到染色质上,与 RNA 聚合酶 II(RNAPII)短暂相互作用,以促进在基因毒性攻击时合成的新生 mRNA 的降解。体外重建 EXD2-RNAPII 在转录 DNA 模板上的伙伴关系表明,EXD2 主要与延伸受阻的 RNAPII 相互作用,并有效地消化 mRNA。总的来说,我们的数据突出了基因毒性攻击转录反应中的一个关键步骤,其中 EXD2 在染色质上与延伸受阻的 RNAPII 相互作用,可能降解相关的新生 mRNA,从而在 DNA 修复后允许转录重新启动。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a89c/9859823/fa4d3c18c6bf/41467_2023_35922_Fig6_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a89c/9859823/0f6b1d944513/41467_2023_35922_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a89c/9859823/19c9e121ad1e/41467_2023_35922_Fig2_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a89c/9859823/570c77c457f6/41467_2023_35922_Fig3_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a89c/9859823/780a30aeda3f/41467_2023_35922_Fig4_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a89c/9859823/09b782a406ee/41467_2023_35922_Fig5_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a89c/9859823/fa4d3c18c6bf/41467_2023_35922_Fig6_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a89c/9859823/0f6b1d944513/41467_2023_35922_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a89c/9859823/19c9e121ad1e/41467_2023_35922_Fig2_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a89c/9859823/570c77c457f6/41467_2023_35922_Fig3_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a89c/9859823/780a30aeda3f/41467_2023_35922_Fig4_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a89c/9859823/09b782a406ee/41467_2023_35922_Fig5_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a89c/9859823/fa4d3c18c6bf/41467_2023_35922_Fig6_HTML.jpg

相似文献

1
Active mRNA degradation by EXD2 nuclease elicits recovery of transcription after genotoxic stress.EXD2 核酸酶通过降解活性 mRNA 引发基因毒性应激后的转录恢复。
Nat Commun. 2023 Jan 20;14(1):341. doi: 10.1038/s41467-023-35922-5.
2
A CSB-PAF1C axis restores processive transcription elongation after DNA damage repair.CSB-PAF1C 轴在 DNA 损伤修复后恢复连续转录延伸。
Nat Commun. 2021 Feb 26;12(1):1342. doi: 10.1038/s41467-021-21520-w.
3
Cockayne syndrome B protein is implicated in transcription and associated chromatin dynamics in homeostatic and genotoxic conditions.科凯恩综合征B蛋白在稳态和基因毒性条件下参与转录及相关染色质动态变化。
Aging Cell. 2025 Jan;24(1):e14341. doi: 10.1111/acel.14341. Epub 2024 Oct 6.
4
A new connection of mRNP biogenesis and export with transcription-coupled repair.mRNA 生物合成与输出和转录偶联修复之间的新联系。
Nucleic Acids Res. 2007;35(12):3893-906. doi: 10.1093/nar/gkm373. Epub 2007 May 30.
5
DNA Damage-Induced RNAPII Degradation and Its Consequences in Gene Expression.DNA 损伤诱导的 RNA 聚合酶 II 降解及其对基因表达的影响。
Genes (Basel). 2022 Oct 26;13(11):1951. doi: 10.3390/genes13111951.
6
Regulation of the RNAPII Pool Is Integral to the DNA Damage Response.调控 RNA 聚合酶 II 池对于 DNA 损伤反应至关重要。
Cell. 2020 Mar 19;180(6):1245-1261.e21. doi: 10.1016/j.cell.2020.02.009. Epub 2020 Mar 5.
7
RNA polymerase II is released from the DNA template during transcription-coupled repair in mammalian cells.在哺乳动物细胞的转录偶联修复过程中,RNA 聚合酶 II 从 DNA 模板上释放出来。
J Biol Chem. 2018 Feb 16;293(7):2476-2486. doi: 10.1074/jbc.RA117.000971. Epub 2017 Dec 27.
8
UV damage-induced RNA polymerase II stalling stimulates H2B deubiquitylation.紫外线损伤诱导的RNA聚合酶II停滞刺激H2B去泛素化。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Sep 2;111(35):12811-6. doi: 10.1073/pnas.1403901111. Epub 2014 Aug 18.
9
Slow RNAPII Transcription Elongation Rate, Low Levels of RNAPII Pausing, and Elevated Histone H1 Content at Promoters Associate with Higher m6A Deposition on Nascent mRNAs.RNA 聚合酶 II 转录延伸速度缓慢、RNAPII 暂停水平低以及启动子处组蛋白 H1 含量升高与新生 mRNA 上更高的 m6A 沉积相关。
Genes (Basel). 2022 Sep 14;13(9):1652. doi: 10.3390/genes13091652.
10
Elongin A regulates transcription in vivo through enhanced RNA polymerase processivity. elongin A 通过增强 RNA 聚合酶的延伸能力来调节体内转录。
J Biol Chem. 2021 Jan-Jun;296:100170. doi: 10.1074/jbc.RA120.015876. Epub 2020 Dec 13.

引用本文的文献

1
The molecular basis of human transcription-coupled DNA repair.人类转录偶联DNA修复的分子基础。
Nat Cell Biol. 2025 Aug;27(8):1230-1239. doi: 10.1038/s41556-025-01715-9. Epub 2025 Aug 5.
2
Cockayne syndrome B protein is implicated in transcription and associated chromatin dynamics in homeostatic and genotoxic conditions.科凯恩综合征B蛋白在稳态和基因毒性条件下参与转录及相关染色质动态变化。
Aging Cell. 2025 Jan;24(1):e14341. doi: 10.1111/acel.14341. Epub 2024 Oct 6.
3
Keep calm and reboot - how cells restart transcription after DNA damage and DNA repair.

本文引用的文献

1
Dealing with transcription-blocking DNA damage: Repair mechanisms, RNA polymerase II processing and human disorders.应对转录阻断性DNA损伤:修复机制、RNA聚合酶II加工与人类疾病
DNA Repair (Amst). 2021 Oct;106:103192. doi: 10.1016/j.dnarep.2021.103192. Epub 2021 Jul 26.
2
Elongation factor ELOF1 drives transcription-coupled repair and prevents genome instability.伸长因子 ELOF1 驱动转录偶联修复并防止基因组不稳定性。
Nat Cell Biol. 2021 Jun;23(6):608-619. doi: 10.1038/s41556-021-00692-z. Epub 2021 Jun 9.
3
Transcription-Coupled DNA Repair: From Mechanism to Human Disorder.
保持冷静并重启——细胞在DNA损伤和DNA修复后如何重新启动转录。
FEBS Lett. 2025 Jan;599(2):275-294. doi: 10.1002/1873-3468.14964. Epub 2024 Jul 11.
4
Mechanistic insight for improving butenyl-spinosyn production through combined ARTP/UV mutagenesis and ribosome engineering in .通过常压室温等离子体/紫外线联合诱变和核糖体工程提高丁烯基多杀菌素产量的机制洞察 。 (你提供的原文最后“in.”后面似乎内容不完整)
Front Bioeng Biotechnol. 2024 Jan 15;11:1329859. doi: 10.3389/fbioe.2023.1329859. eCollection 2023.
转录偶联 DNA 修复:从机制到人类疾病。
Trends Cell Biol. 2021 May;31(5):359-371. doi: 10.1016/j.tcb.2021.02.007. Epub 2021 Mar 5.
4
Causes and consequences of RNA polymerase II stalling during transcript elongation.RNA 聚合酶 II 在转录延伸过程中暂停的原因和后果。
Nat Rev Mol Cell Biol. 2021 Jan;22(1):3-21. doi: 10.1038/s41580-020-00308-8. Epub 2020 Nov 18.
5
Regulation of the RNAPII Pool Is Integral to the DNA Damage Response.调控 RNA 聚合酶 II 池对于 DNA 损伤反应至关重要。
Cell. 2020 Mar 19;180(6):1245-1261.e21. doi: 10.1016/j.cell.2020.02.009. Epub 2020 Mar 5.
6
Ubiquitination of DNA Damage-Stalled RNAPII Promotes Transcription-Coupled Repair.泛素化的 DNA 损伤阻滞的 RNA 聚合酶 II 促进转录偶联修复。
Cell. 2020 Mar 19;180(6):1228-1244.e24. doi: 10.1016/j.cell.2020.02.010. Epub 2020 Mar 5.
7
The DNA damage response to transcription stress.转录应激的 DNA 损伤反应。
Nat Rev Mol Cell Biol. 2019 Dec;20(12):766-784. doi: 10.1038/s41580-019-0169-4. Epub 2019 Sep 26.
8
EXD2 Protects Stressed Replication Forks and Is Required for Cell Viability in the Absence of BRCA1/2.EXD2 保护应激复制叉,并且在没有 BRCA1/2 的情况下对细胞存活是必需的。
Mol Cell. 2019 Aug 8;75(3):605-619.e6. doi: 10.1016/j.molcel.2019.05.026. Epub 2019 Jun 26.
9
The structure of human EXD2 reveals a chimeric 3' to 5' exonuclease domain that discriminates substrates via metal coordination.人的 EXD2 结构揭示了一种嵌合的 3' 到 5' 核酸外切酶结构域,通过金属配位来区分底物。
Nucleic Acids Res. 2019 Jul 26;47(13):7078-7093. doi: 10.1093/nar/gkz454.
10
TFIIE orchestrates the recruitment of the TFIIH kinase module at promoter before release during transcription.TFIIE 在转录起始前的启动子处协调 TFIIH 激酶模块的募集和解离。
Nat Commun. 2019 May 7;10(1):2084. doi: 10.1038/s41467-019-10131-1.