慢性淋巴细胞白血病中细胞遗传学分析和 FISH 技术及实时 PCR 检测 13q14.3 缺失和 miRNA-15a、miRNA-16-1 研究

Investigation of 13q14.3 deletion by cytogenetic analysis and FISH technique and miRNA-15a and miRNA-16-1 by real time PCR in chronic lymphocytic leukemia.

机构信息

Istanbul University Institute of Experimental Medical Research, Genetic Department, Istanbul, Turkey.

Istanbul University- Cerrahpasa, Cerrahpasa Medical Faculty, Medical Biology Department, Istanbul, Turkey.

出版信息

Afr Health Sci. 2022 Sep;22(3):173-182. doi: 10.4314/ahs.v22i3.20.

DOI:10.4314/ahs.v22i3.20

PMID:36910369

原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9993287/

Abstract

BACKGROUND

The most frequent cytogenetic aberration is 13q14.3 deletion in Chronic Lymphocytic Leukemia (CLL). HsamiR-15a/hsa-miR-16-1 are tumor suppressor miRNAs encoded from 13q14.3 region.

OBJECTIVES

The aim of this study was to investigate the 13q14.3 deletion using molecular and cytogenetic techniques and association with miRNA-15a/miRNA-16-1.

MATERIALS AND METHODS

We used peripheral blood samples of 30 CLL patients who were either induced and or non-induced with DSP30+IL-2 to determine 13q14.3 deletion by karyotyping and iFISH. Expression levels of hsa-miR-15a/miR-16-1 were measured using qRT PCR and compared with deletions.

RESULTS

13q14.3 deletion was detected in 8.6% of cases by karyotyping and in 65% by iFISH. Mosaic forms (monoallelic+biallelic) were observed in 50% of cases. Besides determining common chromosome abnormalities such as add(2)(q37), t(2;7) (p11.2;q22), del(6)(q13q21), del(6)(q25), add(9)(q21), del(11)(q23), t(11;14)(q13;q32), del(13)(q11q12), del(13)(q12q14), add(14) (q23), del(14)(q23), t(14;19)(q32;q13.1), del(15)(q23), del(17)(p12), t(18;22)(q21;q11.2), add(21)(p13) and t(17;21)(q11.2;122), we also determined t(1;13)(q32;q34), inv(2)(p25q21), del(13)(q22q32), t(14;19)(q24;q13), dup(17)(q21q23), der(21;21)(p13;p13) which have not been reported previously. Mitotic index data was found statistically significant and DSP30+IL-2 increased mitotic index by 2.5 folds. Association between decreased miR-16-1 expression and deletions was statistically significant.

CONCLUSION

We suggest that cytogenetic and iFISH analyses are complementary and use of DSP30+IL-2 is effective .in CLL. Decreased expression of hsa-miR-16-1 is remarkable.

摘要

背景

最常见的细胞遗传学异常是慢性淋巴细胞白血病（CLL）中的 13q14.3 缺失。HsamiR-15a/hsa-miR-16-1 是编码自 13q14.3 区域的肿瘤抑制 miRNA。

目的

本研究旨在通过分子和细胞遗传学技术检测 13q14.3 缺失，并与 miRNA-15a/miRNA-16-1 相关联。

材料和方法

我们使用 30 例 CLL 患者的外周血样本，这些患者要么用 DSP30+IL-2 诱导，要么不诱导，通过核型分析和 iFISH 来确定 13q14.3 缺失。使用 qRT-PCR 测量 hsa-miR-15a/miR-16-1 的表达水平，并与缺失进行比较。

结果

核型分析检测到 8.6%的病例存在 13q14.3 缺失，iFISH 检测到 65%的病例存在缺失。50%的病例存在镶嵌形式（单等位基因+双等位基因）。除了确定常见的染色体异常，如 add(2)(q37)、t(2;7) (p11.2;q22)、del(6)(q13q21)、del(6)(q25)、add(9)(q21)、del(11)(q23)、t(11;14)(q13;q32)、del(13)(q11q12)、del(13)(q12q14)、add(14) (q23)、del(14)(q23)、t(14;19)(q32;q13.1)、del(15)(q23)、del(17)(p12)、t(18;22)(q21;q11.2)、add(21)(p13)和 t(17;21)(q11.2;122)外，我们还确定了 t(1;13)(q32;q34)、inv(2)(p25q21)、del(13)(q22q32)、t(14;19)(q24;q13)、dup(17)(q21q23)、der(21;21)(p13;p13)，这些异常以前没有报道过。有丝分裂指数数据具有统计学意义，DSP30+IL-2 将有丝分裂指数增加了 2.5 倍。miR-16-1 表达降低与缺失之间存在显著相关性。