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使用3dRNA/DNA进行RNA和DNA三维结构预测与评估。

Using 3dRNA/DNA for RNA and DNA 3D Structure Prediction and Evaluation.

作者信息

Xiong Yiduo, Zhang Yi, Wang Jian, Xiao Yi

机构信息

Institute of Biophysics, School of Physics, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, Hubei, China.

出版信息

Curr Protoc. 2023 May;3(5):e770. doi: 10.1002/cpz1.770.

Abstract

This article describes how to use 3dRNA/DNA to predict RNA and DNA 3D structures from their sequences and secondary (2D) structures. The predicted RNA and DNA 3D structures can be used to predict or understand their functions and can also be used to find the interactions between the RNA/DNA and other molecules. © 2023 Wiley Periodicals LLC. Basic Protocol: RNA/DNA 3D structure prediction using 3dRNA/DNA web server Alternate Protocol: Using 3dRNA/DNA and 3dRNAscore locally Support Protocol: Installing NSP.

摘要

本文介绍了如何使用3dRNA/DNA从RNA和DNA的序列及二级(二维)结构预测其三维结构。预测得到的RNA和DNA三维结构可用于预测或理解其功能,还可用于发现RNA/DNA与其他分子之间的相互作用。© 2023威利期刊有限责任公司。基本方案:使用3dRNA/DNA网络服务器进行RNA/DNA三维结构预测 替代方案:在本地使用3dRNA/DNA和3dRNAscore 支持方案:安装NSP。

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