• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

一种用于拟合蛋白质-配体结合中MWC多项式的概率模型。

A probabilistic model for fitting MWC polynomials in protein-ligand binding.

作者信息

Briggs W E

出版信息

Biophys Chem. 1986 Aug;24(3):311-8. doi: 10.1016/0301-4622(86)85036-0.

DOI:10.1016/0301-4622(86)85036-0
PMID:3768474
Abstract

Given a binding polynomial in Adair form, A(x) = 1 + beta 1 x + ... + beta n x n, beta i greater than or equal to 0, a basic problem is to determine a method of fitting a model polynomial to A(x) and a quantitative measure of the goodness of fit. This paper presents such a method for fitting Monod-Wyman-Changeux (MWC) model polynomials when A(x) is of degree three or four. The method of fitting is based on the property that the zeros of an MWC polynomial of any degree lie on a circle in the complex plane. The parameters in the MWC model are determined so that if possible this circle coincides with the circle on which lie the zeros of A(x). The measure of goodness of fit is provided by a probabilistic model which gives the probability that a binding polynomial has its zeros on a circle on which lie the zeros of an MWC polynomial and if so, the probability that the juxtaposition of the two sets of zeros can occur by chance alone.

摘要

给定一个阿代尔形式的结合多项式(A(x)=1 + \beta_1x + \cdots + \beta_nx^n),其中(\beta_i \geq 0),一个基本问题是确定一种将模型多项式拟合到(A(x))的方法以及拟合优度的定量度量。本文提出了一种当(A(x))的次数为三或四时拟合莫诺 - 怀曼 - 尚热(MWC)模型多项式的方法。拟合方法基于这样一个性质,即任何次数的MWC多项式的零点位于复平面上的一个圆上。确定MWC模型中的参数,以便在可能的情况下,这个圆与(A(x))的零点所在的圆重合。拟合优度的度量由一个概率模型提供,该模型给出了一个结合多项式的零点位于MWC多项式的零点所在圆上的概率,如果是这样,两组零点并列出现仅仅是偶然的概率。

相似文献

1
A probabilistic model for fitting MWC polynomials in protein-ligand binding.一种用于拟合蛋白质-配体结合中MWC多项式的概率模型。
Biophys Chem. 1986 Aug;24(3):311-8. doi: 10.1016/0301-4622(86)85036-0.
2
Analysis of zeros of binding polynomials for tetrameric hemoglobins.
Biophys Chem. 1986 Aug;24(3):295-309. doi: 10.1016/0301-4622(86)85035-9.
3
An analytic solution to the Monod-Wyman-Changeux model and all parameters in this model.莫诺-怀曼-尚热模型的解析解及该模型中的所有参数。
Biophys J. 1989 Feb;55(2):275-80. doi: 10.1016/S0006-3495(89)82802-4.
4
The relationship between zeros and factors of binding polynomials and cooperativity in protein-ligand binding.
J Theor Biol. 1985 Jun 21;114(4):605-14. doi: 10.1016/s0022-5193(85)80047-3.
5
A new measure of cooperativity in protein-ligand binding.一种蛋白质-配体结合中协同性的新度量方法。
Biophys Chem. 1983 Jul;18(1):67-71. doi: 10.1016/0301-4622(83)80028-3.
6
Thermodynamic analysis of carbon monoxide binding by hemoglobin trout I.血红蛋白鳟鱼I对一氧化碳结合的热力学分析。
Biophys Chem. 1979 Mar;9(3):235-44. doi: 10.1016/0301-4622(79)85006-1.
7
Statistical mechanics of Monod-Wyman-Changeux (MWC) models.莫诺-维曼-居内变换(MWC)模型的统计力学。
J Mol Biol. 2013 May 13;425(9):1433-60. doi: 10.1016/j.jmb.2013.03.013. Epub 2013 Mar 14.
8
Allostery in Callinectes sapidus hemocyanin: cooperative oxygen binding and interactions with L-lactate, calcium, and protons.美洲蓝蟹血蓝蛋白中的变构作用:协同氧结合以及与L-乳酸、钙和质子的相互作用。
Biochemistry. 1988 Mar 22;27(6):1995-2001. doi: 10.1021/bi00406a028.
9
The model of Monod, Wyman, and Changeux generates two sets of parameters when applied to oxygen binding in hemoglobin.莫诺德、怀曼和尚热模型应用于血红蛋白的氧结合时会产生两组参数。
Biochem Biophys Res Commun. 2007 Dec 28;364(4):867-9. doi: 10.1016/j.bbrc.2007.10.078. Epub 2007 Oct 23.
10
GroEL Allostery Illuminated by a Relationship between the Hill Coefficient and the MWC Model.GroEL 变构作用的阐明:由 Hill 系数与 MWC 模型之间的关系提供的线索。
Biophys J. 2019 Nov 19;117(10):1915-1921. doi: 10.1016/j.bpj.2019.10.013. Epub 2019 Oct 22.