• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
The complete genome sequences of strains EF2 and EF3, isolated from an oxycline in Effingham Inlet, British Columbia.从不列颠哥伦比亚省埃芬厄姆湾的氧化跃层分离出的菌株EF2和EF3的全基因组序列。
Microbiol Resour Announc. 2024 Mar 12;13(3):e0111823. doi: 10.1128/mra.01118-23. Epub 2024 Feb 9.
2
Complete Genome Sequence of " Thioglobus sp." Strain NP1, an Open-Ocean Isolate from the SUP05 Clade of Marine .“硫球杆菌属”菌株NP1的全基因组序列,该菌株是从海洋SUP05进化枝分离出的一种大洋菌株 。
Microbiol Resour Announc. 2019 Mar 14;8(11):e00097-19. doi: 10.1128/MRA.00097-19.
3
Genome Sequence of "Candidatus Thioglobus autotrophica" Strain EF1, a Chemoautotroph from the SUP05 Clade of Marine Gammaproteobacteria.“嗜硫珠菌属自养菌”菌株EF1的基因组序列,该菌株是一种来自海洋γ-变形菌纲SUP05进化枝的化能自养菌。
Genome Announc. 2015 Oct 22;3(5):e01156-15. doi: 10.1128/genomeA.01156-15.
4
Morphological Plasticity in a Sulfur-Oxidizing Marine Bacterium from the SUP05 Clade Enhances Dark Carbon Fixation.SUP05 丛枝菌根真菌属中一种硫氧化海洋细菌的形态可塑性增强了黑暗碳固定。
mBio. 2019 May 7;10(3):e00216-19. doi: 10.1128/mBio.00216-19.
5
Genome Sequence of "Candidatus Thioglobus singularis" Strain PS1, a Mixotroph from the SUP05 Clade of Marine Gammaproteobacteria.“奇异硫球菌”菌株PS1的基因组序列,PS1是一种来自海洋γ-变形菌纲SUP05进化枝的兼养生物。
Genome Announc. 2015 Oct 22;3(5):e01155-15. doi: 10.1128/genomeA.01155-15.
6
Analysis of Whole-Genome Sequences of Infectious laryngotracheitis Virus Isolates from Poultry Flocks in Canada: Evidence of Recombination.对加拿大禽群传染性喉气管炎病毒分离株全基因组序列的分析:重组证据。
Viruses. 2020 Nov 12;12(11):1302. doi: 10.3390/v12111302.
7
Combining genomic sequencing methods to explore viral diversity and reveal potential virus-host interactions.结合基因组测序方法以探索病毒多样性并揭示潜在的病毒-宿主相互作用。
Front Microbiol. 2015 Apr 10;6:265. doi: 10.3389/fmicb.2015.00265. eCollection 2015.
8
Heterotrophic carbon metabolism and energy acquisition in Candidatus Thioglobus singularis strain PS1, a member of the SUP05 clade of marine Gammaproteobacteria.希氏硫珠菌 PS1 菌株(隶属于海洋γ变形菌 SUP05 分支)的异养碳代谢和能量获取。
Environ Microbiol. 2019 Jul;21(7):2391-2401. doi: 10.1111/1462-2920.14623. Epub 2019 Apr 24.
9
Metabolic flexibility of SUP05 under low DO growth conditions.在低 DO 生长条件下 SUP05 的代谢灵活性。
Environ Microbiol. 2021 Jun;23(6):2823-2833. doi: 10.1111/1462-2920.15226. Epub 2020 Sep 21.
10
Niche differentiation of sulfur-oxidizing bacteria (SUP05) in submarine hydrothermal plumes.硫氧化菌(SUP05)在海底热液羽流中的生态位分化。
ISME J. 2022 Jun;16(6):1479-1490. doi: 10.1038/s41396-022-01195-x. Epub 2022 Jan 26.

引用本文的文献

1
Genomic diversity and adaptation in Arctic marine bacteria.北极海洋细菌的基因组多样性与适应性
mBio. 2025 Sep 10;16(9):e0155525. doi: 10.1128/mbio.01555-25. Epub 2025 Aug 18.

本文引用的文献

1
The Physiology and Biogeochemistry of SUP05.SUP05 的生理学和生物地球化学。
Ann Rev Mar Sci. 2022 Jan 3;14:261-275. doi: 10.1146/annurev-marine-010419-010814. Epub 2021 Aug 20.
2
RefSeq: expanding the Prokaryotic Genome Annotation Pipeline reach with protein family model curation.RefSeq:通过蛋白质家族模型编纂扩展原核生物基因组注释管道的覆盖范围。
Nucleic Acids Res. 2021 Jan 8;49(D1):D1020-D1028. doi: 10.1093/nar/gkaa1105.
3
fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor.fastp:一个超快速的一体化 FASTQ 预处理程序。
Bioinformatics. 2018 Sep 1;34(17):i884-i890. doi: 10.1093/bioinformatics/bty560.
4
Unicycler: Resolving bacterial genome assemblies from short and long sequencing reads.单轮循环器:从短读长和长读长测序数据中解析细菌基因组组装结果
PLoS Comput Biol. 2017 Jun 8;13(6):e1005595. doi: 10.1371/journal.pcbi.1005595. eCollection 2017 Jun.
5
Cultivation of a chemoautotroph from the SUP05 clade of marine bacteria that produces nitrite and consumes ammonium.从海洋细菌的SUP05进化枝中培养出一种化学自养菌,该细菌可产生亚硝酸盐并消耗铵。
ISME J. 2017 Jan;11(1):263-271. doi: 10.1038/ismej.2016.87. Epub 2016 Jul 19.
6
Genome Sequence of "Candidatus Thioglobus autotrophica" Strain EF1, a Chemoautotroph from the SUP05 Clade of Marine Gammaproteobacteria.“嗜硫珠菌属自养菌”菌株EF1的基因组序列,该菌株是一种来自海洋γ-变形菌纲SUP05进化枝的化能自养菌。
Genome Announc. 2015 Oct 22;3(5):e01156-15. doi: 10.1128/genomeA.01156-15.
7
Metaproteomics reveals differential modes of metabolic coupling among ubiquitous oxygen minimum zone microbes.宏蛋白质组学揭示了普遍存在的低氧区微生物之间代谢偶联的不同模式。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Aug 5;111(31):11395-400. doi: 10.1073/pnas.1322132111. Epub 2014 Jul 22.
8
SUP05 dominates the Gammaproteobacterial sulfur oxidizer assemblages in pelagic redoxclines of the central Baltic and Black Seas.SUP05 在波罗的海中部和黑海的远洋氧化还原梯度带的 Gamma 变形菌硫氧化体中占据主导地位。
Appl Environ Microbiol. 2013 Apr;79(8):2767-76. doi: 10.1128/AEM.03777-12. Epub 2013 Feb 15.
9
A cryptic sulfur cycle in oxygen-minimum-zone waters off the Chilean coast.智利沿海缺氧区水域中神秘的硫循环。
Science. 2010 Dec 3;330(6009):1375-8. doi: 10.1126/science.1196889. Epub 2010 Nov 11.
10
Metagenome of a versatile chemolithoautotroph from expanding oceanic dead zones.来自不断扩张的海洋死区的一种多功能化能自养生物的宏基因组。
Science. 2009 Oct 23;326(5952):578-82. doi: 10.1126/science.1175309.

从不列颠哥伦比亚省埃芬厄姆湾的氧化跃层分离出的菌株EF2和EF3的全基因组序列。

The complete genome sequences of strains EF2 and EF3, isolated from an oxycline in Effingham Inlet, British Columbia.

作者信息

Morris Robert M, Mino Sayaka

机构信息

School of Oceanography, University of Washington, Seattle, Washington, USA.

Laboratory of Microbiology, Faculty of Fisheries Sciences, Hokkaido University, Minato-cho, Hakodate, Japan.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2024 Mar 12;13(3):e0111823. doi: 10.1128/mra.01118-23. Epub 2024 Feb 9.

DOI:10.1128/mra.01118-23
PMID:38334403
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10927645/
Abstract

Here we provide the complete genome sequences of two chemoautotrophic isolates from the family of marine gamma-proteobacteria. The genomes were obtained from pure cultures that were initially isolated from Effingham Inlet in 2013 and revived from freezer stocks for whole genome sequencing in 2023.

摘要

在这里,我们提供了来自海洋γ-变形菌科的两种化学自养分离株的完整基因组序列。这些基因组来自于2013年最初从埃芬厄姆湾分离得到的纯培养物,并于2023年从冷冻保存物中复苏用于全基因组测序。