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在timsTOF Pro质谱仪上采用数据依赖采集模式，通过自下而上的无标记定量分析进行N端蛋白质组学研究。

N-terminal proteomics of using bottom-up label-free quantitative analysis in data-dependent acquisition mode on a timsTOF Pro mass spectrometer.

作者信息

Hu Daniel D, Weaver Simon D, Collars Owen A, Champion Patricia A, Champion Matthew M

机构信息

Department of Chemistry and Biochemistry, University of Notre Dame, Notre Dame, Indiana, USA.

Department of Biological Sciences, University of Notre Dame, Notre Dame, Indiana, USA.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2024 Apr 11;13(4):e0126323. doi: 10.1128/mra.01263-23. Epub 2024 Mar 13.

DOI:10.1128/mra.01263-23
PMID:38477461
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11008207/
Abstract

N-terminal acetylation in is correlated with pathogenic activity. We used genomics and bottom-up proteomics to identify protein Emp1 as the sole acetyltransferase responsible for acetylation of EsxA, a known virulence factor. Using custom data analysis, we screened the proteome to identify 22 additional putative substrates of Emp1.

摘要

N 端乙酰化与致病活性相关。我们利用基因组学和自下而上的蛋白质组学方法，鉴定出蛋白质 Emp1 是负责对已知毒力因子 EsxA 进行乙酰化的唯一乙酰转移酶。通过定制数据分析，我们筛选了蛋白质组，以鉴定 Emp1 的另外 22 个假定底物。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3d53/11008207/5c0acabaa118/mra.01263-23.f001.jpg
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