• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

高效诱导拟南芥 CRISPR-Kill 介导的细胞消融的方案。

Protocol to efficiently induce CRISPR-Kill-mediated cell ablation in Arabidopsis thaliana.

机构信息

Joseph Gottlieb Kölreuter Institute for Plant Sciences (JKIP) - Molecular Biology, Karlsruhe Institute of Technology (KIT), 76131 Karlsruhe, Germany.

Centre for Plant Molecular Biology (ZMBP), Plant Biochemistry, Eberhard-Karls-University Tübingen, 72076 Tübingen, Germany.

出版信息

STAR Protoc. 2024 Jun 21;5(2):103072. doi: 10.1016/j.xpro.2024.103072. Epub 2024 May 19.

DOI:10.1016/j.xpro.2024.103072
PMID:38768032
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11134856/
Abstract

The CRISPR-Kill system enables targeted cell ablation by inducing multiple double-strand breaks in evolutionarily conserved repetitive genomic regions. Here, we present a protocol for the application of the CRISPR-Kill system to analyze the systemic and cellular effects of targeted cell death in Arabidopsis. We describe steps for generating constitutive and inducible CRISPR-Kill lines, chemically inducing CRISPR-Cas9-mediated genome elimination, and monitoring of cell death in shoot and root apical meristems. This enables the investigation of a wide range of questions in developmental plant biology. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Gehrke et al..

摘要

CRISPR-Kill 系统通过在进化上保守的重复基因组区域中诱导多个双链断裂，实现靶向细胞消融。在这里，我们提供了一个应用 CRISPR-Kill 系统来分析拟南芥中靶向细胞死亡的系统和细胞效应的方案。我们描述了生成组成型和诱导型 CRISPR-Kill 系、化学诱导 CRISPR-Cas9 介导的基因组消除以及在茎和根顶端分生组织中监测细胞死亡的步骤。这使得能够研究发育植物生物学中的广泛问题。如需详细了解该方案的使用和执行，请参考 Gehrke 等人的研究。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/32ccaf718a70/gr7.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/b495a34b14e5/fx1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/2da3ebf7571c/gr1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/005d511cae7e/gr2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/00282cdf9de4/gr3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/ae98ae3235c9/gr4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/8f6cdae2033a/gr5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/26d25f6c8c37/gr6.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/32ccaf718a70/gr7.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/b495a34b14e5/fx1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/2da3ebf7571c/gr1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/005d511cae7e/gr2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/00282cdf9de4/gr3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/ae98ae3235c9/gr4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/8f6cdae2033a/gr5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/26d25f6c8c37/gr6.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3ac/11134856/32ccaf718a70/gr7.jpg

相似文献

1
Protocol to efficiently induce CRISPR-Kill-mediated cell ablation in Arabidopsis thaliana.高效诱导拟南芥 CRISPR-Kill 介导的细胞消融的方案。
STAR Protoc. 2024 Jun 21;5(2):103072. doi: 10.1016/j.xpro.2024.103072. Epub 2024 May 19.
2
An inducible CRISPR-Kill system for temporally controlled cell type-specific cell ablation in Arabidopsis thaliana.一种诱导型 CRISPR-Kill 系统，用于在拟南芥中进行时间控制的细胞类型特异性细胞消融。
New Phytol. 2023 Sep;239(5):2041-2052. doi: 10.1111/nph.19102. Epub 2023 Jun 28.
3
Optimized protocol to create deletion in adherent cell lines using CRISPR/Cas9 system.使用 CRISPR/Cas9 系统在贴壁细胞系中创建缺失的优化方案。
STAR Protoc. 2021 Oct 22;2(4):100857. doi: 10.1016/j.xpro.2021.100857. eCollection 2021 Dec 17.
4
Protocol for arrayed gRNA screening by base editors in mammalian cell lines using lentiviral system.基于慢病毒系统的哺乳动物细胞系中碱基编辑器的靶向 gRNA 筛选方案。
STAR Protoc. 2023 Dec 15;4(4):102668. doi: 10.1016/j.xpro.2023.102668. Epub 2023 Nov 3.
5
Using CRISPR-Kill for organ specific cell elimination by cleavage of tandem repeats.利用 CRISPR-Kill 通过串联重复序列的切割实现器官特异性细胞消除。
Nat Commun. 2022 Mar 21;13(1):1502. doi: 10.1038/s41467-022-29130-w.
6
CRISPR-Cas9-mediated chromosome engineering in Arabidopsis thaliana.CRISPR-Cas9 介导的拟南芥染色体工程。
Nat Protoc. 2022 May;17(5):1332-1358. doi: 10.1038/s41596-022-00686-7. Epub 2022 Apr 6.
7
Optimized CRISPR/Cas9-mediated single nucleotide mutation in adherent cancer cell lines.优化贴壁癌细胞系中 CRISPR/Cas9 介导的单核苷酸突变。
STAR Protoc. 2021 Mar 31;2(2):100419. doi: 10.1016/j.xpro.2021.100419. eCollection 2021 Jun 18.
8
Protocol for establishing knockout cell clones by deletion of a large gene fragment using CRISPR-Cas9 with multiple guide RNAs.利用 CRISPR-Cas9 多重向导 RNA 缺失大片段基因建立基因敲除细胞克隆的方案。
STAR Protoc. 2024 Sep 20;5(3):103179. doi: 10.1016/j.xpro.2024.103179. Epub 2024 Jul 6.
9
Efficient Generation of CRISPR/Cas9-Based Mutants Supported by Fluorescent Seed Selection in Different Arabidopsis Accessions.基于荧光种子筛选在不同拟南芥生态型中高效生成CRISPR/Cas9突变体
Methods Mol Biol. 2022;2484:161-182. doi: 10.1007/978-1-0716-2253-7_13.
10
CRISPR/Cas9-Based Genome Editing of Transcription Factor Genes in Marchantia polymorpha.基于CRISPR/Cas9对多歧藻苔转录因子基因进行基因组编辑
Methods Mol Biol. 2018;1830:109-126. doi: 10.1007/978-1-4939-8657-6_7.