• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

基于计算机的协同性和变构效应学习。

Computer-based learning of cooperativity and allostery.

作者信息

Franco R, Canela E I

机构信息

Department of Biochemistry, Faculty of Chemistry, University of Barcelona, Catalunya, Spain.

出版信息

Comput Appl Biosci. 1985 Sep;1(3):161-5. doi: 10.1093/bioinformatics/1.3.161.

DOI:10.1093/bioinformatics/1.3.161
PMID:3916891
Abstract

The aim of this article is to facilitate the understanding of enzyme cooperativity and allostery by undergraduate and postgraduate students with the aid of a graphic microcomputer. For this purpose the molecular models of Monod-Wyman-Changeux (MWC) and of Koshland-Nemethy-Filmer (KNF) are tested by showing how the different plots, direct, reciprocal, Scatchard and Hill, vary as do the parameters considered in these models. The programs used (one for each model) progress from easy aspects to complicated ones without the intervention of the user (student). Nevertheless, ultimately, with the MWC model, after the introduction of heterotropic effectors, the users can select the parameters in order to further their knowledge. This can be useful also for testing the kinetic behavior of multisubunit enzymes which present cooperativity and which have been extensively described in the literature.

摘要

本文旨在借助图形微机,帮助本科生和研究生理解酶的协同性和别构效应。为此,通过展示不同的曲线(直接、倒数、斯卡查德和希尔曲线)以及这些模型中所考虑的参数如何变化,来测试莫诺德 - 怀曼 - 尚热(MWC)模型和科什兰德 - 内梅蒂 - 菲尔默(KNF)模型的分子模型。所使用的程序(每个模型一个)在无需用户(学生)干预的情况下,从简单方面逐步推进到复杂方面。然而,最终对于MWC模型,在引入异促效应剂后,用户可以选择参数以增进他们的知识。这对于测试具有协同性且在文献中已有广泛描述的多亚基酶的动力学行为也可能是有用的。

相似文献

1
Computer-based learning of cooperativity and allostery.基于计算机的协同性和变构效应学习。
Comput Appl Biosci. 1985 Sep;1(3):161-5. doi: 10.1093/bioinformatics/1.3.161.
2
Structural Basis of Sequential and Concerted Cooperativity.结构基础的顺序和协同合作。
Biomolecules. 2022 Nov 7;12(11):1651. doi: 10.3390/biom12111651.
3
Understanding allosteric and cooperative interactions in enzymes.理解酶的变构和协同相互作用。
FEBS J. 2014 Jan;281(2):621-32. doi: 10.1111/febs.12469. Epub 2013 Sep 2.
4
Validity of transfer-function representation of input-output relation in allosteric models.变构模型中输入-输出关系的传递函数表示的有效性。
Biosystems. 1986;19(4):317-26. doi: 10.1016/0303-2647(86)90009-2.
5
A new measure of cooperativity in protein-ligand binding.一种蛋白质-配体结合中协同性的新度量方法。
Biophys Chem. 1983 Jul;18(1):67-71. doi: 10.1016/0301-4622(83)80028-3.
6
Tertiary and quaternary effects in the allosteric regulation of animal hemoglobins.动物血红蛋白变构调节中的三级和四级效应。
Biochim Biophys Acta. 2013 Sep;1834(9):1860-72. doi: 10.1016/j.bbapap.2013.03.013. Epub 2013 Mar 20.
7
Nested cooperativity in the ATPase activity of the oligomeric chaperonin GroEL.寡聚伴侣蛋白GroEL的ATP酶活性中的嵌套协同性。
Biochemistry. 1995 Apr 25;34(16):5303-8. doi: 10.1021/bi00016a001.
8
Symmetry, Rigidity, and Allosteric Signaling: From Monomeric Proteins to Molecular Machines.对称性、刚性与变构信号传导:从单体蛋白到分子机器
Chem Rev. 2019 Jun 26;119(12):6788-6821. doi: 10.1021/acs.chemrev.8b00760. Epub 2019 Apr 24.
9
On the estimation of cooperativity in ion channel kinetics: activation free energy and kinetic mechanism of Shaker K+ channel.离子通道动力学中协同性的估计:Shaker K+ 通道的激活自由能和动力学机制。
J Chem Phys. 2013 Apr 28;138(16):165102. doi: 10.1063/1.4801999.
10
Substrate-dependent switching of the allosteric binding mechanism of a dimeric enzyme.底物依赖性的二聚酶变构结合机制的转换。
Nat Chem Biol. 2014 Nov;10(11):937-42. doi: 10.1038/nchembio.1626. Epub 2014 Sep 14.