• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

位于11q13.3的功能性变异rs9344在伴有t(11;14)的多发性骨髓瘤中调节CCND1的表达。

Functional variant rs9344 at 11q13.3 regulates CCND1 expression in multiple myeloma with t(11;14).

作者信息

Tang Hongwei, Yan Huihuang, Shivaram Suganti, Lehman Stacey, Sharma Neeraj, Smadbeck James, Zepeda-Mendoza Cinthya, Tian Shulan, Asmann Yan, Vachon Celine, Gaspar Maia Alexandre, Keats Jonathan, Bergsagel P Leif, Fonseca Rafael, Stewart A Keith, Hsu Joel-Sean, Kandasamy Richard K, Pandey Akhilesh, Kaddoura Marcella A, Maura Francesco, Mitra Amit, Rajkumar S Vincent, Kumar Shaji K, Elhaik Eran, Braggio Esteban, Baughn Linda B

机构信息

Division of Hematopathology, Department of Laboratory Medicine and Pathology, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA.

Division of Computational Biology, Department of Quantitative Health Sciences, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA.

出版信息

Leukemia. 2025 Jan;39(1):42-50. doi: 10.1038/s41375-024-02363-y. Epub 2024 Oct 14.

DOI:10.1038/s41375-024-02363-y
PMID:39402215
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11717701/
Abstract

Multiple myeloma (MM) is a plasma cell (PC) malignancy characterized by cytogenetic abnormalities, such as t(11;14)(q13;q32), resulting in CCND1 overexpression. The rs9344 G allele within CCND1 is the most significant susceptibility allele for t(11;14). Sequencing data from 2 independent cohorts, CoMMpass (n = 698) and Mayo Clinic (n = 661), confirm the positive association between the G allele and t(11;14). Among 80% of individuals heterozygous for rs9344 with t(11;14), the t(11;14) event occurs on the G allele, demonstrating a biological preference for the G allele in t(11;14). Within t(11;14), the G allele is associated with higher CCND1 expression and elevated H3K27ac and H3K4me3. CRISPR/Cas9 mediated A to G conversion resulted in increased H3K27ac over CCND1 and elevated CCND1 expression. ENCODE ChIP-seq data supported a PAX5 binding site within the enhancer region covering rs9344, showing preferential binding to the G allele. Overexpression of PAX5 resulted in increased CCND1 expression. These results support the importance of rs9344 G enhancer in increasing CCND1 expression in MM.

摘要

多发性骨髓瘤(MM)是一种浆细胞(PC)恶性肿瘤,其特征在于细胞遗传学异常,如t(11;14)(q13;q32),导致CCND1过表达。CCND1内的rs9344 G等位基因是t(11;14)最显著的易感等位基因。来自两个独立队列CoMMpass(n = 698)和梅奥诊所(n = 661)的测序数据证实了G等位基因与t(11;14)之间的正相关。在80%携带t(11;14)的rs9344杂合个体中,t(11;14)事件发生在G等位基因上,表明在t(11;14)中对G等位基因有生物学偏好。在t(11;14)中,G等位基因与更高的CCND1表达以及升高的H3K27ac和H3K4me3相关。CRISPR/Cas9介导的A到G转换导致CCND1上的H3K27ac增加以及CCND1表达升高。ENCODE ChIP-seq数据支持在覆盖rs9344的增强子区域内存在一个PAX5结合位点,显示其优先与G等位基因结合。PAX5的过表达导致CCND1表达增加。这些结果支持rs9344 G增强子在增加MM中CCND1表达方面的重要性。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/e50b/11717701/19e29ba7497d/41375_2024_2363_Fig2_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/e50b/11717701/34c4e4a28022/41375_2024_2363_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/e50b/11717701/19e29ba7497d/41375_2024_2363_Fig2_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/e50b/11717701/34c4e4a28022/41375_2024_2363_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/e50b/11717701/19e29ba7497d/41375_2024_2363_Fig2_HTML.jpg

相似文献

1
Functional variant rs9344 at 11q13.3 regulates CCND1 expression in multiple myeloma with t(11;14).位于11q13.3的功能性变异rs9344在伴有t(11;14)的多发性骨髓瘤中调节CCND1的表达。
Leukemia. 2025 Jan;39(1):42-50. doi: 10.1038/s41375-024-02363-y. Epub 2024 Oct 14.
2
PAX5-positive plasma cell myeloma with t(9;14;11)(p13;q32;q13), a novel complex variant translocation of t(11;14)(q13;q32) and t(9;14)(p13;q32).伴有t(9;14;11)(p13;q32;q13)的PAX5阳性浆细胞骨髓瘤,这是一种t(11;14)(q13;q32)和t(9;14)(p13;q32)的新型复杂变异易位。
Int J Hematol. 2015 Jun;101(6):608-11. doi: 10.1007/s12185-015-1749-5. Epub 2015 Jan 30.
3
Tumor-specific transcript variants of cyclin D1 in mantle cell lymphoma and multiple myeloma with chromosome 11q13 abnormalities.套细胞淋巴瘤和多发性骨髓瘤中 cyclin D1 的肿瘤特异性转录变体与 11q13 异常。
Exp Hematol. 2020 Apr;84:45-53.e1. doi: 10.1016/j.exphem.2020.02.004. Epub 2020 Mar 5.
4
Beckwith-Wiedemann Syndrome贝克威思-维德曼综合征
5
The CCND1 c.870G>A polymorphism is a risk factor for t(11;14)(q13;q32) multiple myeloma.CCND1 c.870G>A 多态性是 t(11;14)(q13;q32)多发性骨髓瘤的风险因素。
Nat Genet. 2013 May;45(5):522-525. doi: 10.1038/ng.2583. Epub 2013 Mar 17.
6
Cyclin D1 overexpression in invasive breast cancers: correlation with cyclin-dependent kinase 4 and oestrogen receptor overexpression, and lack of correlation with mitotic activity.侵袭性乳腺癌中细胞周期蛋白D1的过表达:与细胞周期蛋白依赖性激酶4及雌激素受体过表达的相关性,以及与有丝分裂活性缺乏相关性
J Cancer Res Clin Oncol. 1999 Aug-Sep;125(8-9):505-12. doi: 10.1007/s004320050309.
7
Impact of Autologous Transplantation in Patients with Multiple Myeloma with t(11;14): A Propensity-Score Matched Analysis.自体移植对伴有 t(11;14)的多发性骨髓瘤患者的影响:倾向评分匹配分析。
Clin Cancer Res. 2019 Nov 15;25(22):6781-6787. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-19-0706. Epub 2019 Sep 3.
8
NSD2 drives t(4;14) myeloma cell dependence on adenylate kinase 2 by diverting one-carbon metabolism to the epigenome.NSD2通过将一碳代谢导向表观基因组,驱动t(4;14)骨髓瘤细胞对腺苷酸激酶2的依赖。
Blood. 2024 Jul 18;144(3):283-295. doi: 10.1182/blood.2023022859.
9
Falls prevention interventions for community-dwelling older adults: systematic review and meta-analysis of benefits, harms, and patient values and preferences.社区居住的老年人跌倒预防干预措施:系统评价和荟萃分析的益处、危害以及患者的价值观和偏好。
Syst Rev. 2024 Nov 26;13(1):289. doi: 10.1186/s13643-024-02681-3.
10
Pharmacotherapy for smoking cessation: effects by subgroup defined by genetically informed biomarkers.戒烟的药物治疗:基于基因信息生物标志物定义的亚组的效果
Cochrane Database Syst Rev. 2017 Sep 8;9(9):CD011823. doi: 10.1002/14651858.CD011823.pub2.

本文引用的文献

1
Comprehensive molecular profiling of multiple myeloma identifies refined copy number and expression subtypes.全面的多发性骨髓瘤分子谱分析确定了精细的拷贝数和表达亚型。
Nat Genet. 2024 Sep;56(9):1878-1889. doi: 10.1038/s41588-024-01853-0. Epub 2024 Aug 19.
2
Gene-environment interactions in human health.人类健康中的基因-环境相互作用。
Nat Rev Genet. 2024 Nov;25(11):768-784. doi: 10.1038/s41576-024-00731-z. Epub 2024 May 28.
3
Integrated epigenetic and transcriptional single-cell analysis of t(11;14) multiple myeloma and its BCL2 dependency.
t(11;14)多发性骨髓瘤的整合表观遗传和转录单细胞分析及其 BCL2 依赖性。
Blood. 2024 Jan 4;143(1):42-56. doi: 10.1182/blood.2023020276.
4
Essential role of the Pax5 C-terminal domain in controlling B cell commitment and development.Pax5 羧基末端结构域在控制 B 细胞定型和发育中的重要作用。
J Exp Med. 2023 Dec 4;220(12). doi: 10.1084/jem.20230260. Epub 2023 Sep 19.
5
Characterization of sequence determinants of enhancer function using natural genetic variation.利用自然遗传变异对增强子功能的序列决定因素进行表征。
Elife. 2022 Aug 31;11:e76500. doi: 10.7554/eLife.76500.
6
Multiple myeloma with t(11;14): unique biology and evolving landscape.伴有t(11;14)的多发性骨髓瘤:独特生物学特性与不断演变的格局
Am J Cancer Res. 2022 Jul 15;12(7):2950-2965. eCollection 2022.
7
High-resolution simulations of chromatin folding at genomic rearrangements in malignant B cells provide mechanistic insights into proto-oncogene deregulation.高分辨率模拟恶性 B 细胞中基因组重排时的染色质折叠,为原癌基因失调控提供了机制见解。
Genome Res. 2022 Jul 27;32(7):1355-1366. doi: 10.1101/gr.276028.121.
8
Comprehensive characterization of the epigenetic landscape in Multiple Myeloma.全面描绘多发性骨髓瘤的表观遗传学特征。
Theranostics. 2022 Jan 16;12(4):1715-1729. doi: 10.7150/thno.54453. eCollection 2022.
9
Epigenomic translocation of H3K4me3 broad domains over oncogenes following hijacking of super-enhancers.表观基因组转位 H3K4me3 宽域越过癌基因,继而上调超级增强子的劫持。
Genome Res. 2022 Jul;32(7):1343-1354. doi: 10.1101/gr.276042.121. Epub 2021 Dec 21.
10
Chromatin-based, in cis and in trans regulatory rewiring underpins distinct oncogenic transcriptomes in multiple myeloma.基于染色质的顺式和反式调控重排为多发性骨髓瘤中的不同致癌转录组提供了基础。
Nat Commun. 2021 Sep 14;12(1):5450. doi: 10.1038/s41467-021-25704-2.