• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

BioNumPy: array programming for biology.

作者信息

Rand Knut Dagestad, Grytten Ivar, Pavlović Milena, Kanduri Chakravarthi, Sandve Geir Kjetil

机构信息

Biomedical Informatics research group, Department of Informatics, University of Oslo, Oslo, Norway.

Centre for Bioinformatics, University of Oslo, Oslo, Norway.

出版信息

Nat Methods. 2024 Dec;21(12):2198-2199. doi: 10.1038/s41592-024-02483-4.

DOI:10.1038/s41592-024-02483-4
PMID:39420142
Abstract
摘要

相似文献

1
BioNumPy: array programming for biology.BioNumPy:用于生物学的数组编程。
Nat Methods. 2024 Dec;21(12):2198-2199. doi: 10.1038/s41592-024-02483-4.
2
Array programming with NumPy.使用 NumPy 进行数组编程。
Nature. 2020 Sep;585(7825):357-362. doi: 10.1038/s41586-020-2649-2. Epub 2020 Sep 16.
3
Programming of optical array logic. 1: Image data processing.光学阵列逻辑编程。1:图像数据处理。
Appl Opt. 1988 Jul 15;27(14):2926-30. doi: 10.1364/AO.27.002926.
4
BioBlocks: Programming Protocols in Biology Made Easier.生物模块:让生物学中的编程协议更轻松。
ACS Synth Biol. 2017 Jul 21;6(7):1230-1232. doi: 10.1021/acssynbio.6b00304. Epub 2017 Jan 24.
5
Programming languages for synthetic biology.用于合成生物学的编程语言。
Syst Synth Biol. 2010 Dec;4(4):265-9. doi: 10.1007/s11693-011-9070-y. Epub 2011 Feb 20.
6
Integer programming-based approach to allocation of reporter genes for cell array analysis.基于整数规划的细胞阵列分析报告基因分配方法。
Int J Bioinform Res Appl. 2008;4(4):385-99. doi: 10.1504/IJBRA.2008.021201.
7
SW-ARRAY: a dynamic programming solution for the identification of copy-number changes in genomic DNA using array comparative genome hybridization data.SW-ARRAY:一种使用阵列比较基因组杂交数据识别基因组DNA中拷贝数变化的动态规划解决方案。
Nucleic Acids Res. 2005 Jun 16;33(11):3455-64. doi: 10.1093/nar/gki643. Print 2005.
8
A Parasitic Resistance-Adapted Programming Scheme for Memristor Crossbar-Based Neuromorphic Computing Systems.一种用于基于忆阻器交叉阵列的神经形态计算系统的寄生电阻自适应编程方案。
Materials (Basel). 2019 Dec 8;12(24):4097. doi: 10.3390/ma12244097.
9
Artificial metallo-DNA: a bio-inspired approach to metal array programming.人工金属-DNA:一种受生物启发的金属阵列编程方法。
Curr Opin Chem Biol. 2004 Dec;8(6):592-7. doi: 10.1016/j.cbpa.2004.09.006.
10
A next-generation dynamic programming language Julia: Its features and applications in biological science.一种下一代动态编程语言 Julia:它在生物科学中的特点和应用。
J Adv Res. 2024 Oct;64:143-154. doi: 10.1016/j.jare.2023.11.015. Epub 2023 Nov 21.

引用本文的文献

1
Analysis-ready VCF at Biobank scale using Zarr.使用Zarr在生物样本库规模上生成可供分析的VCF。
Gigascience. 2025 Jan 6;14. doi: 10.1093/gigascience/giaf049.
2
Simulation of adaptive immune receptors and repertoires with complex immune information to guide the development and benchmarking of AIRR machine learning.利用复杂免疫信息模拟适应性免疫受体和库,以指导适应性免疫受体库(AIRR)机器学习的开发和基准测试。
Nucleic Acids Res. 2025 Jan 24;53(3). doi: 10.1093/nar/gkaf025.
3
Rnalib: a Python library for custom transcriptomics analyses.Rnalib:一个用于定制转录组学分析的Python库。

本文引用的文献

1
Benchmarking of deep neural networks for predicting personal gene expression from DNA sequence highlights shortcomings.用于从DNA序列预测个人基因表达的深度神经网络基准测试凸显了不足之处。
Nat Genet. 2023 Dec;55(12):2060-2064. doi: 10.1038/s41588-023-01524-6. Epub 2023 Nov 30.
2
Array programming with NumPy.使用 NumPy 进行数组编程。
Nature. 2020 Sep;585(7825):357-362. doi: 10.1038/s41586-020-2649-2. Epub 2020 Sep 16.
3
Biopython: freely available Python tools for computational molecular biology and bioinformatics.Biopython:用于计算分子生物学和生物信息学的免费可用Python工具。
Bioinformatics. 2024 Dec 26;41(1). doi: 10.1093/bioinformatics/btae751.
Bioinformatics. 2009 Jun 1;25(11):1422-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btp163. Epub 2009 Mar 20.