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来自美国的四株A3型副肠道病毒的基因组公布

Genome Announcement of Four Parechovirus A3 Isolates from the United States of America.

作者信息

Dhar Debarpan, Ng Terry Fei Fan, Harrison Christopher J, Rhoden Eric, Mainou Bernardo A, Sasidharan Anjana, VanDonge Katelyn E, Boinpelly Varun Chandra, Selvarangan Rangaraj

机构信息

Department of Pathology and Laboratory Medicine, Emerging Infections, Children's Mercy Research Institute, Kansas City, MO 64108, USA.

Division of Viral Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA 30333, USA.

出版信息

Int J Mol Sci. 2025 May 5;26(9):4378. doi: 10.3390/ijms26094378.

DOI:10.3390/ijms26094378
PMID:40362615
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12072549/
Abstract

We report the complete genome sequences of four parechovirus-A3 (PeV-A3) isolates from Children's Mercy Kansas City (CMKC), United States of America (USA): PeV-A3-MO-12-CMKC/CSF/MO/USA/2012 (isolated in 2012 from cerebrospinal fluid), PeV-A3-8C-CMKC/CSF/MO/USA/2022/ (isolated in 2022 from cerebrospinal fluid), PeV-A3-9C-CMKC/CSF/MO/USA/2022 (isolated in 2022 from cerebrospinal fluid), and PeV-A3-11B-CMKC/Blood/MO/USA/2022 (isolated in 2022 from blood). Sequence analysis revealed multiple mutations throughout the genome of the PeV-A3 isolates in comparison to the prototypic PeV-A3 A308/99 reference sequence (AB084913). Several unique amino acid changes were observed in the PeV-A3 isolates from 2022 that were absent in the PeV-A3 isolate from 2012. Phylogenetic analysis comparison determined that the sequenced PeV-A3 isolates from 2022 cluster together as a separate clade.

摘要

我们报告了来自美国堪萨斯城儿童慈善医院（CMKC）的4株A3型细小病毒（PeV-A3）分离株的全基因组序列：PeV-A3-MO-12-CMKC/CSF/MO/USA/2012（于2012年从脑脊液中分离）、PeV-A3-8C-CMKC/CSF/MO/USA/2022/（于2022年从脑脊液中分离）、PeV-A3-9C-CMKC/CSF/MO/USA/2022（于2022年从脑脊液中分离）以及PeV-A3-11B-CMKC/Blood/MO/USA/2022（于2022年从血液中分离）。序列分析显示，与原型PeV-A3 A308/99参考序列（AB084913）相比，PeV-A3分离株的全基因组存在多个突变。在2022年的PeV-A3分离株中观察到了一些独特的氨基酸变化，而这些变化在2012年的PeV-A3分离株中不存在。系统发育分析比较确定，2022年测序的PeV-A3分离株聚集在一起形成一个单独的分支。

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