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[从氨基酸序列预测球状蛋白质的结构类别]

[Prediction of the structural class of globular proteins from their amino acid sequence].

作者信息

Barkovskiĭ E V

出版信息

Biofizika. 1985 Sep-Oct;30(5):782-5.

PMID:4052478
Abstract

Two-dimensional representation of consequence of 32 proteins with known three-dimensional structure has been obtained on 20 X 20 matrix of the distribution of amino acid pairs (nearest neighbours). Prediction algorithm of the structural class of globular proteins has been worked out on the basis of the comparison of 20 X 20 matrix of the distribution of amino acid pairs for the proteins of different structural classes. The accuracy of structural class predictions of 32 proteins has been carried out (all the proteins are taken from numerous ones used to obtain the algorithm).

摘要

在20×20的氨基酸对(最近邻)分布矩阵上获得了32种具有已知三维结构的蛋白质结果的二维表示。基于对不同结构类别的蛋白质的20×20氨基酸对分布矩阵的比较,制定了球状蛋白质结构类别的预测算法。对32种蛋白质的结构类别预测准确性进行了检验(所有蛋白质均取自用于获得该算法的众多蛋白质)。

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