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一种跳甲(奥贝,1843年)的基因组序列。

The genome sequence of a flea beetle, Aubé, 1843.

作者信息

Paul John, Crowley Liam M

机构信息

Modernising Medical Microbiology, University of Oxford, Oxford, England, UK.

Department of Biology, University of Oxford, Oxford, England, UK.

出版信息

Wellcome Open Res. 2025 Jun 2;10:297. doi: 10.12688/wellcomeopenres.24269.1. eCollection 2025.

DOI:10.12688/wellcomeopenres.24269.1
PMID:40931741
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12417985/
Abstract

We present a genome assembly from a female specimen of (flea beetle; Arthropoda; Insecta; Coleoptera; Chrysomelidae). This was a triploid specimen and one subgenome was assembled. The genome sequence has a total length of 1,003.51 megabases. Most of the assembly (82.29%) is scaffolded into 12 chromosomal pseudomolecules, including the X sex chromosome. The mitochondrial genome has also been assembled, with a length of 18.39 kilobases. Gene annotation of this assembly on Ensembl identified 18,969 protein-coding genes.

摘要

我们展示了一种叶甲(跳蚤甲虫;节肢动物门;昆虫纲;鞘翅目;叶甲科)雌性标本的基因组组装结果。这是一个三倍体标本,其中一个亚基因组被组装出来。基因组序列全长1003.51兆碱基。大部分组装序列(82.29%)被构建成12条染色体假分子,包括X性染色体。线粒体基因组也已被组装出来,长度为18.39千碱基。在Ensembl上对该组装序列进行的基因注释识别出18969个蛋白质编码基因。

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